| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 477242 = | 51 (0.830) | 12 (0.260) +CAAAGGTAAAAT |
3/74 | NT | 24.1% | intergenic (+176/‑671) | mngB/cydA | alpha‑mannosidase/cytochrome d terminal oxidase, subunit I |
| ? | minE | 1746968 = | 50 (0.810) | intergenic (+52/+157) | srmB/yfiE | ATP‑dependent RNA helicase/predicted DNA‑binding transcriptional regulator | |||||
ACGACAGAAGAGTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAATATATTGAATTTGCACGATCTTGT > minE/1746902‑1747034 | aCGACAGAAGAGTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCt < 1:5145793/71‑1 (MQ=255) agagTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATgcgc > 1:4267690/1‑70 (MQ=255) gagTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTa > 1:4747885/1‑71 (MQ=255) aTCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGTAAAACTGCCTGATGCGCTACGCtt < 1:3215708/71‑1 (MQ=255) tcAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTAt > 1:455209/1‑70 (MQ=255) tcAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTAt > 1:344001/1‑70 (MQ=255) tcAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTAt > 1:5052720/1‑70 (MQ=255) aaTGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTAt < 1:4911505/68‑1 (MQ=255) aaTGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATc < 1:5286222/69‑1 (MQ=255) aaTGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAg > 1:2582149/1‑71 (MQ=255) ccAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTa < 1:3700031/63‑1 (MQ=255) ccAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTa < 1:2049087/63‑1 (MQ=255) ccAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTa < 1:3393966/63‑1 (MQ=255) cAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTa < 1:1012595/62‑1 (MQ=255) gTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCt < 1:583771/57‑1 (MQ=255) gTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGt < 1:3926903/71‑1 (MQ=255) ttAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTgg > 1:975318/1‑71 (MQ=255) ttAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTgg > 1:216265/1‑71 (MQ=255) tAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAg > 1:3534948/1‑60 (MQ=255) aaGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGc < 1:2335264/70‑1 (MQ=255) aGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCt > 1:3889713/1‑70 (MQ=255) aGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTc < 1:3397245/71‑1 (MQ=255) cgcggcttgagactgatgacaaaggtaaaatTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTa > 1:2086626‑M2/32‑60 (MQ=255) tGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTAc < 1:1088971/60‑1 (MQ=255) gcggcttgagactgatgacaaaggtaaaatTGCCTGATGCGCTACGCTTATCa > 1:2247114‑M2/31‑53 (MQ=255) gcggcttgagactgatgacaaaggtaaaatTGCCTGATGCGCTACGCTTATCa > 1:3714582‑M2/31‑53 (MQ=255) gcggcttgagactgatgacaaaggtaaaatTGCCTGATGCGCTACGCTTATCa > 1:5023272‑M2/31‑53 (MQ=255) gcggcttgagactgatgacaaaggtaaaatTGCCTGATGCGCTACGCTTATCa > 1:4223045‑M2/31‑53 (MQ=255) gcggcttgagactgatgacaaaggtaaaatTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACATGGCCCATGc < 1:3883591‑M2/41‑1 (MQ=255) gcggcttgagactgatgacaaaggtaaaatTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACATGGCCCATGc < 1:2736229‑M2/41‑1 (MQ=255) gcggcttgagactgatgacaaaggtaaaatTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACATGGCCCATGc < 1:4351900‑M2/41‑1 (MQ=255) cggcttgagactgatgacaaaggtaaaatTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACATGGCCCATGCa < 1:4894872‑M2/42‑1 (MQ=255) gTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCa < 1:2254159/70‑1 (MQ=255) gTATTAAAAGTGCAGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCa < 1:4626023/70‑1 (MQ=255) aTTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAata > 1:2821384/1‑71 (MQ=255) ttAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTAt < 1:4055942/46‑1 (MQ=255) ttAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCa > 1:3672206/1‑48 (MQ=255) ttAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATg < 1:5125618/65‑1 (MQ=255) aaaaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCtt > 1:1047036/1‑42 (MQ=255) aaaaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAgg > 1:2715959/1‑48 (MQ=255) aaaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAatatat < 1:3474954/70‑1 (MQ=255) gactgatgacaaaggtaaaatTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACATGGCCCATGCaa > 1:3005596‑M2/22‑64 (MQ=255) aaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAATATATTg < 1:796947/71‑1 (MQ=255) actgatgacaaaggtaaaatTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACATGGCCCATGCAATGTATTGa < 1:2818381‑M2/51‑1 (MQ=255) actgatgacaaaggtaaaatTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACATGGCCCATGCAATGTATTGa < 1:2292355‑M2/51‑1 (MQ=255) gTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAatata < 1:2024131/66‑1 (MQ=255) gTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAATATATTGaa < 1:2751358/71‑1 (MQ=255) gTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAATATATTGa < 1:3473074/70‑1 (MQ=255) tGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAg < 1:3306421/42‑1 (MQ=38) tGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAATATATTGAAt < 1:5074793/71‑1 (MQ=255) cTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAATATATTGAAttt > 1:1283976/1‑71 (MQ=255) tgacaaaggtaaaatTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACATGGCCCATGCAATGTATTGAATTTg < 1:1024386‑M2/56‑1 (MQ=255) tGGCAACCGCAAAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCa > 1:1349610/1‑38 (MQ=11) tGGCAACCGCAAAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCa > 1:2112509/1‑38 (MQ=11) tGGCAACCGCAAAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCa > 1:2465416/1‑38 (MQ=11) gCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAATATATTGAATTTGc < 1:1178496/70‑1 (MQ=255) gCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAATATATTGAATTTGc < 1:4691263/70‑1 (MQ=255) aaaggtaaaatTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACATGGCCCATGCaa > 1:3650503‑M2/12‑54 (MQ=255) aCGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAATATATTGAATTTGCACGa > 1:3973708/1‑70 (MQ=255) aCGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAATATATTGAATTTGCACGAt > 1:4283624/1‑71 (MQ=255) aCGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAATATATTGAATTTGCACGAt > 1:1613768/1‑71 (MQ=255) aCGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAATATATTGAATTTGCACGAt > 1:1474693/1‑71 (MQ=255) cGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAATATATTGAATTTGCACGATc < 1:947765/71‑1 (MQ=255) cGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAATATATTGAATTTGCACGATc < 1:5576898/71‑1 (MQ=255) gtaaaatTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACATGGCCCATGCAATGTATTGaa < 1:1234328‑M2/52‑1 (MQ=255) gtaaaatTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACATGGCCCATGCAATGTATTGAAttt < 1:289721‑M2/55‑1 (MQ=255) gCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAATATATTGAATTTGCACGATCt < 1:3997055/71‑1 (MQ=255) aaaatTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACATGGCCCATGCAATGTATTGAAtt > 1:392972‑M2/6‑59 (MQ=255) aaaatTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACATGGCCCATGCAATGTATTGAATTTGc > 1:4729318‑M2/6‑62 (MQ=255) aaaatTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACATGGCCCATGCAATGTATTGAATTTGCAc > 1:4841015‑M2/6‑64 (MQ=255) aaaaCTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAATATATTGAATTTGCACGATCTTg < 1:5417556/71‑1 (MQ=255) aaatTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACATGGCCCATGCAATGTATTGAATTTGCACGCTTTTGt < 1:3822201‑M2/67‑1 (MQ=255) aaaCTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCa < 1:3118839/46‑1 (MQ=255) aaaCTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAATATATTGAATTTGCACGATCTTGt < 1:5319875/71‑1 (MQ=255) aaaCTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAATATATTGAATTTGCACGATCTTGt < 1:1747399/71‑1 (MQ=255) aaaCTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAATAAATTGTATTTGCACGATCTTGt < 1:2638081/71‑1 (MQ=255) aaCTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAATATATTGAATTTGCACGATCTTg > 1:1255450/1‑69 (MQ=255) tGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAATATATTGAATTTGCACGa < 1:4109525/61‑1 (MQ=255) tGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAATATATTGAATTTGCAAGa < 1:1051562/61‑1 (MQ=255) tGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACATGGCCCATGCAATGTATTGAATTTg > 1:1216731/1‑56 (MQ=14) tGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACATGGCCCATGCAATGTATTGAATTTGc > 1:3313732/1‑57 (MQ=14) | ACGACAGAAGAGTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAATATATTGAATTTGCACGATCTTGT > minE/1746902‑1747034 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |