| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 3574453 = | 72 (1.230) | 5 (0.100) | 4/88 | NT | 8.0% | intergenic (‑19/+83) | yihN/yihM | predicted transporter/predicted sugar phosphate isomerase |
| ? | W3110S.gb | 3574473 = | 53 (1.050) | intergenic (‑39/+63) | yihN/yihM | predicted transporter/predicted sugar phosphate isomerase | |||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
CGCCACACAGTGTTAATAGACTAAATAACGCCCATTTCTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑CATATGGAATGGTTTTATTAACTGCGTAT > W3110S.gb/3574383‑3574522 | ccactaataagttttaactcatacgcagttaataaaaccattccatatgaatggtcggtatcttattgcct < 1:1914962‑M1/1‑1 (MQ=255) gCCACACAGTGTTAATAGACTAAATAACGCCCATTTCTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGAtttt > 1:2302372/1‑71 (MQ=255) ccACACAGTGTTAATAGACTAAATAACGCCCATTTCTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGAttttt < 1:2692460/71‑1 (MQ=255) acacaGTGTTAATAGACTAAATAACGCCCATTTCTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTa > 1:59305/1‑70 (MQ=255) acacaGTGTTAATAGACTAAATAACGCCCATTTCTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTa > 1:4072912/1‑70 (MQ=255) acacaGTGTTAATAGACTAAATAACGCCCATTTCTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTa > 1:4935352/1‑70 (MQ=255) aataagttttaactcatacgcagttaataaaaccattccatatgaatggtcggtatcttattgccTTTaa < 1:2207735‑M1/5‑1 (MQ=255) ataagttttaactcatacgcagttaataaaaccattccatatgaatggtcggtatcttattgccTTTaaaa < 1:469923‑M1/7‑1 (MQ=255) taagttttaactcatacgcagttaataaaaccattccatatgaatggtcggtatcttattgccTTTaaaa < 1:811960‑M1/7‑1 (MQ=255) caGTGTTAATAGACTAAATAACGCCCATTTCTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAAt > 1:2563574/1‑71 (MQ=255) aagttttaactcatacgcagttaataaaaccattccatatgaatggtcggtatcttattgccTTTaaaa < 1:485601‑M1/7‑1 (MQ=255) aagttttaactcatacgcagttaataaaaccattccatatgaatggtcggtatcttattgccTTTaaaa < 1:1882962‑M1/7‑1 (MQ=255) aagttttaactcatacgcagttaataaaaccattccatatgaatggtcggtatcttattgccTTTaaa < 1:3555968‑M1/6‑1 (MQ=255) aGTGTTAATAGACTAAATAACGCCCATTTCTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAAt > 1:3482427/1‑70 (MQ=255) ttttaactcatacgcagttaataaaaccattccatatgaatggtcggtatcttattgccTTTaaaa < 1:1339659‑M1/7‑1 (MQ=255) aTAGACTAAATAACGCCCATTTCTTTTTCGTGAGCATAAGATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGttt < 1:1248904/71‑1 (MQ=255) ctcataagcagttaataaaaccattccatatgaatggtctgtatcttattgccTTTAAAATCACTGTTTTa > 1:720371‑M1/54‑71 (MQ=255) gACTAAATAACGCCCATTTCTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTa > 1:5218430/1‑70 (MQ=255) gACTAAATAACGCCCATTTCTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTa > 1:42718/1‑70 (MQ=255) aCTAAATAACGCCCATTTCTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTaaaa < 1:1644882/58‑1 (MQ=255) aCTAAATAACGCCCATTTCTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTaaaa < 1:4955472/58‑1 (MQ=255) aCTAAATAACGCCCATTTCTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTaaa < 1:1995612/71‑1 (MQ=255) tAAATAACGCCCATTTCTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGAttttt < 1:5138337/52‑1 (MQ=255) tAAATAACGCCCATTTCTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAgg > 1:5303818/1‑71 (MQ=255) tAAATAACGCCCATTTCTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAgg > 1:1353317/1‑71 (MQ=255) aaTAACGCCCATTTCTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGc > 1:650446/1‑70 (MQ=255) aaTAACGCCCATTTCTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGc > 1:2159734/1‑70 (MQ=255) aaTAACGCCCATTTCTTTTTCGTGAGCATAACATCACCTAAGCGATTTTTaa > 1:5166937/1‑52 (MQ=255) gcagttaataaaaccattccatatgaatggtcggtatcttattgccTTTaa > 1:1170369‑M1/47‑51 (MQ=255) aTAACGCCCATTTCTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGt > 1:3048652/1‑60 (MQ=255) gttaataaaaccattccatatgaatggtcggtatcttattgctTTTAAAATCACTGtttt > 1:1523792‑M1/44‑60 (MQ=255) aCGCCCATTTCTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGAttttt > 1:3672072/1‑46 (MQ=255) aCGCCCATTTCTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATaa < 1:4813556/71‑1 (MQ=255) aCGCCCATTTCTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATaa < 1:5308678/71‑1 (MQ=255) aCGCCCATTTCTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATa < 1:2405011/70‑1 (MQ=255) gCCCATTTCTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGa < 1:2879437/71‑1 (MQ=255) cATTTCTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAAt < 1:1614786/46‑1 (MQ=255) cATTTCTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATAc > 1:4216152/1‑71 (MQ=255) aaaaccattccatatgaatggtcggtatcttattgccTTTAAAATCACTGTTTTaa > 1:5090038‑M1/38‑56 (MQ=255) tttCTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGAtttt < 1:3418912/38‑1 (MQ=255) tttCTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTATAAAGGCAATAAGATAcc > 1:2285927/1‑70 (MQ=255) ttCTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGAttttt < 1:3332086/38‑1 (MQ=255) ttCTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCaa > 1:3006041/1‑60 (MQ=255) ttCTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATaa < 1:4561765/63‑1 (MQ=255) tCTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCa > 1:4087784/1‑44 (MQ=255) tCTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATAc > 1:2583991/1‑67 (MQ=255) tCTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGAc > 1:1498765/1‑71 (MQ=255) tCTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGAc > 1:4255566/1‑71 (MQ=255) cTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGAc > 1:914394/1‑70 (MQ=255) ttttCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCa > 1:2747588/1‑41 (MQ=255) ttttCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCAt > 1:4988456/1‑71 (MQ=255) tttCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAgg > 1:70404/1‑52 (MQ=255) tttCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGAcc < 1:673630/68‑1 (MQ=255) tttCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCAtt > 1:1131318/1‑71 (MQ=255) tttCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCAt < 1:5090482/70‑1 (MQ=255) ttcatatggaatggtcggtatcttattgccTTTAAAATCACTGtttt < 1:709648‑M1/17‑1 (MQ=255) tCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑Ca > 1:5004014/1‑71 (MQ=255) cGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑c < 1:2985043/69‑1 (MQ=255) cGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑Ca < 1:4636119/70‑1 (MQ=255) gTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑Cat < 1:2645790/70‑1 (MQ=255) gTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑Cat < 1:2639628/70‑1 (MQ=255) gTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑Cat < 1:5348342/70‑1 (MQ=255) tGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTa < 1:343435/43‑1 (MQ=255) gAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCAtt > 1:938836/1‑65 (MQ=255) gAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑Catat > 1:3656641/1‑70 (MQ=255) atgaatggtcggtatcttattgccTTTAAAATCACTGtt > 1:1195124‑M1/25‑39 (MQ=255) gCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTTTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑Cat < 1:1890822/66‑1 (MQ=255) aTAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑CATATg > 1:5355184/1‑67 (MQ=255) aTAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑CATATGGAAt < 1:3831462/71‑1 (MQ=255) tAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑CATATGGAATg > 1:1426322/1‑71 (MQ=255) aCATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAgg > 1:2463680/1‑39 (MQ=255) aCATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGCCAATAAGATACCGACCATTCCATAT‑GAATGGt < 1:2357523/71‑1 (MQ=255) cATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGc < 1:3790402/39‑1 (MQ=255) aTCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑CATATGGAATGGttt > 1:4745636/1‑71 (MQ=255) aTCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑CATATGGAATGGttt < 1:1883873/71‑1 (MQ=255) tCCCCTAAGCGATTTTTAAAATAACTGTTTTAAAGGCAATAAGAt > 1:2410831/1‑45 (MQ=255) cccTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑CATATGGAATGGTTtta < 1:264394/70‑1 (MQ=255) ccTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑CATATGGAATGGTTTTAT > 1:3392961‑M1/1‑70 (MQ=255) ccTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑CATATGGAATGGTTTTAT > 1:1113025‑M1/1‑70 (MQ=255) cTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑Ca < 1:1489908/53‑1 (MQ=255) cTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑CATATGGAATGGTTTTATTA < 1:930765‑M1/71‑1 (MQ=255) cTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑CATATGGAATGGTTTTATTA < 1:4542008‑M1/71‑1 (MQ=255) cTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑CATATGGAATGGTTTTATT > 1:4253076‑M1/1‑70 (MQ=255) tAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑CATATGGAATGGt < 1:335323/63‑1 (MQ=255) tAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑CATATGGAATGGTTTTATTAA > 1:5331646‑M1/1‑71 (MQ=255) tAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑CATATGGAATGGCTTTATTAA > 1:4243793‑M1/1‑71 (MQ=255) aaGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑CATATGGAATGGTTTTATTAAC > 1:4461723‑M1/1‑71 (MQ=255) aaGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCAACCATT‑CATATGGAATGGTTTTATTAAC > 1:4899088‑M1/1‑71 (MQ=255) aGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑CATATGGAATGGTTTTATTAACT > 1:5276768‑M1/1‑71 (MQ=255) aGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑CATATGGAATGGTTTTATTAACT < 1:4581350‑M1/71‑1 (MQ=255) gCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑CATATGGaa < 1:1064476/56‑1 (MQ=255) gATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑CATATGGAATGGTTTTATTAACTGCg < 1:1077076/71‑1 (MQ=255) gATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑CATATGGAATGGTTTTATTAACTGCg < 1:3997208/71‑1 (MQ=255) tttttAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑Catat > 1:2850233/1‑48 (MQ=255) tttttAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑CATATGGAATGGTTTTATTAACTGCGTa > 1:1224470/1‑71 (MQ=255) ttttAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGa > 1:177200/1‑37 (MQ=255) ttttAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑CATATGGAATGGttt > 1:4213272/1‑57 (MQ=255) ttttAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑CATATGGAATGGTTTTATT > 1:4824250‑M1/1‑61 (MQ=255) TTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑CATATg < 1:2807564‑M1/47‑1 (MQ=255) TTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑CATATGGAATGGTTTTATTAACTGCGTAt > 1:3258307‑M1/1‑70 (MQ=255) | CGCCACACAGTGTTAATAGACTAAATAACGCCCATTTCTTTTTCGTGAGCATAACATCCCCTAAGCGATTTTTAAAATCACTGTTTTAAAGGCAATAAGATACCGACCATT‑CATATGGAATGGTTTTATTAACTGCGTAT > W3110S.gb/3574383‑3574522 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |