| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 2423050 = | 28 (0.480) | 3 (0.060) | 3/90 | NT | 9.1% | coding (524/1521 nt) | yfcC | predicted inner membrane protein |
| ? | W3110S.gb | 2423074 = | 35 (0.680) | coding (548/1521 nt) | yfcC | predicted inner membrane protein | |||||
CTTGGCGGCGCGGTATTTGGTATGGGAGAAGAGGCCGTCGCCTTTGCCATTATCATCGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGT > W3110S.gb/2423004‑2423144 | cTTGGCGGCGCGGTATTTGGTATGGGAGAAGAGGCCGTCGCCTTTGCCATTATCATCGCACCGCTAATGGt < 1:1428390/71‑1 (MQ=255) ggcgCGGTATTTGGTATGGGAGAAGAGGCCGTCGCCTTTGCCATTATCATCGCACCGCTAATGGTCCGGCt < 1:3101241/71‑1 (MQ=255) ggcgCGGTATTTGGTATGGGAGAAGAGGCCGTCGCCTTTGCCATTATCATCGCACCGCTAATGGTCCGGCt > 1:309093/1‑71 (MQ=255) caccaggacggtggtaatactgtcatagcccagccggaCCATTATCATCGCACCGCTAATGGTcc < 1:817247‑M1/27‑1 (MQ=255) gcgGTATTTGGTATGGGAGAAGAGGCCGTCGCCTTTGCCATTATCATCGCACCGCTAATGGTCCGGCTggg > 1:3763665/1‑71 (MQ=255) ggTATTTGGTATGGGAGAAGAGGCCGTCGCCTTTGCCATTATCATCGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGc > 1:2478910/1‑70 (MQ=255) ggTATTTGGTATGGGAGAAGAGGCCGTCGCCTTTGCCATTATCATCGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGc > 1:17098/1‑70 (MQ=255) ttGGTATGGGAGAAGAGGCCGTCGCCTTTGCCATTATCATCGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGa > 1:3469625/1‑70 (MQ=255) tGGTATGGGAGAAGAGGCCGTCGCCTTTGCCATTATCATCGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGAc < 1:1885325/70‑1 (MQ=255) ggTATGGGAGAAGAGGCCGTCGCCTTTGCCATTATCATCGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACa < 1:1083031/70‑1 (MQ=255) ggTATGGGAGAAGAGGCCGTCGCCTTTGCCATTATCATCGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACa < 1:3938655/70‑1 (MQ=255) tATGGGAGAAGAGGCCGTCGCCTTTGCCATTATCATCGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTa < 1:4767871/71‑1 (MQ=255) aTGGGAGAAGAGGCCGTCGCCTTTGCCATTATCATCGCACCGCTAATGGTCCGGCTg < 1:1785233/57‑1 (MQ=255) tGGGAGAAGAGGCCGTCGCCTTTGCCATTATCATCGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTAt < 1:2642883/70‑1 (MQ=255) gaagaGGCCGTCGCCTTTGCCATTATCATCGCACCGCTAATGGt > 1:3467413/1‑44 (MQ=255) agagGCCGTCGCCTTTGCCATTATCATCGCACCGCTAATGGGCCGGCTGGGCTATGACa < 1:362350/59‑1 (MQ=255) gagGCCGTCGCCTTTGCCATTATCATCGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTa < 1:3632074/64‑1 (MQ=255) gTCGCCTTTGCCATTATCATCGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGAc < 1:1489792/51‑1 (MQ=255) gTCGCCTTTGCCATTATCATCGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGAAAGTATTACCACCGTCCTGGt < 1:567624/71‑1 (MQ=255) cGCCTTTGCCATTATCATCGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGa > 1:2158130/1‑71 (MQ=255) tttGCCATTATCATCGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTg < 1:3141815/66‑1 (MQ=255) tttGCCATTATCATCGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCta > 1:1706430/1‑71 (MQ=255) ttGCCATTATCATCGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCta > 1:1934014/1‑70 (MQ=255) ggaccattagcggtgcgatgataatggTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTg < 1:817247‑M2/38‑1 (MQ=255) tGCCATTATCATCGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGa > 1:4619743/1‑42 (MQ=255) tGCCATTATCATCGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCtata > 1:3241146/1‑71 (MQ=255) tGCCATTATCATCGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCtata > 1:1343697/1‑71 (MQ=255) tGCCATTATCATCGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCtata > 1:4537741/1‑71 (MQ=255) cattagcggtgcgatgataatggTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCt < 1:4639154‑M2/42‑1 (MQ=255) CATTATCATCGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGa > 1:1022832‑M1/1‑62 (MQ=255) CATTATCATCGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATAtt > 1:5341476‑M1/1‑70 (MQ=255) CATTATCATCGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTg > 1:1503637‑M1/1‑71 (MQ=255) ATTATCATCGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACa < 1:1959294‑M1/40‑1 (MQ=255) ATTATCATCGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTa > 1:3029756‑M1/1‑43 (MQ=255) ttagcggtgcgatgataatggTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCtat > 1:2145120‑M2/22‑65 (MQ=255) TTATCATCGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGt > 1:4285380‑M1/1‑41 (MQ=255) TTATCATCGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGcc > 1:1881806‑M1/1‑71 (MQ=255) ATCATCGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTcc > 1:2967703‑M1/1‑52 (MQ=255) ATCATCGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTgg < 1:3963443‑M1/55‑1 (MQ=255) ATCATCGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGt > 1:4059432‑M1/1‑56 (MQ=255) catcGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTcc > 1:1290289/1‑50 (MQ=255) atcGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGc < 1:4785882/70‑1 (MQ=255) atcGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGc < 1:3696480/70‑1 (MQ=255) tcGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGc > 1:2538397/1‑69 (MQ=255) tcGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCa > 1:2481822/1‑70 (MQ=255) cGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTac > 1:5090191/1‑39 (MQ=255) cGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTc > 1:959278/1‑46 (MQ=255) cGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCaaa > 1:4103757/1‑71 (MQ=255) gCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAAt < 1:2555970/71‑1 (MQ=255) cACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGa > 1:3463383/1‑51 (MQ=255) cACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCaaa < 1:4216511/69‑1 (MQ=255) aCCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCta < 1:3934065/54‑1 (MQ=255) cGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGt < 1:272691/46‑1 (MQ=255) gCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGa > 1:502528/1‑47 (MQ=255) gCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGa > 1:1009361/1‑47 (MQ=255) cTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGttt < 1:5078886/71‑1 (MQ=255) cTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGtt < 1:2242751/70‑1 (MQ=255) taatggTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTg < 1:1666396‑M2/35‑1 (MQ=255) taatggTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGtttt > 1:1925034‑M2/7‑71 (MQ=255) taatggTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGtttt > 1:4331595‑M2/7‑71 (MQ=255) aatggTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCt < 1:613496‑M2/34‑1 (MQ=255) tggTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGAc > 1:4163506‑M2/4‑43 (MQ=255) tggTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGtt < 1:4606141‑M2/63‑1 (MQ=255) ggTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGc > 1:2987259‑M2/3‑69 (MQ=255) gTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTA‑CACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGt < 1:889114‑M2/70‑1 (MQ=255) tCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGt < 1:4950824/71‑1 (MQ=255) | CTTGGCGGCGCGGTATTTGGTATGGGAGAAGAGGCCGTCGCCTTTGCCATTATCATCGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGT > W3110S.gb/2423004‑2423144 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |