| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 4140907 = | 77 (1.370) | 6 (0.120) | 4/90 | NT | 8.7% | coding (64/168 nt) | yhfL | conserved secreted peptide |
| ? | W3110S.gb | 4140937 = | 58 (1.170) | coding (34/168 nt) | yhfL | conserved secreted peptide | |||||
GTCGTAAGAGCAGTTCTTATCACGGTTTTCAATATGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCATTTACATTCCCTATGTATTATATATTAATTAATA > W3110S.gb/4140869‑4141003 | gTCGTAAGAGCAGTTCTTATCACGGTTTTCAATATGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCa < 1:1853344/70‑1 (MQ=255) gTAAGAGCAGTTCTTATCACGGTTTTCAATATGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGc > 1:2393786/1‑66 (MQ=255) tAAGAGCAGTTCTTATCACGGTTTTCAATATGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTAc < 1:3791713/71‑1 (MQ=255) tAAGAGCAGTTCTTATCACGGTTTTCAATATGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTAc < 1:3785473/71‑1 (MQ=255) aaGAGCAGTTCTTATCACGGTTTTCAATATGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTAGTGCACCTAc > 1:4980342/1‑70 (MQ=255) aaGAGCAGTTCTTATCACGGTTTTCAATATGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTAc > 1:5062836/1‑70 (MQ=255) agagCAGTTCTTATCACGGTTTTCAATATGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTAcc < 1:2466751/70‑1 (MQ=255) agagCAGTTCTTATCACGGTTTTCAATATGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCa < 1:2828163/71‑1 (MQ=255) agagCAGTTCTTATCACGGTTTTCAATATGACCAGTACATGCAGTTAACGTAG‑CAGTACTGCACCTACCa < 1:3156486/70‑1 (MQ=255) agCAGTTCTTATCACGGTTTTCAATATGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGt > 1:484613/1‑71 (MQ=255) agCAGTTCTTATCACGGTTTTCAATATGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGt > 1:2313344/1‑71 (MQ=255) gTTCTTATCACGGTTTTCAATATGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCaa < 1:4807853/71‑1 (MQ=255) ttCTTATCACGGTTTTCAATATGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAAc < 1:590408/71‑1 (MQ=255) ttCTTATCACGGTTTTCAATATGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAAc < 1:1875066/71‑1 (MQ=255) tATCACGGTTTTCAATATGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCaa > 1:894042/1‑66 (MQ=255) aTCACGGTTTTCAATATGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCa > 1:4208129/1‑64 (MQ=255) tCACGGTTTTCAATATGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTtaa > 1:4647739/1‑70 (MQ=255) cACGGTTTTCAATATGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTtaat > 1:4866944/1‑70 (MQ=255) cACGGTTTTCAATATGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTtaa > 1:128278/1‑69 (MQ=255) aCGGTTTTCAATATGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTtaata > 1:2628729/1‑70 (MQ=255) cGGTTTTCAATATGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACtt > 1:4984734/1‑64 (MQ=255) cGGTTTTCAATATGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATaaa > 1:371990/1‑71 (MQ=255) ggTTTTCAATATGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAAt < 1:3111634/71‑1 (MQ=255) ggTTTTCAATATGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAAt < 1:4806440/71‑1 (MQ=255) ggTTTTCAATATGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAAt < 1:4484216/71‑1 (MQ=255) gTTTTCAATATGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAAtt > 1:2897947/1‑71 (MQ=255) ttCAATATGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGt > 1:2394946/1‑52 (MQ=255) ttCAATATGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGt > 1:715100/1‑71 (MQ=255) cAATATGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGtt < 1:2494180/70‑1 (MQ=255) aaTATGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCa > 1:1064373/1‑47 (MQ=255) aaTATGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTc < 1:3514787/70‑1 (MQ=255) aaTATGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCa > 1:4079892/1‑71 (MQ=255) ataaGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCAt < 1:1387171/71‑1 (MQ=255) tatGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCAtt < 1:3855925/71‑1 (MQ=255) atGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGt > 1:3109720/1‑46 (MQ=255) atGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCAtt > 1:4665396/1‑70 (MQ=255) atGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGATCAtt > 1:4577284/1‑70 (MQ=255) aCCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCAtt < 1:3310650/67‑1 (MQ=255) aCCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCATTTACa < 1:4627641/71‑1 (MQ=255) ccAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCaa > 1:2647801/1‑46 (MQ=255) cagtactggctacgttaactgcatgtactgCACCTACCAGTG‑AACTTTAATAAATTTGTTCATTTACATTc > 1:2396552‑M2/31‑71 (MQ=255) CAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCa < 1:330209‑M1/39‑1 (MQ=255) gtactggctacgttaactgcatgtactgCACCTACCAGTGCaa < 1:2872416‑M2/15‑1 (MQ=255) gtactggctacgttaactgcatgtactgCACCTACCAGTGCaa < 1:77470‑M2/15‑1 (MQ=255) GTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTTCACCTACCAGt > 1:4331903‑M1/1‑39 (MQ=255) GTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAAt > 1:3445853‑M1/1‑54 (MQ=255) GTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCATTTACATTcc < 1:4315012‑M1/71‑1 (MQ=255) TACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTAcc > 1:4592187‑M1/1‑35 (MQ=255) TACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTAcc > 1:1077036‑M1/1‑35 (MQ=255) TACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCAt < 1:2081905‑M1/61‑1 (MQ=255) actggctacgttaactgcatgtactgCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCAt < 1:2015999‑M2/34‑1 (MQ=255) ACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCATTTACATTccc < 1:5082756‑M1/70‑1 (MQ=255) tGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGt < 1:155036/53‑1 (MQ=255) tGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCATTTACATTCCCTATg < 1:3392086/71‑1 (MQ=255) gctacgttaactgcatgtactgCACCTACCAGTGCAACTTtaata < 1:2816484‑M2/23‑1 (MQ=255) gctacgttaactgcatgtactgCACCTACCAGTGCAACTTtaata < 1:518561‑M2/23‑1 (MQ=255) gCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAAtt < 1:2999278/49‑1 (MQ=255) gCAGTTAACGTACCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCAttt < 1:3867091/58‑1 (MQ=255) cAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTtaataa < 1:3079860/45‑1 (MQ=255) aGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCATTTa > 1:573536/1‑57 (MQ=255) aGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCATTTACa > 1:3481443/1‑59 (MQ=255) aGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCATTTACAtt > 1:1187908/1‑61 (MQ=255) aGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCATTTACAtt > 1:4478926/1‑61 (MQ=255) aGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCATTTACATTCCCTATGtat > 1:3496284/1‑71 (MQ=255) aGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCATTTACATTCCCTATGtat < 1:3170764/71‑1 (MQ=255) ttAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCATTTACATTCCCTATGtatta < 1:3970324/71‑1 (MQ=255) tAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCATTTa > 1:2819763/1‑54 (MQ=255) aaCGTAGCCAGTACTGCACCTAGCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCATTTACATTCCCTATGTATtata > 1:4719138/1‑71 (MQ=255) aaCGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTg < 1:160348/45‑1 (MQ=255) aaCGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTg < 1:4118648/45‑1 (MQ=255) aaCGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCATTTACATTCCCTATGTATtata > 1:1925910/1‑71 (MQ=255) aaCGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTAAttt > 1:518028/1‑52 (MQ=255) cGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGtt > 1:4216804/1‑45 (MQ=255) gTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCATTTACa > 1:2706520/1‑52 (MQ=255) aGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTc < 1:89696/43‑1 (MQ=255) ccAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCa < 1:4975716/42‑1 (MQ=255) ccAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCa < 1:3695733/42‑1 (MQ=255) ccAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCATTTACATTCCCTATGTATTATATattaat > 1:1313837/1‑71 (MQ=255) cAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCATTTACATTCCCTATGtatta > 1:5120044/1‑61 (MQ=255) cAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCATTTACATTCCCTATGTATTATATattaat > 1:2431589/1‑70 (MQ=255) aGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCATTTACATTCCCTATGTATTATATattaat > 1:1846990/1‑69 (MQ=255) gtactgCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTg < 1:2974633‑M2/29‑1 (MQ=255) gtactgCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCATTTACATTCCCTATGTATTATATAttaattaa > 1:3263584‑M2/7‑71 (MQ=255) tactgCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCATTTACAtt < 1:4581864‑M2/41‑1 (MQ=255) tactgCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCATTTACAtt < 1:4370660‑M2/41‑1 (MQ=255) ctgCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCATTTa < 1:3589335‑M2/37‑1 (MQ=255) ctgCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCATTTACATTCCCTATGTATTATATATTAATTAata < 1:1038874‑M2/67‑1 (MQ=255) tgCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCATTTa < 1:2627876‑M2/37‑1 (MQ=255) tgCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCATTTa < 1:567568‑M2/37‑1 (MQ=255) cACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCATTTACATTcc > 1:3520822/1‑43 (MQ=255) cACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCATTTACATTCCCTATGTATTATATattaat < 1:228735/62‑1 (MQ=255) | GTCGTAAGAGCAGTTCTTATCACGGTTTTCAATATGACCAGTACATGCAGTTAACGTAGCCAGTACTGCACCTACCAGTGCAACTTTAATAAATTTGTTCATTTACATTCCCTATGTATTATATATTAATTAATA > W3110S.gb/4140869‑4141003 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |