Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 4,338,538 2 bp→GC coding (92‑93/669 nt) basR ← DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with BasS

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb4,338,5380TG100.0% 640.3 / NA 216T31S (ACA→AGC) basRDNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with BasS
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base G (216/0);  total (216/0)
*W3110S.gb4,338,5390GC100.0% 625.8 / NA 216T31S (ACA→AGC) basRDNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with BasS
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base C (216/0);  total (216/0)

Only 100 of 216 total aligned reads displayed.

GCTGTAATGACCTGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTTGTCACGCTATCGCACG  >  W3110S.gb/4338493‑4338554
                                             ||               
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gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAcg  >  1:564125/1‑62 (MQ=255)
gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAcg  >  1:561552/1‑62 (MQ=255)
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gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAc   >  1:288388/1‑61 (MQ=255)
gCTGTAATGACCGGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTGCTCACGCCATCGCAc   >  1:1491221/1‑61 (MQ=255)
                                             ||               
GCTGTAATGACCTGCCTCAAGGCTTTGTTCCGCCATCCGCGCGGTTGTCACGCTATCGCACG  >  W3110S.gb/4338493‑4338554

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑