| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 3124567 | 62 (1.100) | 5 (0.100) | 3/92 | NT | 8.0% | coding (612/1053 nt) | glcE | glycolate oxidase FAD binding subunit |
| ? | W3110S.gb | = 3124578 | 59 (1.160) | coding (601/1053 nt) | glcE | glycolate oxidase FAD binding subunit | |||||
ACCGATCCTTCGCCGCCCTCAAGGCGGATCCACAACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATGGCTTCTTGCAGGCTGATTTCCCGACGCAGGCTCAG > W3110S.gb/3124508‑3124647 | aCCGATCCTTCGCCGCCCTCAAGGCGGATCCACAACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTaa > 1:2966457/1‑71 (MQ=255) aTCCTTCGCCGCCCTCAAGGCGGATCCACAACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAAtgga > 1:1455526‑M2/1‑67 (MQ=255) tCCTTCGCCGCCCTCAAGGCGGATCCACAACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAAtggct > 1:3603259‑M2/1‑66 (MQ=255) tCCTTCGCCGCCCTCAAGGCGGATCCACAACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAAtggct < 1:2813333‑M2/71‑6 (MQ=255) ccTTCGCCGCCCTCAAGGCGGATCCACAACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTg > 1:1513671/1‑71 (MQ=255) cTTCGCCGCCCTCAAGGCGGATCCACAACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTgg < 1:639274/71‑1 (MQ=255) cTTCGCCGCCCTCAAGGCGGATCCACAACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTgg < 1:4038448/71‑1 (MQ=255) ttCGCCGCCCTCAAGGCGGATCCACAACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTg > 1:4064055/1‑69 (MQ=255) ttCGCCGCCCTCAAGGCGGATCCACAACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTg > 1:1734301/1‑69 (MQ=255) cgccgcCCTCAAGGCGGATCCACAACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGt > 1:3539227/1‑71 (MQ=255) cccTCAAGGCGGATCCACAACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGc < 1:470477/69‑1 (MQ=255) cccTCAAGGCGGATCCACAACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATCGGTAATGGCTGGAg < 1:191349/65‑1 (MQ=255) cTCAAGGCGGATCCACAACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACt < 1:2228864/71‑1 (MQ=255) tCAAGGCGGATCCACAACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGc > 1:4003323/1‑66 (MQ=255) aaGGCGGATCCACAACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTc < 1:3388461/69‑1 (MQ=255) aaGGCGGATCCACAACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCg < 1:4551050/70‑1 (MQ=255) aGGCGGATCCACAACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGc > 1:5014714/1‑63 (MQ=255) aGGCGGATCCACAACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGc < 1:3503080/71‑1 (MQ=255) aGGCGGATCCACAACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGc < 1:2216553/71‑1 (MQ=255) cGGATCCACAACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGc < 1:1125918/68‑1 (MQ=255) cGGATCCACAACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGc < 1:3902413/68‑1 (MQ=255) cGGATCCACAACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGc < 1:1448767/68‑1 (MQ=255) cGGATCCACAACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGAt < 1:4280769/71‑1 (MQ=255) ggATCCACAACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGAtt > 1:4309799/1‑71 (MQ=255) ggATCCACAACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGAtt > 1:2409532/1‑71 (MQ=255) gATCCACAACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGAttt < 1:2480344/71‑1 (MQ=255) gATCCACAACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGAttt < 1:4982771/71‑1 (MQ=255) aTCCACAACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAAtggct > 1:1262140‑M2/1‑44 (MQ=255) tCCACAACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTATTGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCa < 1:1061674/71‑1 (MQ=255) tCCACAACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCa > 1:1230230/1‑71 (MQ=255) ccACAACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTc > 1:4699454/1‑60 (MQ=255) ccACAACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCAc > 1:4942569/1‑71 (MQ=255) acaACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTc < 1:4812746/71‑1 (MQ=255) caACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCgg > 1:3966187/1‑59 (MQ=255) caACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGAt > 1:2373489/1‑63 (MQ=255) aCGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCAt < 1:4393887/70‑1 (MQ=255) aCGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATg > 1:664302/1‑71 (MQ=255) cATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGAt < 1:3883713/58‑1 (MQ=255) ttGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGAt < 1:2100500/56‑1 (MQ=255) gTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATGGcttctt > 1:2249988/1‑71 (MQ=255) gTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATGGcttctt > 1:4707202/1‑71 (MQ=255) gTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATGGcttct < 1:2839978/70‑1 (MQ=255) gTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATGGcttct > 1:179526/1‑70 (MQ=255) tCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATGGcttctt < 1:3394128/70‑1 (MQ=255) aaGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCTGCGAt < 1:3468963/50‑1 (MQ=255) aaGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGAt < 1:1299891/50‑1 (MQ=255) aaGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATGGCTTCTTGCAg < 1:965334/71‑1 (MQ=255) aaGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATGGCTTCTTGCAg < 1:4552886/71‑1 (MQ=255) aGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATGGCTTCTTGCAg < 1:2260024/70‑1 (MQ=255) tAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGAt < 1:2263818/47‑1 (MQ=255) cATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCAt < 1:1169917/53‑1 (MQ=255) cATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATGGCTTCTTGCAGGCTGAt < 1:1739489/71‑1 (MQ=255) tAAGCCACTAATGGGTAATGGCTTGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATGGCTTCTTGCAGGCTGAttt < 1:187627/71‑1 (MQ=255) tAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCAt < 1:1495014/51‑1 (MQ=255) tAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATGGCTTCTTGCAGGCTGAttt < 1:1345831/71‑1 (MQ=255) tAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATGGCTTCTTGCAGGCTGAttt < 1:3193877/71‑1 (MQ=255) aaGCCACTAATGGGTAAtggcttatgttacttcgacaatgcgttg > 1:492146‑M2/1‑17 (MQ=255) aaGCCACTAATGGGTAAtggcttatgttacttcgacaatgcgttg > 1:3831408‑M2/1‑17 (MQ=255) aaGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGAttt > 1:865010/1‑43 (MQ=255) aGCCACTAATGGGTAAtggcttatgttacttcgacaatgcgttgtggatc < 1:4541224‑M2/50‑35 (MQ=255) gCCACTAATGGGTAAtggcttatgttacttcgacaatgcgttgtggatccgccttgaggg > 1:2567712‑M2/1‑15 (MQ=255) gCCACTAATGGGTAAtggcttatgttacttcgacaatgcgttgtggatccgccttgaggg > 1:3017683‑M2/1‑15 (MQ=255) gCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATGGCTTCTTGCAGGCTGATTTccc < 1:3727006/71‑1 (MQ=255) gCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATGGCTTCTTGCAGGCTGATTTccc < 1:2404381/71‑1 (MQ=255) cACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGAtt > 1:793782/1‑38 (MQ=255) cACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATGGCTTCTTGCAGGCTGAt > 1:3573927/1‑64 (MQ=255) cACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATGGCTTCTTGCAGGCTGATTTCCCGa > 1:1245470/1‑71 (MQ=255) aCTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATGGCTTCTTGCAGGCTGAt > 1:3634527/1‑63 (MQ=255) aCTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATGGCTTCTTGCAGGCTGATTTCCCGAc < 1:5119194/71‑1 (MQ=255) cTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGAt < 1:3135606/35‑1 (MQ=255) cTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATGGCTTCTTGCAGGCTGATTTCCCGACg < 1:3896501/71‑1 (MQ=255) aaTGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCAc > 1:1443700/1‑38 (MQ=255) aaTGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATGGCTTCTTGCAGGCTGATTTCCCGACg > 1:2456996/1‑69 (MQ=255) aTGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATGGCTTCTTGCAGGCTGATTTCCCGACGc < 1:246703/69‑1 (MQ=255) tGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATg < 1:2762820/41‑1 (MQ=255) gggTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACt > 1:2389724/1‑36 (MQ=255) ggTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATGGCTTCTTGCAg > 1:3554705/1‑50 (MQ=255) ggTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATGGCTTCTTGCAGGCTGATTTCCCGACGCAGGCt > 1:3750191/1‑71 (MQ=255) ggTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATGGCTTCTTGCAGGCTGATTTCCCGACGCAGGCt < 1:4230358/71‑1 (MQ=255) gTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATGGCTTCTTg < 1:460788/46‑1 (MQ=255) gTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATGGCTTCTTg < 1:2229175/46‑1 (MQ=255) gTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATGGCTTCTTGCAGGCTGATTTCCCGACGCAGGCt > 1:4677856/1‑70 (MQ=255) gTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATGGCTTCTTGCAGGCTGATTTCCCGACGCAGGCt > 1:4143987/1‑70 (MQ=255) tAAtgggtaatgttacttcgacaatgcgttgtggatccgccttga > 1:3750047‑M2/1‑3 (MQ=255) tAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATg > 1:3299684/1‑37 (MQ=255) tAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATGGCTTCTTGCAGGCt < 1:1702104/51‑1 (MQ=255) aaTGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATGGCTTCTTGCAGGCTGAt > 1:2517074/1‑53 (MQ=255) aaTGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATGGCTTCTTGCAGGCTGATTTCCCGACGCAGGCTCa < 1:4436382/70‑1 (MQ=255) aTGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATGGCTTCTTGCAGGCTGATTTCCCGACGCAGGCTCAg < 1:4541045/70‑1 (MQ=255) | ACCGATCCTTCGCCGCCCTCAAGGCGGATCCACAACGCATTGTCGAAGTAACATAAGCCACTAATGGGTAATGGCTGGAGTTGCCACTCGGCGATTTCACTCATGGCTTCTTGCAGGCTGATTTCCCGACGCAGGCTCAG > W3110S.gb/3124508‑3124647 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |