| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | = 2971259 | 52 (1.000) | 4 (0.090) | 3/92 | NT | 6.7% | coding (75/969 nt) | serB | 3‑phosphoserine phosphatase |
| ? | minE | = 2971281 | 65 (1.390) | coding (97/969 nt) | serB | 3‑phosphoserine phosphatase | |||||
CTAACATTACCTGGTGCGACCTGCCTGAAGATGTCTCTTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTATGGTCGTGGGCTGGATA > minE/2971189‑2971329 | cTAACATTACCTGGTGCGACCTGCCTGAAGATGTCTCTTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGT < 1:3365546‑M1/71‑1 (MQ=255) aCATTACCTGGTGCGACCTGCCTGAAGATGTCTCTTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAgtggtg < 1:3193510/69‑1 (MQ=255) aCATTACCTGGTGCGACCTGCCTGAAGATGTCTCTTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAgtggtg < 1:2109375/69‑1 (MQ=255) aCATTACCTGGTGCGACCTGCCTGAAGATGTCTCTTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGtgat > 1:1757999/1‑71 (MQ=255) aTTACCTGGTGCGACCTGCCTGAAGATGTCTCTTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGtgatg > 1:1574091/1‑70 (MQ=255) ttACCTGGTGCGACCTGCCTGAAGATGTCTCTTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGtgatg > 1:1862122/1‑69 (MQ=255) ccTGGTGCGACCTGCCTGAAGATGTCTCTTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAg < 1:1655990/69‑1 (MQ=255) ccTGGTGCGACCTGCCTGAAGATGTCTCTTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGt < 1:1074344/70‑1 (MQ=255) ccTGGTGCGACCTGCCTGAAGATGTCTCTTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTg < 1:2409227/71‑1 (MQ=255) ccTGGTGCGACCTGCCTGAAGATGTCTCTTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTg < 1:2466647/71‑1 (MQ=255) ggTGCGACCTGCCTGAAGATGTCTCTTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATg > 1:20902/1‑71 (MQ=255) cGACCTGCCTGAAGATGTCTCTTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGATGTGATGCCa < 1:2686602/70‑1 (MQ=255) cGACCTGCCTGAAGATGTCTCTTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCa < 1:336485/70‑1 (MQ=255) cGACCTGCCTGAAGATGTCTCTTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCa < 1:837247/70‑1 (MQ=255) cGACCTGCCTGAAGATGTCTCTTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCAc > 1:691717/1‑71 (MQ=255) cctgcctgAAGATGTCTCTTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTgg < 1:3267431/71‑1 (MQ=255) cctgcctgAAGATGTCTCTTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTg > 1:1270051/1‑70 (MQ=255) ctgcctgAAGATGTCTCTTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGa < 1:2499451/71‑1 (MQ=255) ctgAAGATGTCTCTTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTaatccagtggcatcacttcatcac < 1:584653‑M1/71‑25 (MQ=255) gAAGATGTCTCTTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTaatccagtggcatcacttcatcac > 1:21915‑M1/1‑45 (MQ=255) aaGATGTCTCTTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGAt > 1:2072177/1‑55 (MQ=255) aaGATGTCTCTTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTaccac < 1:3680819‑M2/71‑6 (MQ=255) aGATGTCTCTTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACg < 1:3354647/71‑1 (MQ=255) aGATGTCTCTTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACg < 1:3080943/71‑1 (MQ=255) gATGTCTCTTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTgg < 1:1021926/61‑1 (MQ=255) tctTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTaatccagtggcatcact < 1:2548676‑M1/53‑18 (MQ=255) tctTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTaatccagtggcatcact < 1:3709232‑M1/53‑18 (MQ=255) tctTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGa < 1:1985112/46‑1 (MQ=255) tttATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCg > 1:1706966/1‑69 (MQ=255) tttATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCg < 1:3754084/69‑1 (MQ=255) tttATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCg > 1:224936/1‑69 (MQ=255) tATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGt < 1:1025332/68‑1 (MQ=255) aTGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCg > 1:2079918/1‑71 (MQ=255) tGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCg < 1:1700439/70‑1 (MQ=255) tGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCg < 1:633105/70‑1 (MQ=255) tGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCg < 1:190820/70‑1 (MQ=255) tGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCg < 1:2625711/70‑1 (MQ=255) ggCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCggc > 1:1448861/1‑71 (MQ=255) ggTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTa < 1:131672‑M2/47‑2 (MQ=255) ggTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCggctggct > 1:3431073/1‑71 (MQ=255) ggTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCggctggct < 1:3289289/71‑1 (MQ=255) ggTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCggctggct < 1:3060797/71‑1 (MQ=255) gTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGgctggctg < 1:2043439/71‑1 (MQ=255) tGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACt > 1:3480735/1‑37 (MQ=255) tGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCggctg > 1:2989229/1‑64 (MQ=255) tGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGctgctg > 1:3842797/1‑71 (MQ=255) gCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGctgctg > 1:176046/1‑70 (MQ=255) gCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGctgctg > 1:2070932/1‑70 (MQ=255) ccTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGt < 1:2854886/70‑1 (MQ=255) ccTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGt < 1:697459/70‑1 (MQ=255) ccTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGt < 1:2596626/70‑1 (MQ=255) ccTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTa > 1:1163869/1‑71 (MQ=255) ctctTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTAt < 1:698415/71‑1 (MQ=255) tctTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGc < 1:1917155/55‑1 (MQ=255) tctTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGc < 1:3048095/55‑1 (MQ=255) tctTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCggctg < 1:2584363/60‑1 (MQ=255) ctTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCggctg < 1:3728554/59‑1 (MQ=255) tttCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCgg < 1:227841/55‑1 (MQ=255) tttCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTATgg > 1:1357777/1‑70 (MQ=255) aTTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCggc > 1:2664055/1‑52 (MQ=255) aTTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCggc > 1:2559686/1‑52 (MQ=255) aTTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTATGGTCGt < 1:1089001/70‑1 (MQ=255) ttAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGc < 1:3025865/38‑1 (MQ=255) aGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTATGGTCGTGGGCt > 1:2737224/1‑71 (MQ=255) gtggtgATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCggc < 1:2198534/47‑1 (MQ=255) gTGGTaatccagtggcatcacttcatcaccacttaatgaaagaggcagacccggccataaagagacatctt < 1:3680819‑M1/71‑67 (MQ=255) tggtgATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTATgg < 1:2449518/60‑1 (MQ=255) ggtgATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCggctg > 1:1089973/1‑47 (MQ=255) gtgATGAAGTGATGCCACTGGATTaccacttaatgaaagaggcagacccggccataaagagacatcttcag < 1:584653‑M2/71‑48 (MQ=255) gtgATGAAGTGATGCCACTGGATTaccacttaatgaaagaggcagacccggccataaagagacatcttc > 1:21915‑M2/1‑24 (MQ=255) gtgATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCggtt > 1:3229564/1‑43 (MQ=255) gtgATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCggtt > 1:3224884/1‑43 (MQ=255) gtgATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTATGGTCGTGGGCTGGAt < 1:3701052/71‑1 (MQ=255) tgatgaAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTATGGTCGTGGGCTGGATa < 1:3153833/71‑1 (MQ=255) tgatgaAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTATGGTCGTGGGCTGGATa < 1:275293/71‑1 (MQ=255) tgatgaAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTATGGTCGTGGGCTGGATa < 1:2345089/71‑1 (MQ=255) tgatgaAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTATGGGCGTGGGCTGGATa < 1:3409281/71‑1 (MQ=255) taatccagtggcatcacttcatcaccacttaatgaaagaggcagacc < 1:131672‑M1/47‑47 (MQ=255) | CTAACATTACCTGGTGCGACCTGCCTGAAGATGTCTCTTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTATGGTCGTGGGCTGGATA > minE/2971189‑2971329 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |