| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | minE | 2,220,151 | G→C | 7.4% | intergenic (+411/‑567) | yhdH → / → accB | predicted oxidoreductase, Zn‑dependent and NAD(P)‑binding/acetyl CoA carboxylase, BCCP subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | minE | 2,220,151 | 0 | G | C | 7.4% | 277.6 / 9.4 | 94 | intergenic (+411/‑567) | yhdH/accB | predicted oxidoreductase, Zn‑dependent and NAD(P)‑binding/acetyl CoA carboxylase, BCCP subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (48/39); new base C (4/3); total (52/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.71e-01 | |||||||||||
TGAGCATTGTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCTTGTCGCGATCCTGGCATCCCTACATTATTT > minE/2220081‑2220219 | tGAGCATTGTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTg > 1:4081791/1‑71 (MQ=255)tGAGCATTGTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTg > 1:240438/1‑71 (MQ=255)tGAGCATTGTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTg > 1:5572976/1‑71 (MQ=255) gCATTGTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTggg > 1:1358528/1‑70 (MQ=255) gCATTGTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTggg > 1:4081054/1‑70 (MQ=255) aTTGTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGt < 1:1154700/69‑1 (MQ=255) aTTGTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTaa < 1:4585115/71‑1 (MQ=255) gTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATcc > 1:4129086/1‑71 (MQ=255) gTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATcc > 1:3215650/1‑71 (MQ=255) gTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATcc > 1:3547341/1‑71 (MQ=255) tCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATccc < 1:1612330/71‑1 (MQ=255) tCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATccc < 1:1493587/71‑1 (MQ=255) tCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATcc < 1:3755849/70‑1 (MQ=255) cAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATccc > 1:4383629/1‑70 (MQ=255) cAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATccc > 1:3634342/1‑70 (MQ=255) aaTCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATcccc < 1:1749445/70‑1 (MQ=255) aTCGGTTATTTTTGGGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATcc < 1:2301052/67‑1 (MQ=255) tCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATc < 1:2258334/65‑1 (MQ=255) tCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGc < 1:3751093/71‑1 (MQ=255) cGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGc > 1:4576284/1‑70 (MQ=255) cGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCAAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGc > 1:1518973/1‑70 (MQ=255) ggTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCaa > 1:1695143/1‑71 (MQ=255) ttAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTa < 1:5219739/58‑1 (MQ=255) aaTTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTaa > 1:5341459/1‑57 (MQ=255) aaTTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAAt > 1:66742/1‑58 (MQ=255) ttGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATccc > 1:4346937/1‑57 (MQ=255) ttGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGc > 1:3907912/1‑70 (MQ=255) ttGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCg > 1:5294878/1‑71 (MQ=255) ttGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCg > 1:48508/1‑71 (MQ=255) tGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTaa > 1:5617110/1‑52 (MQ=255) tGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTaa > 1:3501263/1‑52 (MQ=255) gCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGt < 1:3470197/70‑1 (MQ=255) gCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGt < 1:1463045/70‑1 (MQ=255) gTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGt < 1:1023665/68‑1 (MQ=255) tGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTa < 1:1816896/68‑1 (MQ=255) tGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATg < 1:918950/71‑1 (MQ=255) gCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATgt > 1:481108/1‑71 (MQ=255) gCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATgt > 1:1633661/1‑71 (MQ=255) cTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAAc > 1:4526042/1‑57 (MQ=255) cTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATgtc > 1:4470631/1‑71 (MQ=255) tAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATgtcgt < 1:3038778/70‑1 (MQ=255) cATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTgg > 1:2314996/1‑36 (MQ=255) aTTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATc > 1:2328295/1‑71 (MQ=255) ttCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCaa > 1:850230/1‑48 (MQ=255) ttCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCa < 1:5426005/47‑1 (MQ=255) cacaTCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAAc > 1:3265866/1‑47 (MQ=255) cacaTCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAAc > 1:1742366/1‑47 (MQ=255) cacaTCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAAc > 1:2252702/1‑47 (MQ=255) acaTCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTa > 1:1958122/1‑55 (MQ=255) acaTCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTa > 1:502112/1‑55 (MQ=255) tCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGt < 1:5001991/51‑1 (MQ=255) tCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCt > 1:725991/1‑65 (MQ=255) cTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCTTGTcgc > 1:3169424/1‑70 (MQ=255) aacccAGGCGATGCAGCGAAAACTCGGCAAGCACTGGCAACAGTTGCATAATTTCGTCTATCTTGTCGCGa < 1:4653670/68‑1 (MQ=255) aacccAGGCGATGCAGCGAAAACTCGGCAAGCACTGGCAACAGTTGCATAATTTCGTCTATCTTGTCGCGa < 1:4306231/68‑1 (MQ=255) aTCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCTTGTCGCGa > 1:468223/1‑70 (MQ=255) tCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCTTGTcgc < 1:1828754/67‑1 (MQ=255) tCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCTTGTCGCGa < 1:5020788/69‑1 (MQ=255) tCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCTTGTCGCGATc < 1:4505061/71‑1 (MQ=255) cAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCTTGTCGCGATcc < 1:4283239/70‑1 (MQ=255) aggcGATGCAGCGAAAACTCGGCAAGCACTGGCAACAGTTGCATAATTTCGTCTATCTTGTCGCGATTCTg < 1:3139613/68‑1 (MQ=255) aggcGATGCAGCGAAAACTCGGCAAGCACTGGCAACAGTTGCATAATTTCGTCTATCTTGTCGCGATTCTg > 1:2603526/4‑71 (MQ=255) gATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCTTGTCGCGATCCTGGCAt > 1:2346852/1‑71 (MQ=255) gATGCAGCGAAAACTCGGCAAGCACTGGCAACAGTTGCATAATTTCGTCTATCTTGTCGCGa > 1:3365152/1‑62 (MQ=255) gATGCAGCGAAAACTCGGCAAGCACTGGCAACAGTTGCATAATTTCGTCTATCTTGTCGCGa > 1:1681589/1‑62 (MQ=255) gATGCAGCGAAAACTCGGCAAGCACTGGCAACAGTTGCATAATTTCGTCTATCTTGTCGCGa > 1:1835493/1‑62 (MQ=255) gCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCTTGTCGCGATCCTGGCATccc > 1:5396563/1‑71 (MQ=255) aGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCTACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCTTGTCGCGATCCTGGCATCCCTa < 1:475777/71‑1 (MQ=255) aGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTaa > 1:3432889/1‑37 (MQ=255) aGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTaa > 1:439939/1‑37 (MQ=255) aGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTaa > 1:5144609/1‑37 (MQ=255) aGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCTTGTc > 1:4740542/1‑53 (MQ=255) gTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCTTGTcgcg < 1:2699941/55‑1 (MQ=255) gTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCTTGTCGCGATCCTGGCAt < 1:1836574/65‑1 (MQ=255) gTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCTTGTCGCGATCCTGGCAt < 1:3595115/65‑1 (MQ=255) tGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCTTGTCGCGATcc < 1:4539228/58‑1 (MQ=255) tGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCTTGTCGCGATCCTg < 1:1083546/60‑1 (MQ=255) tGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCTTGTCGCGATCCTg < 1:3516440/60‑1 (MQ=255) tGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCTTGTCGCGATCCTg < 1:4295675/60‑1 (MQ=255) gAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCtt > 1:1414804/1‑47 (MQ=255) gAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCTTGTCGCGATc > 1:2118056/1‑56 (MQ=255) aaaaTTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATgtcg > 1:2629802/1‑38 (MQ=255) aaaaTTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTAtaa > 1:1496903/1‑43 (MQ=255) aaaaTTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCTTGTc > 1:3933827/1‑49 (MQ=255) aaaaTTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCTTGTCGCGATCCTg > 1:925135/1‑58 (MQ=255) aaaaTTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCTTGTCGCGATCCTg > 1:5627965/1‑58 (MQ=255) aaaaTTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCTTGTCGCGATCCTGGCATCCCTACat > 1:267293/1‑70 (MQ=255) aaaaTTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCTTGTCGCGAACCTGGCATCCCTACat > 1:4004785/1‑70 (MQ=255) aaaTTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCTTGTCGCGATc < 1:3311709/54‑1 (MQ=255) aaaTTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCTTGTCGCGATc < 1:3975953/54‑1 (MQ=255) aaaTTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCTTGTCGCGATc < 1:577148/54‑1 (MQ=255) aaTTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCTTGTCGCGATCCTGGCATCCCTACattat > 1:3353499/1‑71 (MQ=255) aTTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCTTGTCGCGATCCTGGCATCCCTACattatt < 1:3386335/71‑1 (MQ=255) aTTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCTTGTCGCGATCCTGGCATCCCTACattatt < 1:5607574/71‑1 (MQ=255) ttGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCTTGTCGCGATCCTGGCATCCCTACattatt > 1:2948697/1‑70 (MQ=255) ttGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCTTGTCGCGATCCTGGCATCCCTACattatt > 1:2122867/1‑70 (MQ=255) ttGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCTTGTCGCGATCCTGGCATCCCTACATTAttt < 1:2925540/71‑1 (MQ=255) ttGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCTTGTCGCGATCCTGGCATCCCTACATTAttt < 1:162078/71‑1 (MQ=255) tGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCtt < 1:5149069/41‑1 (MQ=255) tGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCtt < 1:4014550/41‑1 (MQ=255) | TGAGCATTGTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCTTGTCGCGATCCTGGCATCCCTACATTATTT > minE/2220081‑2220219 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |