| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | W3110S.gb | 4,290,982 | G→A | intergenic (‑19/‑374) | acs ← / → nrfA | bifunctional acetyl‑CoA synthetase and propionyl‑CoA synthetase/nitrite reductase, formate‑dependent, cytochrome |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | W3110S.gb | 4,290,982 | 0 | G | A | 100.0% | 1011.6 / NA | 348 | intergenic (‑19/‑374) | acs/nrfA | bifunctional acetyl‑CoA synthetase and propionyl‑CoA synthetase/nitrite reductase, formate‑dependent, cytochrome |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (0/348); total (0/348) | |||||||||||
Only 100 of 348 total aligned reads displayed.
TGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAA > W3110S.gb/4290944‑4291005 | tgtTTGTGAATTTGACTCATTCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1228640/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATat < 1:486159/62‑2 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:395966/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:544087/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:537801/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:522266/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:501761/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:454719/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:449218/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:444952/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:435084/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:421224/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:41499/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:560846/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:38425/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:358183/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:352257/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:331043/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:317570/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:29372/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:282205/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:255396/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:245331/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1004862/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:216561/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:765037/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:974095/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:953896/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:939452/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:925291/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:89450/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:882579/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:869332/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:854826/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:838872/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:797868/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:782753/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:237027/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:739855/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:717091/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:691480/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:682268/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:657876/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:644023/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:62986/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:618841/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:601291/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:570098/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1165000/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1358061/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1336903/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:199150/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:131126/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1295031/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1277490/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1260303/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1253229/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1247041/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1192314/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1171267/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1334019/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1144137/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1131472/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1116860/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:109526/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1089423/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1073833/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1069362/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1049678/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1047090/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1033709/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1014835/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1378751/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:194643/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:179122/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1637947/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1618315/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1607527/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1598586/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1583446/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:155440/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1542714/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1527184/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1500811/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1453421/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1429916/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1428410/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1398707/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1387536/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1371977/62‑1 (MQ=255)tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAACATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:702185/62‑1 (MQ=255)tgtTTGCGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1463937/62‑1 (MQ=255) gtTTGTGAATTTGACTCATTCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:827879/61‑1 (MQ=255) gtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:110595/61‑1 (MQ=255) gtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1590652/61‑1 (MQ=255) tgtgAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:669129/58‑1 (MQ=255) gAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:756635/55‑1 (MQ=255) gacTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:171824/47‑1 (MQ=255) tGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:465057/43‑1 (MQ=255) ttGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1495149/38‑1 (MQ=255) | TGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAA > W3110S.gb/4290944‑4291005 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |