| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | = 1766900 | 54 (1.040) | 3 (0.060) | 3/96 | NT | 5.5% | intergenic (‑41/+89) | clpB/yfiH | protein disaggregation chaperone/conserved hypothetical protein |
| ? | minE | = 1766917 | 52 (1.070) | intergenic (‑58/+72) | clpB/yfiH | protein disaggregation chaperone/conserved hypothetical protein | |||||
GAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCACGCGTACCGGA > minE/1766830‑1766970 | gAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAA < 1:3922839‑M1/71‑1 (MQ=255) aaTTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTaaa > 1:3080018/1‑71 (MQ=255) aTTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTaaa < 1:2698241/70‑1 (MQ=255) aTTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTaaa < 1:2978806/70‑1 (MQ=255) aTTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAAt < 1:3872842/71‑1 (MQ=255) tttATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAAt > 1:455731/1‑70 (MQ=255) gTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCa < 1:1172375/70‑1 (MQ=255) gTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCAt < 1:3022837/71‑1 (MQ=255) aaGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATcc > 1:1780332/1‑71 (MQ=255) aGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTaaa > 1:1599075/1‑59 (MQ=255) aGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTaaa > 1:3497826/1‑59 (MQ=255) aGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATccc < 1:1293143/71‑1 (MQ=255) aGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATccc < 1:3104182/71‑1 (MQ=255) aGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAA < 1:2098742‑M1/58‑1 (MQ=255) aGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAA < 1:2777654‑M1/58‑1 (MQ=255) gACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCt > 1:1684855/1‑71 (MQ=255) gATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCaa < 1:3525471/71‑1 (MQ=255) gATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCaa > 1:3545016/1‑71 (MQ=255) tCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAAt < 1:3107680‑M2/70‑2 (MQ=255) ccAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAAtta < 1:2395472‑M2/71‑4 (MQ=255) cAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAattat > 1:580058/1‑71 (MQ=255) cAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAattat < 1:664483/71‑1 (MQ=255) cAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAattat > 1:868804/1‑71 (MQ=255) aGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAattatt < 1:776661/71‑1 (MQ=255) aGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAAtta > 1:2793840‑M2/1‑66 (MQ=255) aCGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTc > 1:2764174/1‑70 (MQ=255) gCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAttgagggatgacctcatt > 1:1434805‑M1/1‑45 (MQ=255) tAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTaaa < 1:107735/43‑1 (MQ=255) aaCTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCa > 1:3332025/1‑57 (MQ=255) aCTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTa < 1:1153859/70‑1 (MQ=255) tcctccCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGt < 1:1722427/66‑1 (MQ=255) tcctccCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTAtt < 1:1108578/70‑1 (MQ=255) cccATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATg > 1:2189657/1‑37 (MQ=255) cccATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGa > 1:2254916/1‑68 (MQ=255) aTAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGAt > 1:1286043/1‑71 (MQ=255) aCGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTaa > 1:2413403/1‑71 (MQ=255) aCGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTaa < 1:448173/71‑1 (MQ=255) aCGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTa < 1:3206080/70‑1 (MQ=255) ggATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAAtg > 1:810604/1‑71 (MQ=255) gATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAAtgt < 1:652671/71‑1 (MQ=255) gATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAAtgt < 1:3383914/71‑1 (MQ=255) gATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAAtgt < 1:3388550/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTaa > 1:423396/1‑65 (MQ=255) cAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTga > 1:3540134/1‑70 (MQ=255) aaaGTTGCTACTGGAGATTAAttgagggatgacctcat < 1:3128105‑M1/38‑18 (MQ=255) aaaGTTGCTACTGGAGATTAAttgagggatgacctca < 1:1141794‑M1/37‑17 (MQ=255) aaaGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGt < 1:452184/49‑1 (MQ=255) aaGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAattat < 1:2533916/41‑1 (MQ=255) aGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGTTTATTGACCAGATTAATGTgaaaag < 1:2950371/71‑1 (MQ=255) aGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTa > 1:3062990/1‑49 (MQ=255) aGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTgataag < 1:3595870/71‑1 (MQ=255) aGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTgaaaag < 1:3635249/71‑1 (MQ=255) aGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTgaa > 1:2108862/1‑68 (MQ=255) gTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTgaaaaga < 1:3218357/71‑1 (MQ=255) tGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGa > 1:2709189/1‑50 (MQ=255) cTACTGGATATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTgaaaagaaaa < 1:1073170/70‑1 (MQ=255) cTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTgaaaagaaaa < 1:1660062/70‑1 (MQ=255) cTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAAt < 1:1439029/71‑1 (MQ=255) cTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAAt > 1:2358121/1‑71 (MQ=255) cTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAAt < 1:2641878/71‑1 (MQ=255) cTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAAt < 1:3638131/71‑1 (MQ=255) tACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCa < 1:1877757/50‑1 (MQ=255) tACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCa < 1:1001392/50‑1 (MQ=255) tACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAAtgt > 1:2027778/1‑59 (MQ=255) cTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTa < 1:1724860/53‑1 (MQ=255) cTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCa < 1:1404989/70‑1 (MQ=255) cTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCAc > 1:1255994/1‑71 (MQ=255) cTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCAc < 1:855983/71‑1 (MQ=255) gagaTTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATc > 1:3757847/1‑66 (MQ=255) gagaTTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCAcgcg > 1:369292/1‑71 (MQ=255) gaTTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGa > 1:592893/1‑45 (MQ=255) gaTTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAAt < 1:1381457/50‑1 (MQ=255) tAAttgagggatgacctcatttaatctccagtagcaactttgatccgttatgggaggagttatgcgtctgg < 1:2395472‑M1/71‑69 (MQ=255) tAAttgagggatgacctcatttaatctccagtagcaactttgatccgttatgggaggagttatgcgtct > 1:2793840‑M1/1‑3 (MQ=255) tAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCa > 1:1494639/1‑62 (MQ=255) attgagggatgacctcatttaatctccagtagcaactttgatccgttatgggaggagttatgcgtctgga < 1:3107680‑M1/70‑70 (MQ=255) aaTGAGGTCATCCCTCAAttaatctccagtagcaactttgatccgttatgggaggagttatgc > 1:1434805‑M2/1‑18 (MQ=255) aaTGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCACGCGTACCgg < 1:3222064/70‑1 (MQ=255) aaTGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCACGCGTACCGGa > 1:2591938/1‑71 (MQ=255) aaTGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATAACGCGTACCGGa > 1:2921191/1‑71 (MQ=255) | GAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCACGCGTACCGGA > minE/1766830‑1766970 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |