| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 2859968 = | 88 (1.560) | 3 (0.070) | 3/82 | NT | 5.1% | intergenic (‑48/‑118) | ygbI/ygbJ | predicted DNA‑binding transcriptional regulator/predicted dehydrogenase, with NAD(P)‑binding Rossmann‑fold domain |
| ? | W3110S.gb | 2860005 = | 40 (0.880) | intergenic (‑85/‑81) | ygbI/ygbJ | predicted DNA‑binding transcriptional regulator/predicted dehydrogenase, with NAD(P)‑binding Rossmann‑fold domain | |||||
GCGAAACGTGCGCGGCGCAACTAACGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCACAATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAAC > W3110S.gb/2859937‑2860074 | gCGAAACGTGCGCGGCGCAACTAACGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAAt > 1:2301925/1‑69 (MQ=255) cGAAACGTGCGCGGCGCAACTAACGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATc < 1:176235/69‑1 (MQ=255) cGAAACGTGCGCGGCGCAACTAACGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATc < 1:518530/69‑1 (MQ=255) cGAAACGTGCGCGGCGCAACTAACGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCa < 1:197069/70‑1 (MQ=255) cGAAACGTGCGCGGCGCAACTAACGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAg < 1:381109/71‑1 (MQ=255) gAAACGTGCGCGGCGCAACTAACGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAAt > 1:3295805/1‑67 (MQ=255) aaCGTGCGCGGCGCAACTAACGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGAt > 1:4713315/1‑70 (MQ=255) aaCGTGCGCGGCGCAACTAACGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGAt > 1:2003832/1‑70 (MQ=255) aaCGTGCGCGGCGCAACTAACGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGAt < 1:3263419/70‑1 (MQ=255) cGTGCGCGGCGCAACTAACGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCAc < 1:1640711/71‑1 (MQ=255) cGTGCGCGGCGCAACTAACGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCAc > 1:4062539/1‑71 (MQ=255) tGCGCGGCGCAACTAACGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCa < 1:575101/71‑1 (MQ=255) tGCGCGGCGCAACTAACGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCa < 1:4845862/71‑1 (MQ=255) tGCGCGGCGCAACTAACGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCa > 1:4844837/1‑71 (MQ=255) gcgcGGCGCAACTAACGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCAcc > 1:762866/1‑69 (MQ=255) gcgcGGCGCAACTAACGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCAcc > 1:4636682/1‑69 (MQ=255) cAACTAACGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATAc < 1:4117630/65‑1 (MQ=255) aaCTAACGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATc > 1:3624415/1‑71 (MQ=255) aCTAACGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCt > 1:4590620/1‑71 (MQ=255) cTAACGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCtt < 1:4578415/71‑1 (MQ=255) cTAACGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCtt > 1:4655158/1‑71 (MQ=255) cTAACGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCtt < 1:3985850/71‑1 (MQ=255) tAACGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCAc < 1:2329332/56‑1 (MQ=255) aaCGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGa > 1:3407974/1‑51 (MQ=255) aaCGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGtt < 1:478565/64‑1 (MQ=255) aaCGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTc > 1:4535065/1‑70 (MQ=255) aaCGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTc > 1:778852/1‑70 (MQ=255) aCGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCAc < 1:2389769/54‑1 (MQ=255) aCGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTc > 1:3122277/1‑69 (MQ=255) aCGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTc < 1:4068289/69‑1 (MQ=255) cGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAg < 1:205360/71‑1 (MQ=255) gCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCAc > 1:560405/1‑52 (MQ=255) ttAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAgcgc > 1:94078/1‑71 (MQ=255) ttAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAgcgc > 1:2249720/1‑71 (MQ=255) tAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCt > 1:1383088/1‑71 (MQ=255) aGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCt > 1:1219611/1‑70 (MQ=255) TTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTtat > 1:3394111‑M1/1‑71 (MQ=255) TTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTtat > 1:3400207‑M1/1‑71 (MQ=255) CACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTatat < 1:448162‑M1/71‑1 (MQ=255) CACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTatat < 1:975752‑M1/71‑1 (MQ=255) CACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTatat < 1:3959155‑M1/71‑1 (MQ=255) CACATAAAATAACA‑ACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCAt < 1:3210574‑M1/46‑1 (MQ=255) ACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAg > 1:645512‑M1/1‑38 (MQ=255) ACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTatat > 1:4551652‑M1/1‑70 (MQ=255) ACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATAtt < 1:4552593‑M1/71‑1 (MQ=255) CATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTc < 1:3335814‑M1/57‑1 (MQ=255) ATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTca > 1:3966647‑M1/1‑71 (MQ=255) TAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATAc > 1:3819210‑M1/1‑45 (MQ=255) TAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATAc > 1:5050859‑M1/1‑45 (MQ=255) TAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTcac > 1:1496916‑M1/1‑71 (MQ=255) aaattaacattgtgtgttattttatgtgaaTCAGATCACCATACCGTTATCt < 1:3248723‑M2/22‑1 (MQ=255) aaattaacattgtgtgttattttatgtgaaTCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTcac > 1:1267729‑M2/31‑70 (MQ=255) AAAATAACACAGAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCg > 1:2634203‑M1/1‑46 (MQ=255) AAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATAc > 1:2723743‑M1/1‑44 (MQ=255) AAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATAc > 1:4477574‑M1/1‑44 (MQ=255) AAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGtt > 1:520538‑M1/1‑48 (MQ=255) AAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTcac < 1:2939889‑M1/70‑1 (MQ=255) AAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTcaca < 1:423747‑M1/70‑1 (MQ=255) AAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTcaca < 1:2078915‑M1/70‑1 (MQ=255) AAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCACaa < 1:1152244‑M1/71‑1 (MQ=255) AAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCACaa < 1:517416‑M1/71‑1 (MQ=255) AATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATAGCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCACAAt > 1:549232‑M1/1‑71 (MQ=255) AATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTa < 1:4686892‑M1/47‑1 (MQ=255) AATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCACAAt > 1:699236‑M1/1‑71 (MQ=255) AATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCACAAt > 1:4262565‑M1/1‑71 (MQ=255) AATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCACAAt > 1:2765971‑M1/1‑71 (MQ=255) AATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCACAAt > 1:3824750‑M1/1‑71 (MQ=255) ttaacattgtgtgttattttatgtgaaTCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAg > 1:3317675‑M2/28‑54 (MQ=255) tAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCACAatat > 1:536842/1‑71 (MQ=255) acacacAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCACAATATca < 1:1143745/71‑1 (MQ=255) acaATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGtt < 1:3786606/38‑1 (MQ=255) acaATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCACAATATcaaaca < 1:161247/71‑1 (MQ=255) caATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCACAATATcaaacaa < 1:433352/71‑1 (MQ=255) caATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCACAATATcaaaca > 1:3051205/1‑70 (MQ=255) aaTGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCACAATATcaaacaa > 1:736594/1‑70 (MQ=255) tGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCt < 1:1498524/38‑1 (MQ=255) tGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCt < 1:4463383/38‑1 (MQ=255) tGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCACAATATCAAACaaaa > 1:843376/1‑70 (MQ=255) tGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCACAATATCAAACAAAat < 1:4068415/71‑1 (MQ=255) gTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCACAATATCAAACAAAata > 1:544331/1‑71 (MQ=255) ttAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCACAATATCAAACAAAata < 1:4399680/70‑1 (MQ=255) aTTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTtata < 1:2367181/46‑1 (MQ=255) tttatgtgaaTCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTcac < 1:4085747‑M2/40‑1 (MQ=255) tttatgtgaaTCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCACAATATca < 1:4350317‑M2/47‑1 (MQ=255) gtgaaTCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTca > 1:1130877‑M2/6‑44 (MQ=255) gaaTCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCACAATATCAAACaaaa < 1:4602611‑M2/54‑1 (MQ=255) aTCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCACAATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAAc < 1:2211517‑M2/70‑1 (MQ=255) | GCGAAACGTGCGCGGCGCAACTAACGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCACAATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAAC > W3110S.gb/2859937‑2860074 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |