| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | = 2828976 | 69 (1.330) | 4 (0.080) | 3/96 | NT | 5.9% | coding (1014/1437 nt) | aspA | aspartate ammonia‑lyase |
| ? | minE | = 2829001 | 63 (1.290) | coding (989/1437 nt) | aspA | aspartate ammonia‑lyase | |||||
ACTGCAGCTGACCTGCTTCTGCTGCCATGGTAACAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTGGCATGATGGAAGAGCCCGCCTGCAGTTCCG > minE/2828909‑2829046 | aCTGCAGCTGACCTGCTTCTGCTGCCATGGTAACAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTgg < 1:2644854/71‑1 (MQ=255)aCTGCAGCTGACCTGCTTCTGCTGCCATGGTAACAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTgg < 1:3829305/71‑1 (MQ=255) cTGCAGCTGACCTGCTTCTGCTGCCATGGTAACAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCt > 1:3074546/1‑68 (MQ=255) cTGCAGCTGACCTGCTTCTGCTGCCATGGTAACAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCt > 1:12287/1‑68 (MQ=255) cTGCAGCTGACCTGCTTCTGCTGCCATGGTAACAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCt > 1:3174420/1‑68 (MQ=255) cTGCAGCTGACCTGCTTCTGCTGCCATGGTAACAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGt > 1:35443/1‑71 (MQ=255) tGCAGCTGACCTGCTTCTGCTGCCATGGTAACAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGt > 1:3028993/1‑70 (MQ=255) cAGCTGACCTGCTTCTGCTGCCATGGTAACAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGtt < 1:998573/69‑1 (MQ=255) aGCTGACCTGCTTCTGCTGCCATGGTAACAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAAc > 1:2742153/1‑71 (MQ=255) ccTGCTTCTGCTGCCATGGTAACAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCcggttattccgg > 1:2731039‑M1/1‑57 (MQ=255) ccTGCTTCTGCTGCCATGGTAACAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACtt < 1:396051/70‑1 (MQ=255) ccTGCTTCTGCTGCCATGGTAACAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTc < 1:1584606/71‑1 (MQ=255) ccTGCTTCTGCTGCCATGGTAACAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTc < 1:2892835/71‑1 (MQ=255) ccTGCTTCTGCTGCCATGGTAACAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTc < 1:850285/71‑1 (MQ=255) cTGCTTCTGCTGCCATGGTAACAGTGGTGTCGTTACCGATGAC‑TTGAAGCATACCTGGtt < 1:1800639/60‑1 (MQ=255) tGCTTCTGCTGCCATGGTAACAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTc < 1:3251192/69‑1 (MQ=255) gCTTCTGCTGCCATGGTAACAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCg > 1:2464006/1‑70 (MQ=255) cTTCTGCTGCCATGGTAACAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCgg < 1:684940/70‑1 (MQ=255) tCTGCTGCCATGGTAACAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTcc < 1:707117/66‑1 (MQ=255) tCTGCTGCCATGGTAACAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTcc < 1:1682835/66‑1 (MQ=255) tgctgcCATGGTAACAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGaacaa > 1:2108384/1‑71 (MQ=255) gctgcCATGGTAACAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTaa > 1:3735722/1‑55 (MQ=255) ctgcCATGGTAACAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAAcc < 1:3290450/71‑1 (MQ=255) tgcCATGGTAACAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTgg > 1:2694388/1‑49 (MQ=255) tgcCATGGTAACAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCg > 1:364525/1‑71 (MQ=255) ccATGGTAACAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACtt < 1:2087622/57‑1 (MQ=255) cATGGTAACAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGggt > 1:3007299‑M2/1‑68 (MQ=255) gTAACAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAAcc > 1:679406/1‑63 (MQ=255) gTAACAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTa < 1:1516753/70‑1 (MQ=255) gTAACAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTa < 1:1079747/70‑1 (MQ=255) gTAACAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTAc > 1:2946730/1‑71 (MQ=255) tAACAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCcggttgttccggaagtggttaaccaggt > 1:3518636‑M1/1‑38 (MQ=255) tAACAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCcggttgttccggaagtggttaaccaggt > 1:747067‑M1/1‑38 (MQ=255) tAACAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACt > 1:672236/1‑71 (MQ=255) aaCAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACtt > 1:175432/1‑71 (MQ=255) aCAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACtt < 1:3194996/70‑1 (MQ=255) aCAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACtt < 1:1153118/70‑1 (MQ=255) aGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAg > 1:3708693/1‑71 (MQ=255) gtggtgTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCcggttgttccggaagtggttaaccaggtatgcttcaaa < 1:2524409‑M1/71‑39 (MQ=255) gtggtgTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTa < 1:2464753/39‑1 (MQ=255) gtggtgTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTa < 1:775298/39‑1 (MQ=255) gtggtgTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGc < 1:3932559/71‑1 (MQ=255) tggtgTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCt > 1:3827714/1‑71 (MQ=255) tggtgTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCt < 1:586314/71‑1 (MQ=255) ggtgTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTg > 1:2399611/1‑71 (MQ=255) gtCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTGGCa > 1:968105/1‑71 (MQ=255) tCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGaac > 1:367804/1‑47 (MQ=255) tCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGaac > 1:3899563/1‑47 (MQ=255) tCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAAcc < 1:2528897/51‑1 (MQ=255) tCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGggt > 1:2385894‑M2/1‑52 (MQ=255) tCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGg < 1:699265‑M2/53‑2 (MQ=255) tCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTGGCat > 1:2935224/1‑71 (MQ=255) tCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTGGCat < 1:1017304/71‑1 (MQ=255) cGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTGGCat < 1:940168/70‑1 (MQ=255) gTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTGGCatga < 1:1712582/71‑1 (MQ=255) gTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTGGCatga < 1:1211218/71‑1 (MQ=255) ttACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAAcc > 1:3360093/1‑48 (MQ=255) ttACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTgg < 1:2315305/65‑1 (MQ=255) aCCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCg > 1:301277/1‑47 (MQ=255) aCCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTGGCatgatg < 1:1764047/70‑1 (MQ=255) aCCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTGGCatgatg > 1:954066/1‑70 (MQ=255) aCCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTGGCatgatg > 1:790655/1‑70 (MQ=255) cctaTGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTGGCATGATgg < 1:138495/67‑1 (MQ=255) ccGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTGGCATGATGGa < 1:377938/71‑1 (MQ=255) cGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCt < 1:3496745/59‑1 (MQ=255) cGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTGGCATGATGGaa < 1:487411/71‑1 (MQ=255) cGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTGGCATGATGGaa < 1:3831600/71‑1 (MQ=255) gATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTGGCATGATGGaa < 1:280250/70‑1 (MQ=255) gATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTGGCATGATGGaa < 1:3595158/70‑1 (MQ=255) aTGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTGGCatgat > 1:233637/1‑65 (MQ=255) tGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTGGCATGATGGaa > 1:492723/1‑68 (MQ=255) tGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTGGCATGATGGAagag < 1:3847009/71‑1 (MQ=255) tGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTGGCATGATGGAagag > 1:2268961/1‑71 (MQ=255) aCTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCt > 1:283040/1‑54 (MQ=255) aCTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTGGCATGATGGAAGAGc < 1:1500795/70‑1 (MQ=255) tttGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGggtatgcttcaaagtcatcggtaacgacaccac < 1:2524409‑M2/71‑34 (MQ=255) tttGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACtt < 1:1691320/47‑1 (MQ=255) ttGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTGGCATGATgg < 1:1488218/61‑1 (MQ=255) ttGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTGGCATGATgg < 1:31713/61‑1 (MQ=255) tGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTGGCATGATGGa < 1:3924786/61‑1 (MQ=255) tGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTGGCATGATGGAAGAGccc > 1:3250712/1‑68 (MQ=255) tGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTGGCATGATGGAAGAGCCCGcc > 1:3293539/1‑71 (MQ=255) gAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTg > 1:2583556/1‑50 (MQ=255) aGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTGGCATGATGGAAGAGCCCGCCTg > 1:714387/1‑70 (MQ=255) aGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTGGCATGATGGAAGAGCCCGCCTGc < 1:704690/71‑1 (MQ=255) gCATTCCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGttt < 1:17581/37‑1 (MQ=255) gCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTGGCATGATGGAAGAGCCCGCCTg > 1:3043219/1‑69 (MQ=255) aTACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCt < 1:2872174/44‑1 (MQ=255) aTACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTGGCATGATGGAAGAGCCCGCCTg > 1:706739/1‑67 (MQ=255) aTACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTGGCATGATGGAAGAGCCCGCCTGCAGt > 1:1493019/1‑71 (MQ=255) tACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTGGCatgatg < 1:1868587/52‑1 (MQ=255) aCCcggttgttccggaagtggttaaccaggtatgcttcaaagtcatcggtaacgacaccactgttaccatg > 1:3007299‑M1/1‑3 (MQ=255) aCCcggttgttccggaagtggttaaccaggtatgcttcaaagtcatcggtaacga > 1:2385894‑M1/1‑3 (MQ=255) aCCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGggtatgcttcaaagtcatcggtaacgacaccactgtta > 1:3518636‑M2/1‑28 (MQ=255) aCCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGggtatgcttcaaagtcatcggtaacgacaccactgtta > 1:747067‑M2/1‑28 (MQ=255) ccTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTGGCATGATGGAAGAGCCCGCCTGCAGTTc < 1:1018856/70‑1 (MQ=255) ccggttgttccggaagtggttaaccaggtatgcttcaaagtcatcggtaacga < 1:699265‑M1/53‑53 (MQ=255) cTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTGGCATGATGGAAGAGCCCGCCTGCAGTTCCg > 1:1612038/1‑71 (MQ=255) | ACTGCAGCTGACCTGCTTCTGCTGCCATGGTAACAGTGGTGTCGTTACCGATGACTTTGAAGCATACCTGGTTAACCACTTCCGGAACAACCGGGTTTACTTTAGCTGGCATGATGGAAGAGCCCGCCTGCAGTTCCG > minE/2828909‑2829046 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |