Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 4,338,546 T→C S29G (AGC→GGC)  basR ← DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with BasS

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb4,338,5460TC100.0% 627.0 / NA 216S29G (AGC→GGC) basRDNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with BasS
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (216/0);  total (216/0)

Only 100 of 216 total aligned reads displayed.

GCTGTAATGACCTGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTTGTCACGCTATCGCACG  >  W3110S.gb/4338493‑4338554
                                                     |        
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gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAcg  >  1:453422/1‑62 (MQ=255)
gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAcg  >  1:577823/1‑62 (MQ=255)
gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAcg  >  1:564125/1‑62 (MQ=255)
gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAcg  >  1:561552/1‑62 (MQ=255)
gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAcg  >  1:54430/1‑62 (MQ=255)
gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAcg  >  1:53644/1‑62 (MQ=255)
gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAcg  >  1:529542/1‑62 (MQ=255)
gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAcg  >  1:508560/1‑62 (MQ=255)
gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAcg  >  1:476293/1‑62 (MQ=255)
gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAcg  >  1:460099/1‑62 (MQ=255)
gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAcg  >  1:308055/1‑62 (MQ=255)
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gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAcg  >  1:438351/1‑62 (MQ=255)
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gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAc   >  1:402311/1‑61 (MQ=255)
gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAc   >  1:288388/1‑61 (MQ=255)
gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAc   >  1:1491221/1‑61 (MQ=255)
                                                     |        
GCTGTAATGACCTGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTTGTCACGCTATCGCACG  >  W3110S.gb/4338493‑4338554

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑