| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 1990175 = | 57 (0.970) | 3 (0.060) | 3/82 | NT | 6.5% | intergenic (‑280/‑184) | yecJ/yecR | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | W3110S.gb | 1990199 = | 41 (0.870) | intergenic (‑304/‑160) | yecJ/yecR | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
ATTGTCTTTGCGCTTATAATATGACAACCATCACAAAAATCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCAAAAAACAGCCCCCCTATTTCTGACACCTACAGATG > W3110S.gb/1990130‑1990264 | aTTGTCTTTGCGCTTATAATATGACAACCATCACAAAAATCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAAt < 1:2842271/70‑1 (MQ=255)aTTGTCTTTGCGCTTATAATATGACAACCATCACAAAAATCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAAt < 1:803847/70‑1 (MQ=255) gcgcTTATAATATGACAACCATCACAAAAATCAAACTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTa < 1:794513/70‑1 (MQ=255) cgcTTATAATATGACAACCATCACAAAAATCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAAt < 1:2403330/71‑1 (MQ=255) gcTTATAATATGACAACCATCACAAAAATCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAAt < 1:2074757/70‑1 (MQ=255) gcTTATAATATGACAACCATCACAAAAATCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATg < 1:482919/71‑1 (MQ=255) cTTATAATATGACAACCATCACAAAAATCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGt > 1:1176436/1‑71 (MQ=255) cTTATAATATGACAACCATCACAAAAATCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGt < 1:1833427/71‑1 (MQ=255) ttATAATATGACAACCATCACAAAAATCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGt > 1:1381815/1‑70 (MQ=255) ttATAATATGACAAACATCACAAAAATCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGt > 1:2358817/1‑70 (MQ=255) tataATATGACAACCATCACAAAAATCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATa > 1:103647/1‑57 (MQ=255) aataTGACAACCATCACAAAAATCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAAt > 1:2531943/1‑53 (MQ=255) aataTGACAACCATCACAAAAATCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTtata > 1:442278/1‑70 (MQ=255) aataTGACAACCATCACAAAAATCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTta > 1:2218849/1‑68 (MQ=255) atatGACAACCATCACAAAAATCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTTATaa > 1:3009190/1‑70 (MQ=255) tGACAACCATCACAAAAATCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTTATaaaaa < 1:5172422/70‑1 (MQ=255) tGACAACCATCACAAAAATCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTTATAAAAAt < 1:4886118/71‑1 (MQ=255) gACAACCATCACAATAATCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAAt < 1:512557/59‑1 (MQ=255) aaCCATCACAAAAATCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATa < 1:5005775/71‑1 (MQ=255) ccATCACAAAAATCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATa > 1:1997823/1‑44 (MQ=255) ccATCACAAAAATCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAAt > 1:1720528/1‑71 (MQ=255) ccATCACAAAAATCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAAt > 1:4682595/1‑71 (MQ=255) aTCACAAAAATCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATc > 1:2383526/1‑70 (MQ=255) aTCACAAAAATCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCa < 1:2616311/71‑1 (MQ=255) tCACAAAAATCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTaa > 1:3512994/1‑50 (MQ=255) tCACAAAAATCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCaa < 1:3563718/71‑1 (MQ=255) tCACAAAAATCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCaa < 1:4348350/71‑1 (MQ=255) tCACAAAAATCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCaa < 1:1812088/71‑1 (MQ=255) tCACAAAAATCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCa > 1:2814698/1‑70 (MQ=255) tCACAAAAATCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCa > 1:1424911/1‑70 (MQ=255) cacaAAAATCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCaa > 1:414065/1‑70 (MQ=255) acaAAAATCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATa > 1:2171212/1‑39 (MQ=255) caAAAATCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCaaaa > 1:1406619/1‑70 (MQ=255) caAAAATCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCaaaa > 1:1544382/1‑70 (MQ=255) aaaaaTCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTa < 1:3147758/45‑1 (MQ=255) aaaaaTCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTa < 1:1350627/45‑1 (MQ=255) aaaaaTCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTTATaaaa < 1:3718217/56‑1 (MQ=255) aaaaaTCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCaaaaaa > 1:2717798/1‑71 (MQ=255) aaaaaTCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCaaaaaa < 1:455191/71‑1 (MQ=255) aaaaaTCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCaaaaaa > 1:2040533/1‑71 (MQ=255) aaaaaTCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCaaaaaa > 1:5260617/1‑71 (MQ=255) aaaaTCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCAAAAAAc < 1:944146/71‑1 (MQ=255) aaaaTCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCAAAAAAc < 1:938499/71‑1 (MQ=255) aaaaTCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCAAAAAAc < 1:356175/71‑1 (MQ=255) aaaaTCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCAAAAAAc < 1:2884725/71‑1 (MQ=255) aaaTCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCaaaaaa > 1:5032184/1‑69 (MQ=255) caatcTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCAAAAAACAGccc > 1:1803324/1‑71 (MQ=255) tatgtgatttgtatcacataaaTACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATaa > 1:3527784‑M2/23‑50 (MQ=255) TATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCAAAAAACAGCCCCCCTAtt < 1:2867722‑M1/71‑1 (MQ=255) atgtgatttgtatcacataaaTACCCCTTTAATGTTATaaaaa < 1:1969794‑M2/22‑1 (MQ=255) gtgatttgtatcacataaaTACCCCTTTAATGTTATAAAAATGa > 1:3289930‑M2/20‑44 (MQ=255) TACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCa > 1:4502569‑M1/1‑46 (MQ=255) TACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCAAAAAACAGCCCCCCTATTTCTGaca > 1:5164588‑M1/1‑71 (MQ=255) aCAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCAAAAAACAGcccc > 1:2922439/1‑57 (MQ=255) aCAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCAAAAAACAGCCCCCCTATTTCTGacac > 1:3166269/1‑71 (MQ=255) aCAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCAAAAAACAGCCCCCCTATTTCTGacac > 1:3768891/1‑71 (MQ=255) cAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCAAAAAACAGCCCCCCTATTTCTGACAcc < 1:1156600/71‑1 (MQ=255) atcacataaaTACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCAAAAAACAGCCCCCCTATTTCTGACACCTa > 1:2047065‑M2/11‑70 (MQ=255) acataaaTACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCAAAAAACAGCCCCCCTATTTCTGACACCTACAg < 1:3240398‑M2/63‑1 (MQ=255) acataaaTACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCAAAAAACAGCCCCCCTATTTCTGACACCTACAg < 1:5160621‑M2/63‑1 (MQ=255) acataaaTACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCAAAAAACAGCCCCCCTATTTCTGACACCTACAg < 1:900338‑M2/63‑1 (MQ=255) acataaaTACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCAAAAAACAGCCCCCCTATTTCTGACACCTACAGa < 1:451034‑M2/64‑1 (MQ=255) ataaaTACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCAAAAAACAGCCCCCCTATTTCt < 1:4473701‑M2/52‑1 (MQ=255) ataaaTACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCAAAAAACAGCCCCCCTATTTCTGACACCTACAGATg < 1:4670325‑M2/66‑1 (MQ=255) aaaTACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCaaaaa < 1:2382297‑M2/35‑1 (MQ=255) aaaTACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCaaaaa < 1:1165320‑M2/35‑1 (MQ=255) tACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCAAAAAACAGCCCCCCTAttt < 1:4491392/50‑1 (MQ=255) | ATTGTCTTTGCGCTTATAATATGACAACCATCACAAAAATCAATCTTTATGTGATACAAATCACATAAATACCCCTTTAATGTTATAAAAATGATAATCAAAAAACAGCCCCCCTATTTCTGACACCTACAGATG > W3110S.gb/1990130‑1990264 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |