Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 4,329,498 C→T P116P (CCG→CCA)  phnC ← phosphonate/organophosphate ester transporter subunit

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb4,329,4980CT100.0% 533.6 / NA 187P116P (CCG→CCA) phnCphosphonate/organophosphate ester transporter subunit
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (0/187);  total (0/187)

Only 100 of 187 total aligned reads displayed.

GCTGTTTCTGCTCGCCGGTGAACCAGCTAAAACAGGTGCGCCAGAACGGCGTGCTGCCGAGC  >  W3110S.gb/4329452‑4329513
                                              |               
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 cTGTTTCTGCTCGCGGGTGAAGTAGCTAAAACAGGTTCGCCAGAATGGCGTGCTGCCGAgc  <  1:758754/61‑1 (MQ=255)
 cTGTTTCTGCTCGCGGGTGAAGTAGCTAAAACAGGTTCGCCAGAATGGCGTGCTGCCGAgc  <  1:1357725/61‑1 (MQ=255)
      tCTGCTCGCGGGTGAAGTAGCTAAAACAGGTTCGCCAGAATGGCGTGCTGCCGAgc  <  1:122276/56‑1 (MQ=255)
                                              |               
GCTGTTTCTGCTCGCCGGTGAACCAGCTAAAACAGGTGCGCCAGAACGGCGTGCTGCCGAGC  >  W3110S.gb/4329452‑4329513

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑