| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | W3110S.gb | 797,089 | T→C | T38T (ACT→ACC) | modC → | molybdate transporter subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | W3110S.gb | 797,089 | 0 | T | C | 91.7% | 535.7 / 20.9 | 217 | T38T (ACT→ACC) | modC | molybdate transporter subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (18/0); new base C (0/199); total (18/199) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.16e-26 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 217 total aligned reads displayed.
AATGGCATCACTGCTATCTTTGGCGTCTCCGGTGCCGGAAAAACTTCGCTGATTAACGCCATCAGTGGACTGACGCGCCCGCAAAAA > W3110S.gb/797045‑797131 | aaTGGCATCACCTCTATTTTTGGTGTCTCTGGTGCCGGAAAAACCTCGCTGATTAACGCCAt < 1:305623/62‑1 (MQ=255)aaTGGCATCACCGCTATTTTTGGTGTCTCTGGTGCCGGAAAAACCTCGCTGATTAACGCCAt < 1:395808/62‑1 (MQ=255)aaTGGCATCACCGCTATTTTTGGTGTCTCTGGTGCCGGAAAAACCTCGCTGATTAACGCCAt < 1:543083/62‑1 (MQ=255)aaTGGCATCACCGCTATTTTTGGTGTCTCTGGTGCCGGAAAAACCTCGCTGATTAACGCCAt < 1:52506/62‑1 (MQ=255)aaTGGCATCACCGCTATTTTTGGTGTCTCTGGTGCCGGAAAAACCTCGCTGATTAACGCCAt < 1:515772/62‑1 (MQ=255)aaTGGCATCACCGCTATTTTTGGTGTCTCTGGTGCCGGAAAAACCTCGCTGATTAACGCCAt < 1:504881/62‑1 (MQ=255)aaTGGCATCACCGCTATTTTTGGTGTCTCTGGTGCCGGAAAAACCTCGCTGATTAACGCCAt < 1:494146/62‑1 (MQ=255)aaTGGCATCACCGCTATTTTTGGTGTCTCTGGTGCCGGAAAAACCTCGCTGATTAACGCCAt < 1:468666/62‑1 (MQ=255)aaTGGCATCACCGCTATTTTTGGTGTCTCTGGTGCCGGAAAAACCTCGCTGATTAACGCCAt < 1:464953/62‑1 (MQ=255)aaTGGCATCACCGCTATTTTTGGTGTCTCTGGTGCCGGAAAAACCTCGCTGATTAACGCCAt < 1:43468/62‑1 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tctcCGGTGCCGGAAAAACTTCGCTGATTAACGCCATCAGTGGACTGACGCGCCCGCaaaaa > 1:984607/1‑62 (MQ=255) tctcCGGTGCCGGAAAAACTTCGCTGATTAACGCCATCAGTGGACTGACGCGCCCGCaaaa > 1:251599/1‑61 (MQ=255) | AATGGCATCACTGCTATCTTTGGCGTCTCCGGTGCCGGAAAAACTTCGCTGATTAACGCCATCAGTGGACTGACGCGCCCGCAAAAA > W3110S.gb/797045‑797131 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |