| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 2629540 | 24 (0.410) | 3 (0.060) | 3/90 | NT | 11.5% | intergenic (+19/+74) | yfgI/guaA | conserved hypothetical protein/GMP synthetase |
| ? | W3110S.gb | = 2629551 | 25 (0.480) | intergenic (+30/+63) | yfgI/guaA | conserved hypothetical protein/GMP synthetase | |||||
CAAAGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTGCAGGGTCAAATCATT > W3110S.gb/2629482‑2629618 | cAAAGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTc < 1:4924018/70‑1 (MQ=255) aaGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCtt < 1:4629023‑M2/70‑3 (MQ=255) aaGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCtt < 1:2403791‑M2/70‑3 (MQ=255) aaGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCtt < 1:4067033‑M2/70‑3 (MQ=255) aaGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGCTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCttg > 1:2049711‑M2/1‑68 (MQ=255) aGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCttg < 1:4886902‑M2/70‑4 (MQ=255) gaagaGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCtt > 1:3653538‑M2/1‑63 (MQ=255) aagaGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGa < 1:4308826/69‑1 (MQ=255) gagaACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCttgaag < 1:1251005‑M2/66‑7 (MQ=255) agaACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATaaaa < 1:2652445/71‑1 (MQ=255) aCAAATCGGAGAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATaaaa < 1:1731428/68‑1 (MQ=255) cAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAAcc < 1:3291798/71‑1 (MQ=255) cAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAAcc > 1:3808778/1‑71 (MQ=255) cAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAAcc > 1:95475/1‑71 (MQ=255) aaaTCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCtt < 1:4099979‑M2/56‑3 (MQ=255) aTCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCttgaa < 1:233010‑M2/57‑6 (MQ=255) aTCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCctc < 1:2512258/71‑1 (MQ=255) ggACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTg < 1:3529079/70‑1 (MQ=255) aCAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTgtag > 1:996477/1‑71 (MQ=255) cAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTgtagt < 1:4766854/71‑1 (MQ=255) ggTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCttga < 1:2519228‑M2/45‑5 (MQ=255) gTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACag < 1:2098785/70‑1 (MQ=255) gTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACa < 1:2609350/69‑1 (MQ=255) tttAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCttga < 1:2817231‑M2/43‑5 (MQ=255) tttAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCt > 1:1724800‑M2/1‑39 (MQ=255) taattaatCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAggg > 1:569760/1‑71 (MQ=255) aattaatCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGt > 1:3423601/1‑71 (MQ=255) taatCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATaa < 1:802998/43‑1 (MQ=255) tCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGtt < 1:4950127/71‑1 (MQ=255) cGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGtt > 1:3661752/1‑70 (MQ=255) tGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGttcatt > 1:3919264/1‑71 (MQ=255) aGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGttcattca > 1:2147785/1‑69 (MQ=255) aCTTCAATCCTATAATTCttgaagttactaacatcgattaattaaaccagctgtccgat > 1:492190‑M2/1‑18 (MQ=255) aCTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTg < 1:3783132/70‑1 (MQ=255) aCTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTGc < 1:1914025/71‑1 (MQ=255) cTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTGCa < 1:4775190/71‑1 (MQ=255) tCAATCCTATAATTCttgaagttactaacatcgatt > 1:3252666‑M2/1‑15 (MQ=255) cAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTaa > 1:1497989/1‑41 (MQ=255) cAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTg > 1:5349575/1‑66 (MQ=255) cAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTGCAgg < 1:1300095/70‑1 (MQ=255) aaTCCTATAATTCttgaagttactaacatcgattaa < 1:3821901‑M2/36‑24 (MQ=255) cTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTGCAGGGTCaaa > 1:4867126/1‑71 (MQ=255) taATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACaga < 1:268029/37‑1 (MQ=255) aaTTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTGCAGGGTCAAATCa < 1:893504/70‑1 (MQ=255) aTTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTGCAGTGTCAAATCAt < 1:2020226/70‑1 (MQ=255) aTTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTGCAGGGTCAAATCAtt < 1:2667302/71‑1 (MQ=255) | CAAAGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTGCAGGGTCAAATCATT > W3110S.gb/2629482‑2629618 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |