Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 901,642 A→G Y105Y (TAT→TAC)  artM ← arginine transporter subunit

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb901,6420AG98.9% 263.1 / NA 91Y105Y (TAT→TAC) artMarginine transporter subunit
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  major base G (90/0);  minor base C (1/0);  total (91/0)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

AACAGCTGCGTGGTATACGCCGCACTATTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACGGT  >  W3110S.gb/901628‑901690
              |                                                
aaCAGCTGGGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:136462/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATACCCACgg   >  1:239932/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAAc        >  1:846737/1‑57 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCAc     >  1:439194/1‑60 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:375559/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:499958/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:499043/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:45444/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:432066/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:408714/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:401041/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:383939/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:382913/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:549158/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:350853/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:296099/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:295404/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:281211/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:266799/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:242351/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:1033445/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:165421/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:777553/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:962061/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:951419/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:886131/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:863331/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:862337/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:845646/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:819271/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:786220/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:781609/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:518530/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:770448/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:767734/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:744572/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:658452/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:628812/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:570156/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:565458/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:561848/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:19932/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:1198812/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:1458070/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:1456135/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:1424035/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:1422642/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:1400914/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:1390960/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:1348507/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:1334419/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:1245410/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:1241190/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:1620835/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:1196487/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:1182178/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:1153626/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:1130018/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:1125894/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:1122756/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:1120375/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:110654/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:1064627/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:1572859/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:1638062/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:1605488/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:1601740/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:1587658/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:1585753/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:1585340/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:1496088/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:1559147/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:1553796/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:155244/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:1523025/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:1515376/1‑62 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACg    >  1:415444/1‑61 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACg    >  1:1075011/1‑61 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACg    >  1:1089038/1‑61 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACg    >  1:866966/1‑61 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACg    >  1:196431/1‑61 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACg    >  1:493386/1‑61 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACg    >  1:1438666/1‑61 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACg    >  1:1599912/1‑61 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACg    >  1:1185750/1‑61 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACg    >  1:1396909/1‑61 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACg    >  1:335843/1‑61 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACg    >  1:357462/1‑61 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACg    >  1:368764/1‑61 (MQ=255)
aaCAGCTGCGTGGTCTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACgg   >  1:852402/1‑62 (MQ=255)
 aCAGCTGCGTGGTGTACGCCGCACTGTTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACGGt  >  1:1567728/1‑62 (MQ=255)
              |                                                
AACAGCTGCGTGGTATACGCCGCACTATTCAGCGACAACGCAATCAGCGCACATAACCACGGT  >  W3110S.gb/901628‑901690

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑