Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 756,631 C→T H101H (CAC→CAT)  sdhA → succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb756,6310CT100.0% 417.7 / NA 145H101H (CAC→CAT) sdhAsuccinate dehydrogenase, flavoprotein subunit
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (145/0);  total (145/0)

Only 100 of 145 total aligned reads displayed.

CTGGAACTCGAACACATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTCGATGATGGTCGTATCTATCAACG  >  W3110S.gb/756617‑756678
              |                                               
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCaa    >  1:1356172/1‑60 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAAc   >  1:22910/1‑61 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:314128/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:462339/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:435438/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:42511/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:413749/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:40624/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:392144/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:367010/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:359820/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:343891/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:335500/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:323763/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:464271/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:310420/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:291364/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:288025/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:27145/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:266708/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:249851/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:24184/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:224343/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:210487/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:20877/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:732276/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:969921/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:968178/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:94959/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:927277/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:925963/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:912842/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:881652/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:879541/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:860521/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:852985/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:784457/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:782812/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1022538/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:725761/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:711786/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:68178/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:680602/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:667404/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:599893/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:595128/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:544933/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:530708/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:517633/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:51419/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1132236/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1301941/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1297634/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1274734/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1261746/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1217475/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1208933/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1191207/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1181463/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1159180/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1145833/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1132290/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:194676/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:112996/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1109231/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1103052/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1088275/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1081458/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1069083/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1067055/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1047092/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1045908/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1026901/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1008605/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1322986/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:204014/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:193453/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:180226/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1651926/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1644920/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1626088/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1613916/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1611079/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1609083/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1589705/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1550779/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1516716/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1514980/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1454084/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1452943/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1419350/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1416994/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1404650/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1382953/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1370093/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1359671/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1324991/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:1302766/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTATTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:7116/1‑62 (MQ=255)
ctggaactggaaCATATGGGCCGGCCGTTCTCGCGTCTTGATGATGGTCGTATCTATCAACg  >  1:979857/1‑62 (MQ=255)
              |                                               
CTGGAACTCGAACACATGGGCCTGCCGTTCTCGCGTCTCGATGATGGTCGTATCTATCAACG  >  W3110S.gb/756617‑756678

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑