| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 1675834 = | 64 (1.090) | 3 (0.060) | 3/90 | NT | 5.2% | coding (208/1035 nt) | ydgG | predicted inner membrane protein |
| ? | W3110S.gb | 1675857 = | 53 (1.030) | coding (231/1035 nt) | ydgG | predicted inner membrane protein | |||||
TCCGCTGGCGTGTGCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGACGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTC > W3110S.gb/1675790‑1675925 | tCCGCTGGCGTGTGCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGtt > 1:4500382/1‑70 (MQ=255) cGCTGGCGTGTGCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGc > 1:4085471/1‑70 (MQ=255) gCTGGCGTGTGCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTa < 1:4078307/71‑1 (MQ=255) cTGGCGTGTGCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTAt < 1:2926668/71‑1 (MQ=255) tGGCGTGTGCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTAt > 1:947264/1‑70 (MQ=255) tGGCGTGTGCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTAt > 1:762261/1‑70 (MQ=255) gCGTGTGCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTAtt < 1:2115397/69‑1 (MQ=255) gtgtGCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCt < 1:478160/71‑1 (MQ=255) tgCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCt < 1:668204/61‑1 (MQ=255) ccGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTa < 1:3692488/63‑1 (MQ=255) cgcgTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTg < 1:1842083/71‑1 (MQ=255) cgcgTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTg > 1:3574331/1‑71 (MQ=255) cgTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAg > 1:4076183/1‑61 (MQ=255) tACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTcc > 1:3720638/1‑71 (MQ=255) tACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTc < 1:2333633/70‑1 (MQ=255) cTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCcgc > 1:4326778/1‑71 (MQ=255) ggCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGATATTAGCTTATCTGGGTTCCgcgc > 1:4886228/1‑71 (MQ=255) gCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGgtgt > 1:5259560/1‑43 (MQ=255) gCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTa > 1:4861802/1‑48 (MQ=255) cGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTc < 1:2389112/71‑1 (MQ=255) ggTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCa < 1:258170/71‑1 (MQ=255) tgtCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAAc < 1:346523/71‑1 (MQ=255) tgtCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAAc > 1:4857517/1‑71 (MQ=255) gtCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCa < 1:2383778/68‑1 (MQ=255) gtCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAAc > 1:4785506/1‑70 (MQ=255) gtCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAAc > 1:3121881/1‑70 (MQ=255) tCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGc < 1:776445/40‑1 (MQ=255) tCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTAt < 1:2456171/51‑1 (MQ=255) tCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTAt < 1:81185/51‑1 (MQ=255) tCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCt < 1:1870800/53‑1 (MQ=255) tCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCt < 1:4839939/53‑1 (MQ=255) tCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACg < 1:2880390/70‑1 (MQ=255) tCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACg < 1:1481851/70‑1 (MQ=255) tCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGa < 1:362461/71‑1 (MQ=255) cGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGGTTATCt < 1:689389/52‑1 (MQ=255) gATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAg > 1:1596324/1‑44 (MQ=255) gATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGt < 1:2881881/71‑1 (MQ=255) gATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGt > 1:4219089/1‑71 (MQ=255) gATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGt < 1:4070105/71‑1 (MQ=255) gATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGt > 1:1669379/1‑71 (MQ=255) aTTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGtt < 1:5369414/71‑1 (MQ=255) ttttGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTg < 1:4985664/71‑1 (MQ=255) tttGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGtt > 1:2208916/1‑53 (MQ=255) tttGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGa > 1:2348034/1‑71 (MQ=255) tgatgaCCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGAc < 1:1697407/70‑1 (MQ=255) gatgaCCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCt < 1:2473713/45‑1 (MQ=255) gatgaCCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGAcg < 1:512230/70‑1 (MQ=255) tgaCCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGa > 1:5319389/1‑61 (MQ=255) tgaCCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGAcgcg > 1:3356023/1‑70 (MQ=255) tgaCCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGACGCgg < 1:5090444/71‑1 (MQ=255) accatcgccataacgatgatggtGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCTGCGCTCAACGAGTTGa > 1:2479231‑M2/24‑64 (MQ=255) CCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGtt > 1:3512980‑M1/1‑45 (MQ=255) catcgccatcacgatgatggtGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACg < 1:4080752‑M2/35‑1 (MQ=255) CATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGACGCGGACGt > 1:631466‑M1/1‑71 (MQ=255) tcgccatcacgatgatggtGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAg > 1:3340786‑M2/20‑56 (MQ=255) CATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGACGCGGACGt < 1:3814319‑M1/68‑1 (MQ=255) atcGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGACGCGGAc < 1:2640878/65‑1 (MQ=255) atcGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCAGCGCTCAACGAGTTGACGCGGACGTTAc < 1:1769585/70‑1 (MQ=255) tcGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTc < 1:2339227/47‑1 (MQ=255) cGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGAcgc > 1:2623922/1‑59 (MQ=255) gTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGACGCGGACGTTACCGc < 1:2701535/70‑1 (MQ=255) tGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCaa > 1:1191424/1‑46 (MQ=255) gATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCcgcg > 1:906281/1‑40 (MQ=255) aTGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGACGCGGACGTTACCGCAata < 1:725447/71‑1 (MQ=255) aTGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGACGCGGACGTTACCGCAata > 1:1287891/1‑71 (MQ=255) aTGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGACGCGGACGTTACCGCAata < 1:4647109/71‑1 (MQ=255) aTGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGACGCGGACGTTACCGCAata > 1:195132/1‑71 (MQ=255) aTGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGACGCGGACGTTACCGCAata > 1:1951202/1‑71 (MQ=255) aTGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGACGCGGACGTTACCGCAat < 1:4219401/70‑1 (MQ=255) aTGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGACGCGGACGTTACCGCAat < 1:929674/70‑1 (MQ=255) ggCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAg > 1:3860473/1‑46 (MQ=255) gCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGACGCGGACGTTACCGCAATATCg > 1:201538/1‑71 (MQ=255) gatggtGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTc < 1:4046373‑M2/31‑1 (MQ=255) tggtGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGACGCGGACGTTACCGCAATATCGCAAc > 1:3652427‑M2/5‑71 (MQ=255) gtGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGACGCGGACGTTACCGAAATATCGCAActc < 1:3492407‑M2/69‑1 (MQ=255) | TCCGCTGGCGTGTGCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGACGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTC > W3110S.gb/1675790‑1675925 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |