Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 4,374,990 C→T L35L (CTG→CTA)  yjeH ← predicted transporter

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb4,374,9900CT100.0% 697.4 / NA 240L35L (CTG→CTA) yjeHpredicted transporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (240/0);  total (240/0)

Only 100 of 240 total aligned reads displayed.

GGCCACGCCCACAGGCTGTTATTGCCCGCTACCAGCGCAGCTAACGCAGG  >  W3110S.gb/4374958‑4375007
                                |                 
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ggCCACGCCCACAGGCTGTTATTGCCTGCTACTAGCGCAGCTAACGCAgg  >  1:554015/1‑50 (MQ=255)
ggCCACGCCCACAGGCTGTTATTGCCTGCTACTAGCGCAGCTAACGCAgg  >  1:542302/1‑50 (MQ=255)
ggCCACGCCCACAGGCTGTTATTGCCTGCTACTAGCGCAGCTAACGCAgg  >  1:537860/1‑50 (MQ=255)
ggCCACGCCCACAGGCTGTTATTGCCTGCTACTAGCGCAGCTAACGCAgg  >  1:533563/1‑50 (MQ=255)
ggCCACGCCCACAGGCTGTTATTGCCTGCTACTAGCGCAGCTAACGCAgg  >  1:517491/1‑50 (MQ=255)
ggCCACGCCCACAGGCTGTTATTGCCTGCTACTAGCGCAGCTAACGCAgg  >  1:498690/1‑50 (MQ=255)
ggCCACGCCCACAGGCTGTTATTGCCTGCTACTAGCGCAGCTAACGCAgg  >  1:488710/1‑50 (MQ=255)
ggCCACGCCCACAGGCTGTTATTGCCTGCTACTAGCGCAGCTAACGCAgg  >  1:474133/1‑50 (MQ=255)
ggCCACGCCCACAGGCTGTTATTGCCTGCTACTAGCGCAGCTAACGCAgg  >  1:467708/1‑50 (MQ=255)
ggCCACGCCCACAGGCTGTTATTGCCTGCTACTAGCGCAGCTAACGCAgg  >  1:461845/1‑50 (MQ=255)
ggCCACGCCCACAGGCTGTTATTGCCTGCTACTAGCGCAGCTAACGCAgg  >  1:632442/1‑50 (MQ=255)
ggCCACGCCCACAGGCTGTTATTGCCTGCTACTAGCGCAGCTAACGCAgg  >  1:439636/1‑50 (MQ=255)
ggCCACGCCCACAGGCTGTTATTGCCTGCTACTAGCGCAGCTAACGCAgg  >  1:426489/1‑50 (MQ=255)
ggCCACGCCCACAGGCTGTTATTGCCTGCTACTAGCGCAGCTAACGCAgg  >  1:404396/1‑50 (MQ=255)
ggCCACGCCCACAGGCTGTTATTGCCTGCTACTAGCGCAGCTAACGCAgg  >  1:378895/1‑50 (MQ=255)
ggCCACGCCCACAGGCTGTTATTGCCTGCTACTAGCGCAGCTAACGCAgg  >  1:374091/1‑50 (MQ=255)
ggCCACGCCCACAGGCTGTTATTGCCTGCTACTAGCGCAGCTAACGCAgg  >  1:365673/1‑50 (MQ=255)
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ggCCACGCCCACAGGCTGTTATTGCCTGCTACTAGCGCAGCTAACGCAgg  >  1:331981/1‑50 (MQ=255)
ggCCACGCCCACAGGCTGTTATTGCCTGCTACTAGCGCAGCTAACGCAgg  >  1:798345/1‑50 (MQ=255)
ggCCACGCCCACAGGCTGTTATTGCCTGCTACTAGCGCAGCTAACGCAgg  >  1:977844/1‑50 (MQ=255)
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ggCCACGCCCACAGGCTGTTATTGCCTGCTACTAGCGCAGCTAACGCAgg  >  1:883539/1‑50 (MQ=255)
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ggCCACGCCCACAGGCTGTTATTGCCTGCTACTAGCGCAGCTAACGCAgg  >  1:1283275/1‑50 (MQ=255)
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ggCCACGCCCACAGGCTGTTATTGCCTGCTACTAGCGCAGCTAACGCAg   >  1:1585877/1‑49 (MQ=255)
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ggCCACGCACACAGGCTGTTATTGCCTGCTACTAGCGCAGCTAACGCAgg  >  1:83593/1‑50 (MQ=255)
                                |                 
GGCCACGCCCACAGGCTGTTATTGCCCGCTACCAGCGCAGCTAACGCAGG  >  W3110S.gb/4374958‑4375007

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑