Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 530,395 G→T P19H (CCC→CAC)  ybbB ← tRNA 2‑selenouridine synthase, selenophosphate‑dependent

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb530,3950GT100.0% 296.0 / NA 103P19H (CCC→CAC) ybbBtRNA 2‑selenouridine synthase, selenophosphate‑dependent
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base T (103/0);  total (103/0)

Only 100 of 103 total aligned reads displayed.

GCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGGGCGT  >  W3110S.gb/530360‑530399
                                   |    
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGTACATCAATAATGTGCGt  >  1:1463367/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCg   >  1:615076/1‑39 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCg   >  1:881181/1‑39 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCg   >  1:1159488/1‑39 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCg   >  1:777399/1‑39 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:50579/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:6218/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:611952/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:608895/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:604476/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:601258/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:565552/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:53739/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:535137/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:529468/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:520063/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:629452/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:503794/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:492573/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:482887/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:482757/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:479795/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:465966/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:424415/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:414071/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:389602/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:380202/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:815463/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:988969/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:980030/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:976741/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:965362/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:954328/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:946016/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:928436/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:927716/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:864716/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:854234/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:83699/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:62257/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:788367/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:745148/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:716505/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:712183/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:704141/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:691106/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:667863/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:663477/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:657838/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:370207/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:62278/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1178153/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1385985/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1342240/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1335071/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1324246/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1321508/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1313297/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1313238/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1192481/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1188342/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1178554/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1178508/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1388984/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1177784/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1145274/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1143332/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1113700/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1111411/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1088352/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:10718/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1060376/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1046825/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1040073/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1035501/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1616391/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:35116/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:349119/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:321437/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:319593/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:280435/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:251919/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:215245/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:19262/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1645063/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1634135/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1627977/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:162311/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1033347/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1573873/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1572410/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:156504/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1519841/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1518342/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1495457/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1466872/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1449135/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1446505/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:1434528/1‑40 (MQ=255)
gCTCAAACTAGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGTGCGt  >  1:660709/1‑40 (MQ=255)
                                   |    
GCTCAAACTCGATAGGGGCGCGAACATCAATAATGGGCGT  >  W3110S.gb/530360‑530399

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑