| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | minE | 1,876,440 | T→C | 6.4% | K328K (AAA→AAG) | eno ← | enolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | minE | 1,876,440 | 0 | T | C | 6.4% | 423.1 / 13.7 | 141 | K328K (AAA→AAG) | eno | enolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (74/58); new base C (7/2); total (81/60) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.01e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.90e-01 | |||||||||||
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
TCGGTCAGAGAACCGATCTGGTTGAATTTGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGGTCGTCACCAACCAGCTGGATTTTGTCGCCCAGAACTT > minE/1876372‑1876507 | ggTCAGAGAACCGATCTGGTTGAATTTGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTc < 1:480855/70‑1 (MQ=255) ggTCAGAGAACCGATCTGGTTGAATTTGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTc < 1:1583553/70‑1 (MQ=255) agagAACCGATCTGGTTGAATTTGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTc < 1:4624269/66‑1 (MQ=255) agaACCGATCTGGTTGAATTTGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAg > 1:2001127/1‑66 (MQ=255) agaACCGATCTGGTTGAATTTGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAg > 1:4981690/1‑66 (MQ=255) agaACCGATCTGGTTGAATTTGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCt > 1:2468298/1‑71 (MQ=255) aaCCGATCTGGTTGAATTTGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAg > 1:4603730/1‑64 (MQ=255) ccGATCTGGTTGAATTTGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGgt > 1:1092509/1‑71 (MQ=255) ccGATCTGGTTGAATTTGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGgt > 1:4944100/1‑71 (MQ=255) ccGATCTGGTTGAATTTGATAAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGgt > 1:2914062/1‑71 (MQ=255) cGATCTGGTTGAATTTGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGgtg > 1:558299/1‑71 (MQ=255) aTCTGGTTGAATTTGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCttt < 1:3816641/56‑1 (MQ=255) aTCTGGTTGAATTTGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCttt < 1:2629520/56‑1 (MQ=255) aTCTGGTTGAATTTGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAgg < 1:5117033/60‑1 (MQ=255) aTCTGGTTGAATTTGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAgg < 1:3779344/60‑1 (MQ=255) cTGGTTGAATTTGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCa > 1:3728913/1‑56 (MQ=255) gTTGAATTTGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTa > 1:3280688/1‑71 (MQ=255) gTTGAATTTGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATAACTTCTTTCAGGATCTTg > 1:4029378/1‑61 (MQ=255) gAATTTGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACg < 1:3063040/70‑1 (MQ=255) gAATTTGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACg < 1:2848929/70‑1 (MQ=255) tttGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTc < 1:1867709/46‑1 (MQ=255) tttGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACg < 1:3598872/67‑1 (MQ=255) tttGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACg < 1:3414944/67‑1 (MQ=255) tttGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACg < 1:1409174/67‑1 (MQ=255) tttGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACg < 1:1727563/67‑1 (MQ=255) tttGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACg < 1:40257/67‑1 (MQ=255) tttGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACg < 1:1796853/67‑1 (MQ=255) tttGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGaa > 1:2097176/1‑69 (MQ=255) tttGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGaa > 1:5027547/1‑69 (MQ=255) tttGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGaa > 1:4871698/1‑69 (MQ=255) tGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTAc > 1:3862310/1‑64 (MQ=255) tGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGaa > 1:3706650/1‑67 (MQ=255) tGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGaa > 1:1150991/1‑67 (MQ=255) tGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGaa > 1:4491081/1‑67 (MQ=255) tGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGaa > 1:1686253/1‑67 (MQ=255) tGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGaa > 1:2695796/1‑67 (MQ=255) tGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGaa > 1:1075451/1‑67 (MQ=255) tGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAgg > 1:4372961/1‑71 (MQ=255) tGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAg < 1:1302349/70‑1 (MQ=255) gATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGa < 1:4309621/65‑1 (MQ=255) gATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGa < 1:3742546/65‑1 (MQ=255) tCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGgtcg < 1:840978/71‑1 (MQ=255) tCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGgtcg < 1:353336/71‑1 (MQ=255) cAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGgt > 1:4845378/1‑51 (MQ=255) cAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGgt > 1:3222409/1‑51 (MQ=255) cAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGgt > 1:2928097/1‑51 (MQ=255) cAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGgtcgt > 1:2014484/1‑71 (MQ=255) cAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTAGATACCTTCTTTCAGGATCTTGgt > 1:2605396/1‑51 (MQ=255) ggATCGAGTTGGCGATGCCCTTCTGGATGCCTTCCTTCAGGATCTTGGTGTTGGTGACGAACAGgtcgtc < 1:2755873/70‑1 (MQ=255) gATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAAAAGGTCGTCac < 1:4469081/71‑1 (MQ=255) aTGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACg < 1:1798510/57‑1 (MQ=255) tGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATc > 1:1166466/1‑41 (MQ=255) tGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATc > 1:422539/1‑41 (MQ=255) tGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATc > 1:648017/1‑41 (MQ=255) tGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATc > 1:4928165/1‑41 (MQ=255) tGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGGTCGTCacca < 1:4322975/71‑1 (MQ=255) tGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGGTCGTCacca < 1:4911037/71‑1 (MQ=255) ggAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGgtc < 1:4488300/63‑1 (MQ=255) ggAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGgtc < 1:1833948/63‑1 (MQ=255) aGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTg > 1:1959907/1‑41 (MQ=255) aGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGgtcgt > 1:5025373/1‑63 (MQ=255) aGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGgtcgt > 1:3847053/1‑63 (MQ=255) aGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGgtcgt > 1:3989041/1‑63 (MQ=255) aGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGgtcg > 1:4222619/1‑62 (MQ=255) aGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGgacgt > 1:968472/1‑63 (MQ=255) gTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGGTCGTCaccaac > 1:1411472/1‑69 (MQ=255) ttAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGGTCGTCACCAACCAg < 1:1934896/71‑1 (MQ=255) ttAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGGTCGTCACCAACCAg < 1:4148953/71‑1 (MQ=255) ttAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGGTCGTCACCAACCAg < 1:3896445/71‑1 (MQ=255) ggCGATGCCCTTCTGGATGCCTTCCTTCAGGATCTTGGTGTTGGTGACGAACAgg > 1:3174283/2‑55 (MQ=255) ggCGATGCCCTTCTGGATGCCTTCCTTCAGGATCTTGGTGTTGGTGACGAACAgg > 1:18579/2‑55 (MQ=255) ggCGATGCCCTTCTGGATGCCTTCCTTCAGGATCTTGGTGTTGGTGACGAACAgg > 1:2686370/2‑55 (MQ=255) ggCGATGCCCTTCTGGATGCCTTCCTTCAGGATCTTGGTGTTGGTGACGAACAgg > 1:5188816/2‑55 (MQ=255) ggCGATGCCCTTCTGGATGCCTTCCTTCAGGATCTTGGTGTTGGTGACGAACAgg > 1:3215041/2‑55 (MQ=255) ggCGATGCCCTTCTGGATGCCTTCCTTCAGGATCTTGGTGTTGGTGACGAACAgg > 1:900608/2‑55 (MQ=255) aGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACg < 1:1145920/49‑1 (MQ=255) aGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGa < 1:381944/50‑1 (MQ=255) gCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGGTCGGCACCAACCAg < 1:1321393/68‑1 (MQ=255) ccTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGGTCGTCACCAACCAGCTGGAtttt < 1:2857281/71‑1 (MQ=255) cTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGGTCGTCa > 1:443854/1‑53 (MQ=255) cTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGGTCGTCa > 1:650838/1‑53 (MQ=255) cTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGGTCGTCa > 1:1587478/1‑53 (MQ=255) cTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGGTCGTCa > 1:473569/1‑53 (MQ=255) tCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGaa > 1:2585999/1‑38 (MQ=255) tCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGaa > 1:794740/1‑38 (MQ=255) tCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGaa > 1:3521564/1‑38 (MQ=255) tCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGaa > 1:3701464/1‑38 (MQ=255) tCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGa > 1:488313/1‑37 (MQ=255) ccTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGGTCGTCACCAACCAGCTGGATTTTGTCGCCCAGaa < 1:2216245/70‑1 (MQ=255) ccTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGGTCGTCACCAACCAGCTGGATTTTGTCGCCCAGaa < 1:2437000/70‑1 (MQ=255) ccTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGGTCGTCACCAACCAGCTGGATTTTGTCGCCCAGaa < 1:1303250/70‑1 (MQ=255) cttcttTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGgtcgt < 1:3104870/39‑1 (MQ=255) cttcttTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGgtcgt < 1:3460659/39‑1 (MQ=255) cttcttTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGgtcgt < 1:3593267/39‑1 (MQ=255) cttTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGGTCGTCaccaac > 1:2006134/1‑43 (MQ=255) cttTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGGTCGTCaccaac > 1:286959/1‑43 (MQ=255) cttTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGGTCGTCaccaac > 1:3109298/1‑43 (MQ=255) cttTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGGTCGTCaccaac > 1:348236/1‑43 (MQ=255) cttTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGGTCGTCaccaac > 1:931023/1‑43 (MQ=255) cttTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGGTCGTCaccaac > 1:1129601/1‑43 (MQ=255) | TCGGTCAGAGAACCGATCTGGTTGAATTTGATCAGGATGGAGTTAGCGATACCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGGTCGTCACCAACCAGCTGGATTTTGTCGCCCAGAACTT > minE/1876372‑1876507 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |