| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 443799 | 37 (0.660) | 3 (0.080) | 3/66 | NT | 9.0% | intergenic (‑60/‑108) | panE/yajQ | 2‑dehydropantoate reductase, NADPH‑specific/predicted nucleotide binding protein |
| ? | W3110S.gb | = 443811 | 37 (1.020) | intergenic (‑72/‑96) | panE/yajQ | 2‑dehydropantoate reductase, NADPH‑specific/predicted nucleotide binding protein | |||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
ATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGG > W3110S.gb/443732‑443868 | aTTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGc < 1:1489344/70‑1 (MQ=255)aTTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCt > 1:2797481/1‑71 (MQ=255) ttttCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTg > 1:5018629/1‑71 (MQ=255) tttCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGt > 1:3427738/1‑71 (MQ=255) tCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGGATGCTGTTg > 1:4954950/1‑71 (MQ=255) tCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTg > 1:88417/1‑71 (MQ=255) aTTGTTCCTCCTCACCCGCAACCAGTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGc < 1:277401/70‑1 (MQ=255) aTTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGc < 1:4724342/70‑1 (MQ=255) ttGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGa < 1:133846/71‑1 (MQ=255) gTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGAc < 1:4460996/70‑1 (MQ=255) gTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGAc < 1:3280870/70‑1 (MQ=255) gTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGAc < 1:2831193/70‑1 (MQ=255) ttCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACt < 1:1813105/70‑1 (MQ=255) cctcctCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGa > 1:627414/1‑66 (MQ=255) ctcctcACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatg < 1:4067546‑M2/70‑4 (MQ=255) ctcctcACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatg > 1:4842589‑M2/1‑67 (MQ=255) tcctcACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgca < 1:4176185‑M2/71‑6 (MQ=255) ctcACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcac < 1:4243127‑M2/70‑7 (MQ=255) ctcACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcac > 1:114815‑M2/1‑64 (MQ=255) tcACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCTTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcac > 1:4682938‑M2/1‑63 (MQ=255) tcACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGa > 1:1847915/1‑61 (MQ=255) aCCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATagtcgcaacagcatgcacaatt < 1:764077‑M1/71‑23 (MQ=255) aCCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcacaatt > 1:2323486‑M2/1‑61 (MQ=255) aCCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcacaat < 1:4199088‑M2/70‑10 (MQ=255) aCCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTACCCCTTAATTGTGCATagtcgcaacagcatgcacaat > 1:592002‑M1/1‑49 (MQ=255) cccGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATg < 1:3240084/49‑1 (MQ=255) cccGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATg < 1:3472078/49‑1 (MQ=255) cccGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATg < 1:546287/49‑1 (MQ=255) cccGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATg < 1:1132276/49‑1 (MQ=255) gCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATagtcgcaacagcatgcacaa > 1:1175637‑M1/1‑45 (MQ=255) gCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcacaattaagg > 1:4074331‑M2/1‑57 (MQ=255) gCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcacaattaagg < 1:534989‑M2/71‑15 (MQ=255) gCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcacaattaagg < 1:1261169‑M2/71‑15 (MQ=255) cAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcacaattaagg < 1:4799720‑M2/70‑15 (MQ=255) aaCCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcacaattaaggg > 1:38922‑M2/1‑55 (MQ=255) aaCCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcacaattaaggg > 1:3704667‑M2/1‑55 (MQ=255) aCCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTg < 1:4665621/46‑1 (MQ=255) aCCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcacaattaagggat > 1:4093122‑M2/1‑54 (MQ=255) cACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGt > 1:2909057/1‑45 (MQ=255) cTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGc < 1:5068684/40‑1 (MQ=255) tCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTc > 1:740331/1‑71 (MQ=255) tCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTc > 1:2033949/1‑71 (MQ=255) ttCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGa > 1:380071/1‑39 (MQ=255) tCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcacaatta > 1:3102924‑M2/1‑40 (MQ=255) tCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcacaatta > 1:399015‑M2/1‑40 (MQ=255) cAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcacaattaag < 1:2352477‑M2/52‑14 (MQ=255) aaTAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGAc < 1:4420842/37‑1 (MQ=255) aaTAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcac > 1:3264564‑M2/1‑38 (MQ=255) aaTAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAgg < 1:4005450/70‑1 (MQ=255) aaTAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGa < 1:4543066/71‑1 (MQ=255) aaTAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGa < 1:2734644/71‑1 (MQ=255) tAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACt < 1:3633507/71‑1 (MQ=255) tAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACt < 1:5068989/71‑1 (MQ=255) aaGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGGCTa < 1:3604668‑M2/36‑2 (MQ=255) aGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGt > 1:281818/1‑71 (MQ=255) ggCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTc < 1:4424010/71‑1 (MQ=255) cTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCgg < 1:601251/71‑1 (MQ=255) tATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGt > 1:1392249/1‑71 (MQ=255) aTCCCTTAATTGTGCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggt > 1:4093122‑M1/1‑17 (MQ=255) aTCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGt > 1:5170943/1‑70 (MQ=255) aTCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGt > 1:4364858/1‑70 (MQ=255) tCCCTTAATTGTGCATagtcgcaacagcatgcacaa > 1:1218192‑M1/1‑16 (MQ=255) tCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGt < 1:437774/69‑1 (MQ=255) tCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGt < 1:1708231/69‑1 (MQ=255) cccTTAATTGTGCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggtt > 1:38922‑M1/1‑15 (MQ=255) cccTTAATTGTGCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggtt > 1:3704667‑M1/1‑15 (MQ=255) ccTTAATTGTGCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgc > 1:4074331‑M1/1‑14 (MQ=255) ccTTAATTGTGCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgc < 1:1261169‑M1/71‑58 (MQ=255) ccTTAATTGTGCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgc < 1:534989‑M1/71‑58 (MQ=255) ccTTAATTGTGCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttg < 1:4799720‑M1/70‑57 (MQ=255) ccTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTAt < 1:2803612/70‑1 (MQ=255) cTTAATTGTGCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattg < 1:2352477‑M1/52‑40 (MQ=255) cTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTAttt < 1:1300127/71‑1 (MQ=255) cTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTAtt > 1:3619412/1‑70 (MQ=255) ttAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGc < 1:2830845/53‑1 (MQ=255) ttAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTAtt > 1:307691/1‑69 (MQ=255) tAATTGTGCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattga > 1:3102924‑M1/1‑11 (MQ=255) tAATTGTGCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattga > 1:399015‑M1/1‑11 (MQ=255) tAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTaa > 1:177472/1‑71 (MQ=255) aaTTGTGCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgcgggt > 1:2323486‑M1/1‑10 (MQ=255) aaTTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgcgggt < 1:764077‑M2/71‑50 (MQ=255) aaTTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTa < 1:4337609/69‑1 (MQ=255) aaTTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTa < 1:4015082/69‑1 (MQ=255) aTTGTGCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgcgggt < 1:4199088‑M1/70‑62 (MQ=255) aTTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcacaattaaggggtagccttattgaacacccggagtggttgcgggt > 1:592002‑M2/1‑21 (MQ=255) aTTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTa < 1:658113/68‑1 (MQ=255) ttGTGCATGCTGTTGCGACTatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgc > 1:1175637‑M2/1‑20 (MQ=255) ttGTGCATGCTGTTGCGACTatgcacaattaaggga > 1:1218192‑M2/1‑20 (MQ=255) gtgCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgcgggtgag > 1:114815‑M1/1‑6 (MQ=255) gtgCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgcgggtgag < 1:4243127‑M1/70‑65 (MQ=255) gtgCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttatt > 1:3264564‑M1/1‑6 (MQ=255) gtgCATagtcgcaacagcatgcacaattaaaggatagccttattgaacacccggagtggttgcgggtga > 1:4682938‑M1/1‑6 (MQ=255) tgCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgcgggtgagga < 1:4176185‑M1/71‑67 (MQ=255) tgCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTg < 1:765805/70‑1 (MQ=255) tgCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGc < 1:3949105/71‑1 (MQ=255) cATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgcgggtgaggag > 1:4842589‑M1/1‑3 (MQ=255) cATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgcgggtgaggag < 1:4067546‑M1/70‑68 (MQ=255) aTGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCggg < 1:2938607/71‑1 (MQ=255) aTGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCggg < 1:2907884/71‑1 (MQ=255) tagccgcaacagcatgcacaattaagggatagcctt < 1:3604668‑M1/36‑36 (MQ=255) | ATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGG > W3110S.gb/443732‑443868 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |