Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 4,338,505 T→G A42A (GCA→GCC)  basR ← DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with BasS

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb4,338,5050TG100.0% 665.6 / NA 225A42A (GCA→GCC) basRDNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with BasS
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base G (225/0);  total (225/0)

Only 100 of 225 total aligned reads displayed.

GCTGTAATGACCTGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTTGTCACGCTATCGCACG  >  W3110S.gb/4338493‑4338554
            |                                                 
gCTGTAATGACCGGCCTCCAGGCTTTGTTCCGCCATcc                          >  1:1042945/1‑38 (MQ=38)
gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATc                           >  1:1112251/1‑37 (MQ=255)
gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCcgc                        >  1:645813/1‑40 (MQ=255)
gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCcgc                        >  1:821798/1‑40 (MQ=255)
gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGGCATCGCAcg  >  1:60760/1‑62 (MQ=255)
gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCCcg  >  1:1391230/1‑62 (MQ=255)
gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAcg  >  1:413917/1‑62 (MQ=255)
gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAcg  >  1:561552/1‑62 (MQ=255)
gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAcg  >  1:542214/1‑62 (MQ=255)
gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAcg  >  1:53315/1‑62 (MQ=255)
gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAcg  >  1:511139/1‑62 (MQ=255)
gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAcg  >  1:460215/1‑62 (MQ=255)
gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAcg  >  1:456154/1‑62 (MQ=255)
gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAcg  >  1:450588/1‑62 (MQ=255)
gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAcg  >  1:446662/1‑62 (MQ=255)
gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAcg  >  1:435534/1‑62 (MQ=255)
gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAcg  >  1:420810/1‑62 (MQ=255)
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gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAcg  >  1:410531/1‑62 (MQ=255)
gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAcg  >  1:393529/1‑62 (MQ=255)
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gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAcg  >  1:617120/1‑62 (MQ=255)
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gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAcg  >  1:1094750/1‑62 (MQ=255)
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gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAc   >  1:1140968/1‑61 (MQ=255)
gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAc   >  1:498881/1‑61 (MQ=255)
gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAc   >  1:861226/1‑61 (MQ=255)
gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAc   >  1:1491221/1‑61 (MQ=255)
gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAc   >  1:288388/1‑61 (MQ=255)
gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCAGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAcg  >  1:971806/1‑62 (MQ=255)
            |                                                 
GCTGTAATGACCTGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTTGTCACGCTATCGCACG  >  W3110S.gb/4338493‑4338554

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑