| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 2728864 | NA (NA) | 5 (0.100) | 4/94 | NT | NA | noncoding (950/1542 nt) | rrsG | 16S ribosomal RNA |
| ? | W3110S.gb | = 2728876 | NA (NA) | noncoding (938/1542 nt) | rrsG | 16S ribosomal RNA | |||||
ATTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > W3110S.gb/2728791‑2728864‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cacaAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACGGAAGT < W3110S.gb/2728876‑2728807 ATTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACC < 1:4026992/71‑1ATTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACC < 1:3914580/71‑1ATTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACC < 1:1474654/71‑1 TTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCA > 1:983932/1‑71 TTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCA > 1:488553/1‑71 TTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCA < 1:1163896/71‑1 TTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCA < 1:4862462/71‑1 TTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCA > 1:3519672/1‑71 TTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCA < 1:2722597/71‑1 TTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACC < 1:3099931/70‑1 TCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCA > 1:1864798/1‑70 TCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCA > 1:3526520/1‑70 TCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCA > 1:536744/1‑70 TCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCA > 1:233953/1‑70 TCTCATCTCTGAAAACTTACGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCA > 1:896021/1‑70 CTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACA > 1:805681/1‑71 CTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCAC > 1:3202356/1‑70 ATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACA < 1:3754118/68‑1 TCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCAC > 1:4030572/1‑66 TGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACAAGCGGTG > 1:3207014/1‑70 GAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCA > 1:2646139/1‑60 AAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACC > 1:1013123/1‑58 AAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACC > 1:1019197/1‑58 TTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCAC < 1:3072154/55‑1 TCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACA < 1:2446587/55‑1 TCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACA < 1:4225500/55‑1 CCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACAAGCGGTGGAGCATGT < 1:4565293/69‑1 CCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACA > 1:2082965/1‑54 CCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACA > 1:2147580/1‑54 CCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCAC > 1:2527232/1‑53 GATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTA < 1:446566/70‑1 TGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACA > 1:1493549/1‑47 TCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCAC > 1:3107659/1‑44 TCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCA < 1:2183612/43‑1 AAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACC < 1:4231048/40‑1 AGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAACCCACAAGCGGTGGAGCATGT < 1:4724942/57‑1 ACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCA > 1:1815378/1‑38 CAGGTAAGGTTCTTCGCGATGCATCGAATTAAACCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAA < 1:3866883/60‑1 GTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACA < 1:2330591/35‑1 ctCAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACGGA < 1:2911709/69‑1 CACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACGGA < 1:3640830/71‑1 CACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACGG > 1:4172011/1‑70 CACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACGG > 1:2955002/1‑70 CACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGA > 1:2862090/1‑61 CACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTG > 1:3902868/1‑54 CACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTAC > 1:2602615/1‑51 CACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTAC > 1:703737/1‑51 CACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAA > 1:2528656/1‑36 CACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTAGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATC < 1:2628119/65‑1 ACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACGG > 1:2111167/1‑69 ACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACGG > 1:1137979/1‑69 ACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACGG > 1:126700/1‑69 ACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACGG > 1:2139939/1‑69 ACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACGG > 1:4080655/1‑69 ACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACGG > 1:4593567/1‑69 ACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGAC > 1:4878069/1‑61 ACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGG < 1:2517309/54‑1 ACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACC > 1:3189354/1‑51 ACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAAC > 1:367072/1‑45 CAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACGGAAG < 1:1987165/71‑1 CAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACGGAAG > 1:1399860/1‑71 CAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTT < 1:3413292/57‑1 CAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACC < 1:1173736/50‑1 CAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACC < 1:2969518/50‑1 CAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACC < 1:2481221/50‑1 AAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACGGAAGT > 1:4830077/1‑71 AAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACGGAAGT > 1:4924325/1‑71 AAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACGGAAGT > 1:650277/1‑71 AAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGA > 1:260501/1‑58 AAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCT < 1:2036258/55‑1 AAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTT < 1:3435735/46‑1 ATTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > W3110S.gb/2728791‑2728864‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cacaAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACGGAAGT < W3110S.gb/2728876‑2728807 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |