Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 4,408,293 C→T Y104Y (TAC→TAT)  hflC → modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb4,408,2930CT100.0% 436.0 / NA 152Y104Y (TAC→TAT) hflCmodulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (0/152);  total (0/152)

Only 100 of 152 total aligned reads displayed.

TCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTACCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCG  >  W3110S.gb/4408259‑4408320
                                  |                           
tgaaaTGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:514991/60‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTct  <  1:851937/62‑2 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:529128/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:686574/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:672753/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:653641/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:645228/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:645116/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:616876/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:597666/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:597302/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:572449/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:570850/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:553382/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:538284/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:69688/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:470504/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:445006/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:404795/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:401370/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:39882/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:395145/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:383354/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:369824/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:359334/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:81996/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:974394/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:95007/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:948362/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:947045/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:901160/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:891565/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:856525/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:854917/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:83894/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:834259/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:819991/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1034276/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:806264/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:759321/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:749615/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:746765/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:733645/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:732656/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:722157/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:710201/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:708904/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:700692/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1214953/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:336245/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1335258/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:130630/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1305502/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1287100/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1280837/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1274506/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1274171/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1260111/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1249763/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1239123/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1231631/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1365019/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1211209/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1184804/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1151305/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1135525/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1115479/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1092361/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1091236/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1077012/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1060319/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1043407/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1039732/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1018788/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1592168/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:276250/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:26028/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:187798/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:17399/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1646575/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1629640/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1623826/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1603258/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1574050/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:15721/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1534957/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1522240/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1519118/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1488778/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1485630/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1443143/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1419078/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGAAATTTCg  <  1:38315/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACCGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:247591/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCAGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:514741/62‑1 (MQ=255)
tCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGACGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:724558/62‑1 (MQ=255)
 cAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1382895/61‑1 (MQ=255)
   aaTGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:614200/59‑1 (MQ=255)
           aTCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:520640/51‑1 (MQ=255)
           aTCAGCGATTTCAGCCGTTACTATCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCg  <  1:1516129/51‑1 (MQ=255)
                                  |                           
TCAAATGGCGCATCAGCGATTTCAGCCGTTACTACCTGGCAACGGGTGGTGGCGACATTTCG  >  W3110S.gb/4408259‑4408320

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑