| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 764598 = | 57 (1.100) | 3 (0.060) | 3/94 | NT | 5.8% | coding (252/1137 nt) | potA | polyamine transporter subunit |
| ? | minE | 764619 = | 45 (0.940) | coding (231/1137 nt) | potA | polyamine transporter subunit | |||||
GTGCGTAGCTTTGGAAAACAGTGTTCACATAGCGGTTTTCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCAGACCTGCAATCAGGCGAAGAACGGTTGTTTTACCG > minE/764552‑764688 | gTGCGTAGCTTTGGAAAACAGTGTTCACATAGCGGTTTTCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATc > 1:3795349/1‑70 (MQ=255) tGCGTAGCTTTGGAAAACAGTGTTCACATAGCGGTTTTCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATc > 1:2128977/1‑69 (MQ=255) attgcaggtctggaaactgttgattccggacgcatcatgctggatAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATc > 1:2936141‑M1/46‑69 (MQ=255) gTAGCTTTGGAAAACAGTGTTCACATAGCGGTTTTCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCa < 1:679570/71‑1 (MQ=255) tAGCTTTGGAAAACAGTGTTCACATAGCGGTTTTCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCat < 1:2125211/71‑1 (MQ=255) tAGCTTTGGAAAACAGTGTTCACATAGCGGTTTTCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCat > 1:3272611/1‑71 (MQ=255) aGCTTTGGAAAACAGTGTTCACATAGCGGTTTTCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCat > 1:2936423/1‑70 (MQ=255) cTTTGGAAAACAGTGTTCACATAGCGGTTTTCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCatgat < 1:165768/71‑1 (MQ=255) cTTTGGAAAACAGTGTTCACATAGCGGTTTTCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCat < 1:2540750/68‑1 (MQ=255) cTTTGGAAAACAGTGTTCACATAGCGGTTTTCCGCCGGAACGGGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCatgat < 1:3760775/71‑1 (MQ=255) tGGAAAACAGTGTTCACATAGCGGTTTTCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCg > 1:2206036/1‑71 (MQ=255) gaaactgttgattccggacgcatcatgctggatAACGTGGGTGATGTCCTCGTTAt < 1:2752770‑M1/23‑1 (MQ=255) aaaaCAGTGTTCACATAGCGGTTTTCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATc < 1:1477470/56‑1 (MQ=255) aaaCAGTGTTCACATAGCGGTTTTCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCatga > 1:3920991/1‑63 (MQ=255) aaCAGTGTTCACATAGCGGTTTTCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCgg < 1:579416/71‑1 (MQ=255) aaCAGTGTTCACATAGCGGTTTTCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCgg < 1:1240349/71‑1 (MQ=255) aaCAGTGTTCACATAGCGGTTTTCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCg > 1:3419594/1‑70 (MQ=255) aaCAGTGTTCACATAGCGGTTTTCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCg > 1:1146000/1‑70 (MQ=255) aCAGTGTTCACATAGCGGTTTTCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGa < 1:1596173/71‑1 (MQ=255) cAGTGTTCACATAGCGGTTTTCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGaa < 1:3592981/71‑1 (MQ=255) gtgtTCACATAGCGGTTTTCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGAAt > 1:3748619/1‑70 (MQ=255) gtTCACATAGCGGTTTTCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAg > 1:486246/1‑51 (MQ=255) gtTCACATAGCGGTTTTCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAg > 1:3776025/1‑51 (MQ=255) ttCACATAGCGGTTTTCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCaa < 1:2210242/70‑1 (MQ=255) tCACATAGCGGTTTTCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCaa > 1:3773499/1‑69 (MQ=255) cacaTAGCGGTTTTCCGCCGGAACGTGTGTGATGTCCTCGTTATCCa > 1:516280/1‑47 (MQ=255) cacaTAGCGGTTTTCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCa > 1:3348946/1‑47 (MQ=255) acaTAGCGGTTTTCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGt < 1:3413086/71‑1 (MQ=255) aTAGCGGTTTTCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGttt > 1:1044159/1‑71 (MQ=255) aGCGGTTTTCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGttt > 1:1628795/1‑69 (MQ=255) cGGTTTTCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGttt > 1:2356403/1‑67 (MQ=255) cGGTTTTCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCAg < 1:3088670/71‑1 (MQ=255) ggTTTTCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCAGa < 1:149552/71‑1 (MQ=255) tttCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCatgatg > 1:542638/1‑44 (MQ=255) tttCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCatgat > 1:2285788/1‑43 (MQ=255) tttCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCAGACCt > 1:3785886/1‑71 (MQ=255) ttCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCa > 1:741259/1‑65 (MQ=255) ttCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCAGACCt < 1:1497030/70‑1 (MQ=255) ttCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCAGACCt < 1:1066835/70‑1 (MQ=255) ttCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCAGACCTg > 1:3677697/1‑71 (MQ=255) ttCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCAGACCTg > 1:94763/1‑71 (MQ=255) ttCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCAGACCTg > 1:3111223/1‑71 (MQ=255) tCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCAGACCTg < 1:3125770/70‑1 (MQ=255) tCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCAGACCTg < 1:410551/70‑1 (MQ=255) ccgccgGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCAGAc > 1:3779753/1‑66 (MQ=255) ccgccgGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCAGAc > 1:1373825/1‑66 (MQ=255) ccgccgGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCAGAc > 1:2729118/1‑66 (MQ=255) ccgGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAAAAGTTTCCAGACCTGCAATc < 1:1873538/71‑1 (MQ=255) gataacgaggacatcacccacgttATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCAGACCTGCAAt > 1:2936141‑M2/25‑69 (MQ=255) ataacgaggacatcacccacgttATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTc < 1:2752770‑M2/33‑1 (MQ=255) aacgaggacatcacccacgttATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCa > 1:2628064‑M2/22‑56 (MQ=255) ACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCAGACCt < 1:2612983‑M1/60‑1 (MQ=255) CGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCa < 1:3901300‑M1/54‑1 (MQ=255) GTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCAGACCTGCAATCAGGCg < 1:3473627‑M1/69‑1 (MQ=255) tGATGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCAGACCTGCAATCAGGCGAAGAACg > 1:2325079/1‑71 (MQ=255) aTGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCAGACCTGCAATCAGGCGAAGAACgg < 1:253394/70‑1 (MQ=255) aTGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCAGACCTGCAATCAGGCGAAGAACGgt > 1:2775568/1‑71 (MQ=255) tGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCAGACCTGCAATCAGGCGAAGAACgg < 1:1128367/69‑1 (MQ=255) cTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCAGAc > 1:2367915/1‑44 (MQ=255) cTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCAGACCTGCAATCAGGCGAAGAACGGTTGttt < 1:333059/71‑1 (MQ=255) cTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCAGACCTGCAATCAGGCGAAGAACGGTTGttt > 1:2261857/1‑71 (MQ=255) cTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCAGACCTGCAATCAGGCGAAGAACGGTTGttt > 1:648557/1‑71 (MQ=255) tCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCAGACCTGCAATCAGGCGAAGAACGGTTGttt < 1:2273375/70‑1 (MQ=255) cgttATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCa > 1:2668216‑M2/5‑39 (MQ=255) gttATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCAGACCTGCAATCAGGCGAAGAACTGTTGTTTTa < 1:1836199‑M2/67‑1 (MQ=255) ttATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCAGACCTGCAATCAGGCGAAGAACGGTTGTTTTAcc > 1:915914‑M2/3‑71 (MQ=255) tATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCAGAc > 1:2815037‑M2/2‑39 (MQ=255) tATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCAGACCTGCAATCAGGCGAAGAACGGTTGTTTTACCg > 1:1852826‑M2/2‑71 (MQ=255) aTCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCAGACCTGCAATCAGGCgaagaa > 1:3303294/1‑56 (MQ=255) aTCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCAGACCTGCAATCAGGCGAAGAACGGTTGTTTTACCg < 1:1381979/70‑1 (MQ=255) aTCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCAGACCTGCAATCAGGCGAAGAACGGTTGTTTTACCg < 1:1190657/70‑1 (MQ=255) | GTGCGTAGCTTTGGAAAACAGTGTTCACATAGCGGTTTTCCGCCGGAACGTGGGTGATGTCCTCGTTATCCAGCATGATGCGTCCGGAATCAACAGTTTCCAGACCTGCAATCAGGCGAAGAACGGTTGTTTTACCG > minE/764552‑764688 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |