New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | W3110S.gb | = 309393 | 84 (1.430) | 5 (0.090) | 3/100 | NT | 5.5% | coding (503/588 nt) | yagZ | conserved hypothetical protein |
? | W3110S.gb | = 309413 | 91 (1.590) | coding (483/588 nt) | yagZ | conserved hypothetical protein |
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
CGCCGCTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGATTGCTGGCATTGTAACCGTTAGCCAGCG > W3110S.gb/309346‑309483 | cgccgcTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCt > 1:3406563/1‑70 (MQ=255) cgccgcTCCAGATGCCTTCCGGAAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCg > 1:2332928/1‑68 (MQ=255) gccgcTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGAGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCtga > 1:5170255/1‑71 (MQ=255) cgcTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCtgatg < 1:3230111/71‑1 (MQ=255) cgcTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCtgatg < 1:5065397/71‑1 (MQ=255) gcTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCtgatga < 1:4936881/71‑1 (MQ=255) cTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTgatgat < 1:3338236/71‑1 (MQ=255) cTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTgatgat < 1:242992/71‑1 (MQ=255) tCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTgatgat < 1:3110256/70‑1 (MQ=255) ccAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCtgatga > 1:2909732/1‑68 (MQ=255) cAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGatgatg < 1:4881282/69‑1 (MQ=255) cAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGga < 1:2302793/71‑1 (MQ=255) aTGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGgag > 1:968684/1‑69 (MQ=255) tGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAg > 1:2273717/1‑71 (MQ=255) tGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAg > 1:1316066/1‑71 (MQ=255) gCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAgg > 1:513862/1‑71 (MQ=255) gCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAgg > 1:2697634/1‑71 (MQ=255) ccTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGaa < 1:5011197/68‑1 (MQ=255) ccTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGt > 1:4433320/1‑71 (MQ=255) ccTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGt < 1:2986957/71‑1 (MQ=255) cTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAgg > 1:3938761/1‑69 (MQ=255) ttCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGaa < 1:1469148/66‑1 (MQ=255) tCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGa > 1:3789106/1‑70 (MQ=255) tCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGa > 1:3618776/1‑70 (MQ=255) tCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGa > 1:3305253/1‑70 (MQ=255) ccGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGc < 1:4536442‑M2/51‑2 (MQ=255) ccGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGa < 1:3912748/69‑1 (MQ=255) cGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGaaa > 1:885960/1‑70 (MQ=255) gTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCa < 1:93865/71‑1 (MQ=255) tAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAAc < 1:5306206/68‑1 (MQ=255) tAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCAt < 1:692065/71‑1 (MQ=255) gagTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATcc > 1:1626682/1‑71 (MQ=255) agTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTg < 1:1104346/61‑1 (MQ=255) gTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGaaa > 1:528567/1‑63 (MQ=255) gTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCtg > 1:3934704/1‑71 (MQ=255) tGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCtgt < 1:4389932/71‑1 (MQ=255) tGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCtgt < 1:3772845/71‑1 (MQ=255) tGCTGTAATCAGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCtgt > 1:649691/1‑71 (MQ=255) tGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGt < 1:5130701/55‑1 (MQ=255) tAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCggt > 1:2346606/1‑71 (MQ=255) tAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCggt > 1:4165259/1‑71 (MQ=255) tAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCggt > 1:2607382/1‑71 (MQ=255) tAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCg < 1:4432039/69‑1 (MQ=255) aaTCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAAcc < 1:1601481/58‑1 (MQ=255) aTCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCt > 1:1899059/1‑62 (MQ=255) aTCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCggtgg > 1:4864901/1‑71 (MQ=255) aTCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCggtgg > 1:3830758/1‑71 (MQ=255) aTCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCggt > 1:5250554/1‑69 (MQ=255) gTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTAc < 1:2378310/70‑1 (MQ=255) ttACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGaaa < 1:5127363/50‑1 (MQ=255) ttACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTAc < 1:199566/69‑1 (MQ=255) ttACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGa < 1:4531349/71‑1 (MQ=255) tACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGAt > 1:307401/1‑71 (MQ=255) aCTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGAt < 1:4809911/70‑1 (MQ=255) cTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGAtt < 1:5070042/70‑1 (MQ=255) cTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGATTg < 1:4635599/71‑1 (MQ=255) cTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGATTg < 1:4929210/71‑1 (MQ=255) cGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGATTGCt < 1:1439944/70‑1 (MQ=255) ggtggtACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTTGTACGATTGCTg > 1:984775/1‑70 (MQ=255) ggtggtACCATTG‑TGGTACCAccgcagtaacagattacagcactct > 1:113239‑M2/1‑21 (MQ=255) gtggtACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGTTTGCTgg < 1:738530/70‑1 (MQ=255) tggtACCATTGGTGGTACCGccgcagtaacagattacagcactctaccgg > 1:774292‑M2/1‑20 (MQ=255) tggtACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAgg > 1:3723403/1‑36 (MQ=255) tggtACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGATTGCTGGCa < 1:618071/71‑1 (MQ=255) tggtACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGATTGCTGGCa > 1:1001753/1‑71 (MQ=255) tggtACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGATTGCTGGCa < 1:837438/71‑1 (MQ=255) gtACCATTGGTGGTATCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGATTGCTGGCAtt < 1:1810379/71‑1 (MQ=255) gtACCATTGGTGGTACCGccgcagtaacagattacagcactctaccggaa < 1:4988646‑M2/50‑33 (MQ=255) gtACCATTGGTGGTACCGccgcagtaacagattacagcactctaccggaa < 1:851708‑M2/50‑33 (MQ=255) gtACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCg < 1:4843434/51‑1 (MQ=255) tACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGATTg < 1:4628566/62‑1 (MQ=255) tACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGATTGCTGGCa < 1:5226608/68‑1 (MQ=255) tACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTCCGGTGGTACGATTg < 1:2629803/62‑1 (MQ=255) aCCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGAt > 1:700835/1‑59 (MQ=255) aCCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGATTg > 1:1424841/1‑61 (MQ=255) aCCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGATTg > 1:2320762/1‑61 (MQ=255) ccATTGGTGGTACCGcagtaacagattacagcactctaccggaaggcatctggagcggcgacgttagcgt > 1:848683‑M2/1‑15 (MQ=255) ccATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCggtgg < 1:3647332/52‑1 (MQ=255) cATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCtgt > 1:971183/1‑44 (MQ=255) cATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCgg > 1:4630227/1‑48 (MQ=255) cATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGATTGCTGGCATTGTaa > 1:3611748/1‑71 (MQ=255) cATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGATTGCTGGCATTGTaa < 1:2448403/71‑1 (MQ=255) aTTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCggtg < 1:3110459/49‑1 (MQ=255) aTTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCggtg < 1:340092/49‑1 (MQ=255) aTTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGATTGCTGGCATTGTAAc > 1:3219211/1‑71 (MQ=255) aTTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGATTGCTGGCATTGTAAc > 1:3409349/1‑71 (MQ=255) ttGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTAc < 1:2698646/52‑1 (MQ=255) ggtggtACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGATTGCTgg < 1:3030825/59‑1 (MQ=255) ggtggtACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGATTGCTGGCa > 1:4676728/1‑61 (MQ=255) ggtggtACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGATTGCTGGCAtt > 1:1596698/1‑63 (MQ=255) ggtggtACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGATTGCTGGCAtt > 1:3623949/1‑63 (MQ=255) ggtggtACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGATTGCTGGCATTGTAACCGt > 1:5260856/1‑71 (MQ=255) gtggtACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGATTGCTGGCATTGTAACCGt < 1:5272711/70‑1 (MQ=255) tggtACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGATTGCTGGCATTGTAACCGt < 1:3583146/69‑1 (MQ=255) tACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGATTGCTGGCATTGTAACCGTTAGcc < 1:4985347/71‑1 (MQ=255) ccGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGATTGCTg > 1:4262857/1‑51 (MQ=255) ccGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGATTGCTGGCATTGTAACCGTTAGCCAg < 1:3497585/71‑1 (MQ=255) cGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGATTGCTGGCATTGTAACCGTTAGCCAGc < 1:3017548/71‑1 (MQ=255) cGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGATTGCTGGCATTGTAACCGTTAGCCAGc < 1:21993/71‑1 (MQ=255) gCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGATTGCTGGCATTGTAACCGTTAGCCAGCg < 1:5065395/71‑1 (MQ=255) | CGCCGCTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGATTGCTGGCATTGTAACCGTTAGCCAGCG > W3110S.gb/309346‑309483 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |