| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 4380978 = | 55 (0.940) | 3 (0.060) | 3/94 | NT | 5.1% | intergenic (+31/‑21) | efp/ecnA | Elongation factor EF‑P/entericidin A membrane lipoprotein, antidote entericidin B |
| ? | W3110S.gb | 4381002 = | 61 (1.130) | coding (4/126 nt) | ecnA | entericidin A membrane lipoprotein, antidote entericidin B | |||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
GCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTCGCGGTTT > W3110S.gb/4380937‑4381072 | gcgTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGAtgatga < 1:5006639/69‑1 (MQ=255)gcgTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGaaa > 1:2363782/1‑71 (MQ=255) aGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACATATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCt > 1:1207342/1‑70 (MQ=255) gTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTa > 1:1284018/1‑71 (MQ=255) aaTGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAgatgat < 1:534124/58‑1 (MQ=255) aTGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCg > 1:4491343/1‑71 (MQ=255) tGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGAtgatga < 1:5241792/58‑1 (MQ=255) gCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCg > 1:659550/1‑69 (MQ=255) cGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTc > 1:2878355/1‑71 (MQ=255) ttGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTg < 1:913076/71‑1 (MQ=255) ttGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTg > 1:4517918/1‑71 (MQ=255) ttGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTg < 1:2599028/71‑1 (MQ=255) tgtgGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGt > 1:4635594/1‑71 (MQ=255) gtggtgCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGAtgatga < 1:2285521/51‑1 (MQ=255) gtggtgCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGtt > 1:163854/1‑71 (MQ=255) gtggtgCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGt < 1:4603347/70‑1 (MQ=255) gtggtgCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTAAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGt < 1:1968983/70‑1 (MQ=255) tggtgCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGtt < 1:3888567/70‑1 (MQ=255) tgCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGcc < 1:4626114/53‑1 (MQ=255) tgCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGcc < 1:308992/53‑1 (MQ=255) gCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTttgct > 1:3171806/1‑71 (MQ=255) gCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTttgct > 1:4932801/1‑71 (MQ=255) cGGCCTGCAGGCTGCACCATGACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTttgctt > 1:4952484/1‑71 (MQ=255) cGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTttgctt > 1:81770/1‑71 (MQ=255) tGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGaa > 1:3929957/1‑41 (MQ=255) tGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATc > 1:2659596/1‑51 (MQ=255) gCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTttg > 1:5271279/1‑62 (MQ=255) gCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAg > 1:1879959/1‑70 (MQ=255) cAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAg < 1:2555371/69‑1 (MQ=255) cAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAg < 1:1601679/69‑1 (MQ=255) cAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCa > 1:3779185/1‑71 (MQ=255) aGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCa > 1:148072/1‑67 (MQ=255) aGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCAc > 1:1614736/1‑71 (MQ=255) gCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGc > 1:3430178/1‑67 (MQ=255) gCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACgc < 1:31701/71‑1 (MQ=255) gCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACgc < 1:5203093/71‑1 (MQ=255) gCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACg > 1:3816728/1‑70 (MQ=255) tGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACgctg > 1:1889990/1‑71 (MQ=255) aCCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGtt < 1:2782230/50‑1 (MQ=255) CATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACgctg < 1:4228247‑M1/66‑1 (MQ=255) CATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACTCTGCTCAc > 1:2490780‑M1/1‑71 (MQ=255) CATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCAc < 1:4783759‑M1/71‑1 (MQ=255) CATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCAc > 1:4665027‑M1/1‑71 (MQ=255) CATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCAc < 1:4337973‑M1/71‑1 (MQ=255) CATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCAc > 1:1955541‑M1/1‑71 (MQ=255) CATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCAc < 1:1004771‑M1/71‑1 (MQ=255) atctctgacctgaataagtgatgATGAAACGCCTTATc < 1:354112‑M2/15‑1 (MQ=255) ATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACg < 1:2541619‑M1/71‑1 (MQ=255) TCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGtt > 1:3948583‑M1/1‑46 (MQ=255) TCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGt > 1:2744230‑M1/1‑45 (MQ=255) TCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTTCCAGCACGCTGCTCACgg < 1:4138459‑M1/71‑1 (MQ=255) TCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCa < 1:4131134‑M1/59‑1 (MQ=255) ctctgacctgaataagtgatgATGAAACGCCTTATCGTTCTTg < 1:3180346‑M2/22‑1 (MQ=255) CACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACggg < 1:1343163‑M1/71‑1 (MQ=255) cTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCt < 1:2739700/71‑1 (MQ=255) ttATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGtt < 1:1844375/36‑1 (MQ=255) ttATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTg > 1:2888703/1‑71 (MQ=255) ttATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTg > 1:854932/1‑71 (MQ=255) acctgaataagtgatgGTGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGt < 1:1279304‑M2/54‑1 (MQ=255) aTTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGTACGCTGCTCACGGGCTGt < 1:4228764/70‑1 (MQ=255) aTTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACggg > 1:5302102/1‑66 (MQ=255) aTTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGt < 1:2423726/70‑1 (MQ=255) aTTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGt < 1:1991264/70‑1 (MQ=255) aTTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGt > 1:4543455/1‑70 (MQ=255) aTTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGt > 1:4624225/1‑70 (MQ=255) aTTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGATTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCa > 1:1933671/1‑62 (MQ=255) ttCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTaa < 1:3950649/71‑1 (MQ=255) tCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAg < 1:3483716/49‑1 (MQ=255) cAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCa > 1:3247629/1‑50 (MQ=255) cAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAaca > 1:5207808/1‑71 (MQ=255) cAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAac < 1:1412535/70‑1 (MQ=255) cAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAac < 1:1453135/70‑1 (MQ=255) aGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACgc < 1:547502/52‑1 (MQ=255) aGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAaca < 1:1097511/70‑1 (MQ=255) aGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAac < 1:955128/69‑1 (MQ=255) ggTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACggg < 1:922165/61‑1 (MQ=255) gTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGtttt < 1:3103800/36‑1 (MQ=255) gTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCAc < 1:54585/48‑1 (MQ=255) gTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCAc < 1:3960706/57‑1 (MQ=255) cAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACgc > 1:1161611/1‑48 (MQ=255) cAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCt > 1:5162075/1‑71 (MQ=255) cAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCt > 1:2541922/1‑71 (MQ=255) cAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCCCACGGGCTGTAACACCGCt > 1:5321991/1‑71 (MQ=255) agagATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGt > 1:606106/1‑61 (MQ=255) agagATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAaca > 1:4749968/1‑65 (MQ=255) agagATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTc < 1:1733665/71‑1 (MQ=255) agagATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTc > 1:4595986/1‑71 (MQ=255) agagATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTc > 1:1340657/1‑71 (MQ=255) agagATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTc > 1:4922529/1‑71 (MQ=255) agagATGATGAAACGCCTTATCGTTCATGTTTTGCTTGcc > 1:4695079/1‑40 (MQ=255) gagaTGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTcg > 1:517029/1‑71 (MQ=255) agaTGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAg > 1:952731/1‑40 (MQ=255) agaTGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTcgc > 1:1459277/1‑71 (MQ=255) gatgATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTc < 1:1071291‑M2/64‑1 (MQ=255) atgATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTcgcg > 1:1337460‑M2/4‑70 (MQ=255) tgATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACgg < 1:2490061‑M2/49‑1 (MQ=255) gATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTcg > 1:5045844‑M2/2‑66 (MQ=255) atgaAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCAc < 1:3269239/47‑1 (MQ=255) atgaAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTCGCGGttt < 1:5296648/71‑1 (MQ=255) atgaAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTCGCGGttt < 1:4187814/71‑1 (MQ=255) | GCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTCGCGGTTT > W3110S.gb/4380937‑4381072 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |