Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,948,303 2 bp→CT coding (494‑495/2340 nt) bcsB → regulator of cellulose synthase, cyclic di‑GMP binding

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,948,3030GC100.0% 596.2 / NA 204S165T (AGC→ACT) bcsBregulator of cellulose synthase, cyclic di‑GMP binding
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base C (0/204);  total (0/204)
*W3110S.gb3,948,3040CT100.0% 580.4 / NA 204S165T (AGC→ACT) bcsBregulator of cellulose synthase, cyclic di‑GMP binding
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (0/204);  total (0/204)

Only 100 of 204 total aligned reads displayed.

AACCCACTGTTTATTAGCGACTTCAACCGTGTACGGCTGGAGTTTGTCGGCCAT  >  W3110S.gb/3948287‑3948340
                ||                                    
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aaCCCGCTGTTTATTACTGATTTCAACCGTGTGCGGCTGGAGTTTGTCGGCCAt  <  1:1041661/54‑1 (MQ=37)
aaCCCGCTGTTTATTACTGATTTCAACCGTGTGCGGCTGGAGTTTGTCGGCCAt  <  1:1039215/54‑1 (MQ=37)
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aaCCCGCTGTTTATTACTGATTTCAACCGTGTGCGGCTGGAGTTTGTCGGCCAt  <  1:1371715/54‑1 (MQ=37)
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 aCCCGCTGTTTATTACTGATTTCAACCGTGTGCGGCTGGAGTTTGTCGGCCAt  <  1:1162982/53‑1 (MQ=25)
 aCCCGCTGTTTATTACTGATTTCAACCGTGTGCGGCTGGAGTTTGTCGGCCAt  <  1:292758/53‑1 (MQ=25)
       tGTTTATTACTGATTTCAACCGTGTGCGGCTGGAGTTTGTCGGCCAt  <  1:1396499/47‑1 (MQ=25)
                ||                                    
AACCCACTGTTTATTAGCGACTTCAACCGTGTACGGCTGGAGTTTGTCGGCCAT  >  W3110S.gb/3948287‑3948340

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑