| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | = 204106 | NA (NA) | 7 (0.130) | 6/92 | NT | NA | noncoding (1511/1542 nt) | rrsH | 16S ribosomal RNA |
| ? | minE | = 204118 | NA (NA) | noncoding (1523/1542 nt) | rrsH | 16S ribosomal RNA | |||||
GGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > minE/204033‑204106‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaccgCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCTCC < minE/204118‑204049 GGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAA > 1:1553099/1‑71GGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAA < 1:2791359/71‑1GGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAA < 1:596993/71‑1GGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAA > 1:1336261/1‑71GGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAA > 1:3390484/1‑71GGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAA < 1:1174387/71‑1GGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTA < 1:1070093/70‑1 GTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAA < 1:938776/70‑1 TAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACC > 1:3034012/1‑71 TAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACC > 1:1831559/1‑71 TAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACC > 1:2992455/1‑71 TAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACC > 1:2438590/1‑71 TAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACC > 1:2848851/1‑71 AGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG > 1:1142225/1‑71 AGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG > 1:1425643/1‑71 AGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG > 1:2460703/1‑71 AGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG > 1:3179530/1‑71 GCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG < 1:2310605/70‑1 GCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG < 1:3471349/70‑1 GCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG < 1:3131547/70‑1 GCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG < 1:1015770/70‑1 GCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG > 1:2696729/1‑70 GCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG < 1:1209559/70‑1 AACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG < 1:1200388/66‑1 CCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGCAGGgga < 1:1992380/71‑4 CTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTA > 1:2274525/1‑59 GGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGCAGGTTCCCCTAC < 1:1770921/71‑1 GAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG > 1:1532650/1‑57 AGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAAC < 1:125486/54‑1 GGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGCAGGTTCCCCTACGGTT < 1:2776333/71‑1 CTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG < 1:2134613/50‑1 TACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG < 1:3452140/48‑1 TACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG < 1:40095/48‑1 TACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG < 1:2682521/48‑1 CTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGCAGGTTCCCCTACGGTT > 1:589318/1‑60 TTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACC < 1:786059/40‑1 ATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG < 1:2729041/36‑1 ATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG < 1:271171/36‑1 ATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG < 1:3641412/36‑1 ATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG < 1:40421/36‑1 ATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG < 1:152865/36‑1 ATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG < 1:563559/36‑1 ATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG < 1:594031/36‑1 ATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG < 1:629702/36‑1 TTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGCAGGTTCCCCTACGG < 1:246590/50‑1 TCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGCAGGTTCCCCTACGG < 1:1557694/49‑1 CATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGCAGGTTCCCCTACGGTT > 1:1233013/1‑50 TGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTA < 1:1933125/49‑1 AACCGCAGGTTCCCCTACTGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCC > 1:335144/1‑71 AACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCC > 1:3434590/1‑71 AACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCC > 1:3662093/1‑71 AACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCC > 1:2985010/1‑71 AACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCC > 1:990591/1‑71 AACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCC > 1:1492935/1‑71 AACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCC > 1:2626873/1‑71 AACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCC > 1:1495056/1‑71 AACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCC > 1:174257/1‑71 AACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCC > 1:1756045/1‑71 AACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGC < 1:1775475/70‑1 AACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCA < 1:2685626/48‑1 AACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCA < 1:1777508/48‑1 AACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGT > 1:2022877/1‑46 ACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCC > 1:1789846/1‑71 ACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCC > 1:3330825/1‑71 ACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCC > 1:707140/1‑70 ACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCAC > 1:385678/1‑39 ACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCAC > 1:3023431/1‑39 CCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTATGCGCCCT > 1:2141490/1‑71 CCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCT > 1:2059728/1‑71 CCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCT > 1:2553456/1‑71 CCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCT < 1:1283451/71‑1 CCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATC > 1:3186841/1‑52 CCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATC > 1:117266/1‑52 CCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCA > 1:1083711/1‑37 CCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCA > 1:3336715/1‑37 CGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCCCCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCTC > 1:2849460/1‑71 CGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCTC < 1:16722/71‑1 CGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTG > 1:232461/1‑59 CGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAT < 1:2393084/50‑1 CGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAT < 1:1495496/50‑1 CGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGT < 1:703462/43‑1 CGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGT < 1:3008870/43‑1 GCAGGTTCCCCTTCGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCCGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCTCC < 1:3360632/71‑1 GCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCTCC > 1:3313226/1‑71 GCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCTCC > 1:1445223/1‑71 GCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCTCC < 1:267394/71‑1 GCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCTCC < 1:2713371/71‑1 GCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCTCC > 1:1911704/1‑71 GCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCTC > 1:34075/1‑70 GCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCG < 1:1840277/65‑1 GCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCG < 1:1074322/65‑1 GCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCA < 1:561926/44‑1 GGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > minE/204033‑204106‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaccgCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCTCC < minE/204118‑204049 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |