| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | = 436833 | 83 (1.130) | 559 (7.620) | 72/96 | NT | 84.1% | coding (546/546 nt) | seqA | regulatory protein for replication initiation |
| ? | minE | 1803907 = | 128 (1.750) | intergenic (+63/‑28) | ygaH/mprA | predicted inner membrane protein/DNA‑binding transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 825 total aligned reads displayed.
TATATAACCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAATTT > minE/1803838‑1803976 | tatataACCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCg > 1:1814537/1‑71 (MQ=255)atcgaacacatcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCg > 1:1898780‑M2/70‑71 (MQ=255)atcgaacacatcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCg > 1:3095204‑M2/70‑71 (MQ=255)atcgaacacatcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCg < 1:4209945‑M2/2‑1 (MQ=255) cgaacacatcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGc > 1:4481578‑M2/68‑71 (MQ=255) cacatcatgcagtcgatgcaatacccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGaa < 1:1314544‑M2/8‑1 (MQ=255) atcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAAtt < 1:1361880‑M2/11‑1 (MQ=255) atcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAAt > 1:284140‑M2/61‑70 (MQ=255) atcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAAt > 1:1216472‑M2/61‑70 (MQ=255) atgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTaa < 1:5059898‑M2/13‑1 (MQ=255) atgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAAt < 1:4330571‑M2/14‑1 (MQ=255) aaGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAAt < 1:804332/71‑1 (MQ=255) tgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATg < 1:5041110‑M2/15‑1 (MQ=255) agtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAgg < 1:2806229‑M2/18‑1 (MQ=255) tcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTaa < 1:1485330‑M2/13‑1 (MQ=255) tcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATg < 1:5196574‑M2/15‑1 (MQ=255) cgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGa > 1:644536‑M2/51‑66 (MQ=255) tccaattcccggcggaatagattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAAt < 1:2130585‑M2/14‑1 (MQ=255) gcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATAcc > 1:3304650‑M2/47‑71 (MQ=255) caattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATg < 1:1098788‑M2/15‑1 (MQ=255) aattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCa < 1:3038835‑M2/27‑1 (MQ=255) tAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTaa > 1:4998969/1‑56 (MQ=255) tAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTaa > 1:3596201/1‑56 (MQ=255) tcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATa > 1:3900272‑M2/42‑64 (MQ=255) tcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAAt > 1:3251236‑M2/42‑71 (MQ=255) tcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAAt > 1:5160985‑M2/42‑71 (MQ=255) aaCAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGa < 1:3756033/47‑1 (MQ=255) ccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCaaa > 1:2341676‑M2/40‑68 (MQ=255) ccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATg < 1:2567219‑M2/31‑1 (MQ=255) cggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGa > 1:3211700‑M2/39‑71 (MQ=255) ggcggaattgattgaggaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGAt < 1:3874317‑M2/34‑1 (MQ=255) ggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGAt < 1:2530152‑M2/34‑1 (MQ=255) ggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAAtt < 1:1381684‑M2/11‑1 (MQ=255) ggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAAtt < 1:2609160‑M2/11‑1 (MQ=255) ggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAAt < 1:3377118‑M2/14‑1 (MQ=255) ggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAAt < 1:3530974‑M2/14‑1 (MQ=255) ttgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAAt < 1:2657476‑M2/14‑1 (MQ=255) ttgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGt < 1:1154243‑M2/19‑1 (MQ=255) ttgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGt > 1:3167336‑M2/31‑71 (MQ=255) ttgattgagaaggttcgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGt < 1:4938713‑M2/41‑1 (MQ=255) tACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCaaa > 1:2193307/1‑58 (MQ=255) gattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCa < 1:966436‑M2/27‑1 (MQ=255) gattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCa < 1:2880817‑M2/27‑1 (MQ=255) gattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:3449524‑M2/42‑1 (MQ=255) gattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt > 1:1766608‑M2/29‑70 (MQ=255) gattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:4502085‑M2/42‑1 (MQ=255) gattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:4412387‑M2/42‑1 (MQ=255) gattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:2258024‑M2/42‑1 (MQ=255) gattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt > 1:2398574‑M2/29‑70 (MQ=255) aCTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:2496262/70‑1 (MQ=255) aCTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt > 1:780091/1‑70 (MQ=255) ttgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTAc > 1:2074243‑M2/27‑71 (MQ=255) tATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTaa > 1:3009034/1‑37 (MQ=255) tATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCaaa > 1:595671/1‑53 (MQ=255) gagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCa > 1:3721953‑M2/25‑45 (MQ=255) gagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCa > 1:3945860‑M2/25‑45 (MQ=255) gagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCa > 1:842041‑M2/25‑45 (MQ=255) gagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTc > 1:4863527‑M2/25‑63 (MQ=255) agaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTa < 1:939615‑M2/12‑1 (MQ=255) agaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTa < 1:4053768‑M2/12‑1 (MQ=255) agaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGcc < 1:4672293‑M2/48‑1 (MQ=255) aTTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGcc > 1:4519908/1‑71 (MQ=255) ggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCAtt > 1:1954465‑M2/20‑71 (MQ=255) gtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCa < 1:508256‑M2/27‑1 (MQ=255) tttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGt < 1:101805‑M2/19‑1 (MQ=255) tttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGt < 1:1611163‑M2/19‑1 (MQ=255) ttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTa > 1:4100671‑M2/17‑60 (MQ=255) ttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGaa > 1:4574236‑M2/17‑71 (MQ=255) tGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGAt < 1:3479252/48‑1 (MQ=255) gcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAAc < 1:3655216‑M2/56‑1 (MQ=255) cggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCaa < 1:4298648‑M2/28‑1 (MQ=255) tCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCaaa > 1:489795/1‑41 (MQ=255) tCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTg < 1:105079/65‑1 (MQ=255) actatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATATCCAAATGGATAGTTCGTTTacgccaaa > 1:1650757‑M2/10‑57 (MQ=255) actatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATg > 1:1269329‑M2/10‑70 (MQ=255) ctatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATgg < 1:1412698‑M2/32‑1 (MQ=255) ctatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATgg < 1:1724613‑M2/32‑1 (MQ=255) ctatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATa > 1:4373922‑M2/9‑43 (MQ=255) ctatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATa > 1:4153552‑M2/9‑43 (MQ=255) ctatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATa > 1:552671‑M2/9‑43 (MQ=255) ctatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATa > 1:2378363‑M2/9‑43 (MQ=255) ctatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATa > 1:2289241‑M2/9‑43 (MQ=255) ctatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATa > 1:2212058‑M2/9‑43 (MQ=255) tatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAAc < 1:4773757‑M2/56‑1 (MQ=255) tatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAAc < 1:2017068‑M2/56‑1 (MQ=255) tatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCt > 1:891276‑M2/8‑70 (MQ=255) aCTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTAc > 1:674284/1‑52 (MQ=255) atctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATa > 1:1835666‑M2/7‑41 (MQ=255) atctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTa > 1:2761082‑M2/7‑70 (MQ=255) tctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGc > 1:3998383‑M2/6‑52 (MQ=255) ctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTa > 1:4252727‑M2/5‑48 (MQ=255) atatCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTa > 1:726027/1‑48 (MQ=255) taaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:5111739‑M2/42‑1 (MQ=255) taaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:1685635‑M2/42‑1 (MQ=255) taaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTa > 1:4727219‑M2/4‑47 (MQ=255) taaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACa > 1:2947689‑M2/4‑60 (MQ=255) aCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGccc > 1:3411585‑M2/2‑50 (MQ=255) aCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAAt < 1:3804475‑M2/68‑1 (MQ=255) cGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTa > 1:2433887/1‑44 (MQ=255) cGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTa > 1:1546940/1‑44 (MQ=255) | TATATAACCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAATTT > minE/1803838‑1803976 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |