| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 4357242 = | 63 (1.120) | 5 (0.100) | 5/90 | NT | 8.5% | intergenic (+205/‑22) | yjdJ/yjdK | predicted acyltransferase with acyl‑CoA N‑acyltransferase domain/hypothetical protein |
| ? | W3110S.gb | 4357265 = | 52 (1.050) | coding (2/297 nt) | yjdK | hypothetical protein | |||||
AAAAAAAGAATATCTCCTATATGAGAATCATCAATCGGGGTTAATAAGTTTTGCGTCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACTTATGTTGTTTCTTTTGATTATC > W3110S.gb/4357174‑4357312 | cactgaggaataagatgatggataatcaaaagaaacaacataagtattgaacttgtttttaccttccataa < 1:3000087‑M1/3‑1 (MQ=255) aaaaaaGAATATCTCCTATATGAGAATCATCAATCGGGGTTAATAAGTTTTGCGTCCCCAGAGCGTTTaa > 1:1892972/1‑70 (MQ=255) aaaaaGAATATCTCCTATATGAGAATCATCAATCGGGGTTAATAAGTTTTGCGTCCCCAGAGCGTTTAata > 1:4100751/1‑71 (MQ=255) aaaGAATATCTCCTATATGAGAATCATCAATCGGGGTTAATAAGTTTTGCGTCCCCAGAGCGTTTAATAtt > 1:3217803/1‑71 (MQ=255) aaaGAATATCTCCTATATGAGAATCATCAATCGGGGTTAATAAGTTTTGCGTCCCCAGAGCGTTTAATAtt < 1:5063753/71‑1 (MQ=255) aggaataagatgatggataatcaaaagaaacaacataagtattgaacttgtttttaccttccaTAatat > 1:5049819‑M1/64‑69 (MQ=255) aggaataagatgatggataatcaaaagaaacaacataagtattgaacttgtttttaccttccaTAatat > 1:4440906‑M1/64‑69 (MQ=255) aaGAATATCTCCTATATGAGAATCATCAATCGGGGTTAATAAGTTTTGCGTCCCCAGAGCGTTTAATATTg < 1:3834423/71‑1 (MQ=255) atatCTCCTATATGAGAATCATCAATCGGGGTTAATAAGTTTTGCGTCCCCAGAGCGTTTAATATTGATa < 1:2083027/70‑1 (MQ=255) tcCTATATGAGAATCATCAATCGGGGTTAATAAGTTTTGCGTCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGt > 1:3248778/1‑70 (MQ=255) ccTATATGAGAATCATCAATCGGGGTTAATAAGTTTTGCGTCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCa > 1:4733384/1‑71 (MQ=255) ccTATATGAGAATCATCAATCGGGGTTAATAAGTTTTGCGTCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCa > 1:2867609/1‑71 (MQ=255) tataTGAGAATCATCAATCGGGGTTAATAAGTTTTGCGTCCCCAGAGCGTTTaa > 1:633897/1‑54 (MQ=255) tatGAGAATCATCAATCGGGGTTAATAAGTTTTGCGTCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCatat < 1:2057246/70‑1 (MQ=255) tatGAGAATCATCAATCGGGGTTAATAAGTTTTGCGTCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCatat > 1:1277793/1‑70 (MQ=255) tatGAGAATCATCAATCGGGGTTAATAAGTTTTGCGTCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCatat < 1:2409778/70‑1 (MQ=255) tatGAGAATCATCAATCGGGGTTAATAAGTTTTGCGTCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCatat > 1:3551542/1‑70 (MQ=255) taatcaaaagaaacaacataagtattgaacttgtttttaccttccataa > 1:2870181‑M1/47‑49 (MQ=255) gaATCATCAATCGGGGTTAATAAGTTTTGCGTCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATg > 1:2579600/1‑69 (MQ=255) atcaaaagaaacaacataagtattgaacttgtttttaccttccaTAATATTGATAGGAGTCATATTATgg > 1:1045610‑M1/45‑70 (MQ=255) atcatcAATCGGGGTTAATAAGTTTTGCGTCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGaa < 1:4917041/70‑1 (MQ=255) atcatcAATCGGGGTTAATAAGTTTTGCGTCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAg > 1:3858281/1‑71 (MQ=255) tcatcaATCGGGGTTAATAAGTTTTGCGTCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAgg > 1:5051484/1‑71 (MQ=255) aaaagaaacaacataagtattgaacttgtttttaccttccataa > 1:4941985‑M1/42‑44 (MQ=255) aaagaaacaacataagtattgaacttgtttttaccttccataa > 1:2334469‑M1/41‑43 (MQ=255) aaagaaacaacataagtattgaacttgtttttaccttccat > 1:3314071‑M1/41‑41 (MQ=255) aaagaaacaacataagtattgaacttgtttttaccttccaTAATATTGATAGGAGTCATATTATg > 1:2985177‑M1/41‑65 (MQ=255) atcaATCGGGGTTAATAAGTTTTGCGTCCCCAGAGCGTTTAATATTg < 1:4009960/47‑1 (MQ=255) aagaaacaacataagtattgaacttgtttttaccttccaTAATATTGATAGGAGTCAtatta > 1:3913062‑M1/40‑62 (MQ=255) 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aaGTTTTGCGTCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAg > 1:2084002/1‑63 (MQ=255) aGTTTTGCGTCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATgg > 1:4191845/1‑48 (MQ=255) aGTTTTGCGTCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATgg > 1:3827792/1‑48 (MQ=255) aGTTTTGCGTCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACt > 1:4989329/1‑71 (MQ=255) aGTTTTGCGTCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACt > 1:4415274/1‑71 (MQ=255) ttttGCGTCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACt < 1:665701/69‑1 (MQ=255) ttGCGTCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACTTAtg > 1:2178740/1‑71 (MQ=255) tGCGTCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACTTAtgt > 1:714777/1‑71 (MQ=255) tGCGTCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACTTAtg < 1:2198997/70‑1 (MQ=255) tGCGTCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACTTAtg < 1:4515630/70‑1 (MQ=255) tGCGTCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATAATTAtgt > 1:2052824/1‑71 (MQ=255) cGTCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACTTa < 1:1970791/66‑1 (MQ=255) cGTCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACTTAtgttg < 1:4233582/71‑1 (MQ=255) gTCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGa < 1:3466507/41‑1 (MQ=255) gTCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACTTAtgttgt < 1:4067717/71‑1 (MQ=255) gTCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACTTAtgttgt > 1:4976729/1‑71 (MQ=255) gTCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGAAAAAACAAGTTCAATACTTAtgttgt > 1:4616944/1‑71 (MQ=255) gTCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGATa < 1:2366557/46‑1 (MQ=255) tCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCa < 1:585978/57‑1 (MQ=255) tCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCa < 1:5139536/57‑1 (MQ=255) cccAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACTTATGTTGttt < 1:837928/70‑1 (MQ=255) cccAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACTTATGTTGTTTc > 1:3357286/1‑71 (MQ=255) cccAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACTTATGTTGTTTc < 1:4621260/71‑1 (MQ=255) ccAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGt < 1:4230107/41‑1 (MQ=255) ccAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGt < 1:3470944/41‑1 (MQ=255) ccAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACTTAtgttg < 1:4950672/66‑1 (MQ=255) ccAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACTTATGTTGTTTCt < 1:4865381/71‑1 (MQ=255) ccAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACTTATGTTGTTTCt < 1:4138127/71‑1 (MQ=255) ccAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACTTATGTTGTTTCt > 1:2933094/1‑71 (MQ=255) agagCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCaa > 1:3309961/1‑53 (MQ=255) agagCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACTTAtg > 1:1545062/1‑61 (MQ=255) agagCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACTTATGTTGTTTCttt < 1:1865648/71‑1 (MQ=255) agagCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACTTATGTTGTTTCttt > 1:3775873/1‑71 (MQ=255) agagCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACTTATGTTGTTTCttt > 1:2712664/1‑71 (MQ=255) agagCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACTTATGTTGTTTCttt < 1:321471/71‑1 (MQ=255) gagCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACTTAtg < 1:1484972/60‑1 (MQ=255) gagCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACTTATGTTGTTTCtttt > 1:3509270/1‑71 (MQ=255) agCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACTTATGTTGTTTCtttt > 1:3441624/1‑70 (MQ=255) agCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACTTATGTTGTTTCtttt > 1:1357417/1‑70 (MQ=255) agCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACTTATGTTGTTTCtttt > 1:948412/1‑70 (MQ=255) cGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACTTATGTTGTTTCTTTTGAt < 1:5049238/71‑1 (MQ=255) tttAATATTGATAGTAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACTTATGTTGTTTCttt < 1:2863134/65‑1 (MQ=255) tttAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTc < 1:2684842/45‑1 (MQ=255) tttAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACTTATGTTGTTTCTTTTGATTa > 1:3797186/1‑71 (MQ=255) TAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAg > 1:4177630‑M1/1‑40 (MQ=255) TAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACTTATGTTGTTTCTTTTGATTATc < 1:2767734‑M1/71‑1 (MQ=255) | AAAAAAAGAATATCTCCTATATGAGAATCATCAATCGGGGTTAATAAGTTTTGCGTCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACTTATGTTGTTTCTTTTGATTATC > W3110S.gb/4357174‑4357312 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |