| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 2750759 = | 55 (0.980) | 3 (0.060) | 3/94 | NT | 5.7% | coding (309/1662 nt) | recN | recombination and repair protein |
| ? | W3110S.gb | 2750777 = | 48 (0.930) | coding (327/1662 nt) | recN | recombination and repair protein | |||||
GAAGAAAACCAGCTTGAAGACGGGCATGAATGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCCTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAG > W3110S.gb/2750691‑2750828 | gaagaaAACCAGCTTGAAGACGGGCATGAATGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTcc < 1:1856979/69‑1 (MQ=255)gaagaaAACCAGCTTGAAGACGGGCATGAATGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCg < 1:1608367/71‑1 (MQ=255) gtgctgaccatggatctgaatcagcaactgacccagttcgcgcagttgtgacagaggaacagctgtaCCGt > 1:303994‑M1/68‑71 (MQ=255) aagaaAACCAGCTTGAAGACGGGCATGAATGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGt > 1:3666542/1‑71 (MQ=255) gaaAACCAGCTTGAAGACGGGCATGAATGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTgg < 1:493807/71‑1 (MQ=255) aaaaCCAGCTTGAAGACGGGCATGAATGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGt > 1:2135909/1‑71 (MQ=255) aaaCCAGCTTGAAGACGGGCATGAATGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGt < 1:2019760/70‑1 (MQ=255) aaCCAGCTTGAAGACGGGCATGAATGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGttt < 1:4633840/71‑1 (MQ=255) aCCAGCTTGAAGACGGGCATGAATGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTg > 1:3712658/1‑66 (MQ=255) ccAGCTTGAAGACGGGCATGAATGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCgggg > 1:2888203/1‑66 (MQ=255) ccAGCTTGAAGACGGGCATGAATGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTtca > 1:561917/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGAAGACGGGCATGAATGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTtcat < 1:3021838/71‑1 (MQ=255) gCTTGAAGACGGGCATGAATGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTtcatc > 1:206223/1‑70 (MQ=255) cTTGAAGACGGGCATGAATGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCaa > 1:1268497/1‑71 (MQ=255) ttGAAGACGGGCATGAATGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGtt < 1:314424/63‑1 (MQ=255) ttGAAGACGGGCATGAATGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAAc > 1:2110879/1‑71 (MQ=255) tGAAGACGGGCATGAATGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACg > 1:129485/1‑71 (MQ=255) gAAGACGGGCATGAATGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAAc < 1:537063/69‑1 (MQ=255) gAAGACGGGCATGAATGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACgg > 1:4278540/1‑71 (MQ=255) gAAGACGGGCATGAATGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCAT‑AACgg < 1:4396736/70‑1 (MQ=255) aaGACGGGCATGAATGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACgg > 1:2537429/1‑70 (MQ=255) aCGGGCATGAATGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTa > 1:3336383/1‑69 (MQ=255) cGGGCATGAATGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAg > 1:4482725/1‑71 (MQ=255) ggCATGAATGTTTGCTTCGTCGCGTGAACAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCt > 1:1100005/1‑71 (MQ=255) gCATGAATGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTg < 1:2578722/50‑1 (MQ=255) agcaactgacccagttcgcgcagttgtgacagaggaacagctgtaCCGTGGTTTCATCAACGGTACa < 1:3060821‑M1/22‑1 (MQ=255) aTGAATGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGtt > 1:4876059/1‑71 (MQ=255) tGAATGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGttt < 1:2656362/51‑1 (MQ=255) tGAATGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTtc < 1:1669172/52‑1 (MQ=255) aactgacccagttcgcgcagttgtgacagaggaacagctgtaCCGTGGTTTCATCAACgg > 1:354318‑M1/43‑60 (MQ=255) aactgacccagttcgcgcagttgtgacagaggaacagctgtaCCGTGGTTTCATCAACGGTa < 1:857885‑M1/20‑1 (MQ=255) gAATGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTgg < 1:3785860/47‑1 (MQ=255) aaTGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCct > 1:4852776/1‑71 (MQ=255) aaTGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCct < 1:3112225/71‑1 (MQ=255) aaTGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCct > 1:4111718/1‑71 (MQ=255) aTGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCctc > 1:4278188/1‑71 (MQ=255) aTGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCctc > 1:4272558/1‑71 (MQ=255) tGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCctct < 1:4310901/71‑1 (MQ=255) tGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCctct > 1:4246947/1‑71 (MQ=255) tGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGGCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCctct < 1:1168836/71‑1 (MQ=255) tttGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCCTCTg < 1:3905488/70‑1 (MQ=255) ttGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCCTCTGt > 1:2038032/1‑70 (MQ=255) gCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTa > 1:3206090/1‑53 (MQ=255) cTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCct < 1:3198810/63‑1 (MQ=255) cTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCCTCTGTcac < 1:3156275/70‑1 (MQ=255) gtcgCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCCTCTGTCACAACt < 1:3679101/70‑1 (MQ=255) gATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTAc < 1:3840577/42‑1 (MQ=255) aTCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCCTCTGTcac < 1:460991/58‑1 (MQ=255) aTCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCCTCTGTCACAACTGCGCGAACt > 1:1220378/1‑71 (MQ=255) aTCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCCTCTGTCACAACTGCGCGAACt < 1:5074917/71‑1 (MQ=255) aTCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCCTCTGTCACAACTGCGCGAACt < 1:4861851/71‑1 (MQ=255) aTCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCCTCTGTCACAACTGCGCGAACt < 1:2391794/71‑1 (MQ=255) tCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACgg < 1:410864/37‑1 (MQ=255) cagcagCGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCCTCTGTcac > 1:512020/1‑56 (MQ=255) cagcagCGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCCTCTGTCACAACTGCGCGAACTgg > 1:1972163/1‑71 (MQ=255) cagcagCGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCCTCTGTCACAACTGCGCGAACTgg > 1:3345455/1‑71 (MQ=255) agcagcGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCCTCTGTCACAACTGCGCGAACTggg < 1:1823471/71‑1 (MQ=255) cagcGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCCTCTGTCACAACTGCGCGAACTggg > 1:598298/1‑69 (MQ=255) agcGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCCTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGt > 1:50957/1‑69 (MQ=255) agcGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCCTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCa < 1:2075072/71‑1 (MQ=255) gcGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCCTCTGTCACAACTgc > 1:2040368/1‑57 (MQ=255) cGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCCTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGt > 1:4744712/1‑71 (MQ=255) tGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCCTCTGTCACAACTGCGCGAACTggg < 1:189491/63‑1 (MQ=255) gTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGtt > 1:66328/1‑35 (MQ=255) cGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCCTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGAt > 1:2759483/1‑71 (MQ=255) cGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCCTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGAt > 1:5099972/1‑71 (MQ=255) gCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCCTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGt < 1:3702337/63‑1 (MQ=255) gCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCCTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGAtt < 1:2303221/71‑1 (MQ=255) cccGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCCTCTg < 1:2376046/35‑1 (MQ=255) CCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCCTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGtt > 1:2237561‑M1/1‑60 (MQ=255) CCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCCTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAg > 1:3328449‑M1/1‑70 (MQ=255) | GAAGAAAACCAGCTTGAAGACGGGCATGAATGTTTGCTTCGTCGCGTGATCAGCAGCGATGGTCGCTCCCGTGGTTTCATCAACGGTACAGCTGTTCCTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAG > W3110S.gb/2750691‑2750828 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |