| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 225915 | NA (NA) | 3 (0.110) | 3/84 | NT | NA | noncoding (157/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA |
| ? | W3110S.gb | = 225926 | NA (NA) | noncoding (168/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA | |||||
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
GGTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > W3110S.gb/225838‑225915‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcattaacCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTATA < W3110S.gb/225926‑225858 GGTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT > 1:2252618/1‑71GGTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT < 1:1458645/71‑1 GTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT > 1:1552332/1‑70 GTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT > 1:1490589/1‑70 GTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT > 1:2541068/1‑70 GTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT > 1:1329833/1‑70 TAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCA < 1:1346153/71‑1 AAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT > 1:812975/1‑71 AAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT > 1:1196113/1‑71 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:2250750/71‑1 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCAAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:952248/71‑1 GGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTA < 1:172924/71‑1 GGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:1303290/70‑1 GGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT > 1:111118/1‑70 GGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCAACACACTATCATTA < 1:1510256/71‑1 GTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATC < 1:1415477/66‑1 TGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC > 1:1847073/1‑71 ATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:2881442/66‑1 AACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTA < 1:1261694/62‑1 AACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT < 1:1918360/57‑1 GTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:1243029/57‑1 TATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:1063494/55‑1 TAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC > 1:333551/1‑56 TAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:731754/53‑1 GGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA > 1:265144/1‑50 GCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:1108749/47‑1 GATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA > 1:3047766/1‑47 ATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTTTCATT < 1:56960/44‑1 ATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:2122825/44‑1 ATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCA > 1:288180/1‑42 TTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT > 1:1400116/1‑41 TCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA > 1:1019202/1‑43 CGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATC > 1:1662340/1‑36 AATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAG > 1:2795282/1‑52 GGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC > 1:312506/1‑36 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCG > 1:1256394/1‑71 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCG > 1:689876/1‑71 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCG > 1:825145/1‑71 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCG > 1:2054839/1‑71 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAAT > 1:2259093/1‑66 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGG < 1:51867/62‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTC > 1:2482430/1‑60 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTG < 1:782408/47‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:2964963/1‑40 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGA < 1:90116/38‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGA < 1:2568876/38‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTC > 1:2299111/1‑36 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCTAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG > 1:2074908/1‑71 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG > 1:809285/1‑71 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG > 1:2732264/1‑71 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG > 1:2410889/1‑71 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATC > 1:2697070/1‑66 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTC > 1:3070112/1‑59 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTC > 1:1428513/1‑59 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATT > 1:2991351/1‑58 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGA < 1:1847193/37‑1 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTC > 1:2879770/1‑35 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT > 1:1598268/1‑71 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT > 1:266945/1‑71 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT < 1:2365690/71‑1 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG < 1:534280/70‑1 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG < 1:513661/70‑1 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG < 1:2020841/70‑1 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAA > 1:1228417/1‑62 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGG > 1:310820/1‑47 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGG > 1:1578356/1‑47 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGG > 1:2321101/1‑47 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:1788748/1‑38 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCG > 1:646664/1‑35 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGACGAAAC > 1:924065/1‑39 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTT < 1:2479851/71‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAAT > 1:1476805/1‑63 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCC > 1:3158467/1‑51 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACT < 1:2608936/43‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA < 1:1012236/39‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA < 1:2868661/39‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAAC < 1:1958037/38‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAAC < 1:1960436/38‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:498925/1‑37 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA < 1:1462270/37‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGA < 1:85715/35‑1 TTAACCTATGGATACAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCG > 1:152070/1‑68 TAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTA > 1:1352095/1‑71 TAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTA > 1:1117123/1‑71 TAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTA > 1:2738555/1‑71 TAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTA > 1:2283937/1‑71 TAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA > 1:3045623/1‑38 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAAT > 1:2693572/1‑61 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA > 1:1899208/1‑37 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA > 1:1711217/1‑37 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:610114/1‑35 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:2651546/1‑35 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCG‑AACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTAT > 1:1172118/1‑70 ACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTAT < 1:1528498/70‑1 ACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTAT > 1:1170771/1‑70 ACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTAT < 1:2491505/70‑1 ACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTAT > 1:2868072/1‑70 ACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTAT > 1:3149579/1‑70 ACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTAT < 1:3097384/70‑1 ACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCG > 1:502094/1‑65 GGTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > W3110S.gb/225838‑225915‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcattaacCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTATA < W3110S.gb/225926‑225858 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |