| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 930253 = | 61 (1.030) | 3 (0.060) | 3/92 | NT | 5.2% | coding (565/957 nt) | yddK | hypothetical protein |
| ? | minE | 930278 = | 55 (1.030) | coding (540/957 nt) | yddK | hypothetical protein | |||||
CCTGCAACAATATCAGTTAATTGATTATGGCTGAGATTCAGGTATTGCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCTATATCAATAT > minE/930183‑930321 | ccTGCAACAATATCAGTTAATTGATTATGGCTGAGATTCAGGTATTGCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTg < 1:526128/71‑1 (MQ=255) tctatgaataataatgctctcagaaatattgatatagataggctttcatcagttacttattttagtgcgg > 1:204074‑M1/70‑70 (MQ=255) tatgaataataatgctctcagaaatattgatatagataggctttcatcagttacttattttagtgcgGc > 1:1104498‑M1/68‑69 (MQ=255) tatgaataataatgctctcagaaatattgatatagataggctttcatcagttacttattttagtgcgGc > 1:2627947‑M1/68‑69 (MQ=255) gCAACAATATCAGTTAATTGATTATGGCTGAGATTCAGGTATTGCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTGca > 1:523074/1‑70 (MQ=255) caacaaTATCAGTTAATTGATTATGGCTGAGATTCAGGTATTGCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTGcaca < 1:2885856/71‑1 (MQ=255) tgaataataatgctctcagaaatattgatatagataggctttcatcagttacttattttagtgcgGcac > 1:1335815‑M1/66‑69 (MQ=255) tgaataataatgctctcagaaatattgatatagataggctttcatcagttacttattttagtgcgGcac > 1:3249073‑M1/66‑69 (MQ=255) aacaaTATCAGTTAATTGATTATGGCTGAGATTCAGGTATTGCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTGCACaa < 1:209913/71‑1 (MQ=255) aacaaTATCAGTTAATTGATTATGGCTGAGATTCAGGTATTGCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTGCACaa < 1:1648744/71‑1 (MQ=255) acaaTATCAGTTAATTGATTATGGCTGAGATTCAGGTATTGCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTGCACaaa > 1:1717472/1‑71 (MQ=255) atatCAGTTAATTGATTATGGCTGAGATTCAGGTATTGCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTGCACAAActc < 1:2114015/71‑1 (MQ=255) tCAGTTAATTGATTATGGCTGAGATTCAGGTATTGCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTa < 1:163487/70‑1 (MQ=255) aaTTGATTATGGCTGAGATTCAGGTATTGCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTGcac > 1:1984480/1‑56 (MQ=255) aaTTGATTATGGCTGAGATTCAGGTATTGCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTGcac > 1:3406833/1‑56 (MQ=255) aaTTGATTATGGCTGAGATTCAGGTATTGCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGAt > 1:575721/1‑70 (MQ=255) gATTATGGCTGAGATTCAGGTATTGCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTAtgt > 1:1404611/1‑71 (MQ=255) agaaatattgatatagataggctttcatcagttacttattttagtgcgGCACAAACTCTAGTTGATTAtgt > 1:382679‑M1/49‑71 (MQ=255) aTTATGGCTGAGATTCAGGTATTGCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTAtgtg < 1:3195154/71‑1 (MQ=255) aTTATGGCTGAGATTCAGGTATTGCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTAtgtg > 1:2099091/1‑71 (MQ=255) ttATGGCTGAGATTCAGGTATTGCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGc < 1:1028887/71‑1 (MQ=255) ttATGGCTGAGATTCAGGTATTGCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGc < 1:2492923/71‑1 (MQ=255) aTGGCTGAGATTCAGGTATTGCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGAt < 1:1977173/62‑1 (MQ=255) aTGGCTGAGATTCAGGTATTGCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTAtgtg > 1:1890246/1‑68 (MQ=255) tgatatagataggctttcatcagttacttattttagtgcgGCACAAACTCTAGTTGATTAt < 1:2605212‑M1/21‑1 (MQ=255) cTGAGATTCAGGTATTGCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCAc > 1:1694086/1‑70 (MQ=255) gagaTTCAGGTATTGCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTa > 1:1430480/1‑70 (MQ=255) gaTTCAGGTATTGCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTg > 1:1946554/1‑37 (MQ=255) tagataggctttcatcagttacttattttagtgcgGCACAAACTCTAGTTGATTAtg > 1:348158‑M1/36‑57 (MQ=255) aTTCAGGTATTGCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGAt < 1:1163349/53‑1 (MQ=255) aTTCAGGTATTGCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGAt < 1:3445369/53‑1 (MQ=255) tCAGGTATTGCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGt > 1:208325/1‑47 (MQ=255) aGGTATTGCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTGCACAAAct > 1:2266390/1‑40 (MQ=255) aGGTATTGCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTGCACAAAct > 1:674213/1‑40 (MQ=255) aGGTATTGCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAg > 1:1347072/1‑70 (MQ=255) aGGTATTGCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGt < 1:3437880/71‑1 (MQ=255) aGGTATTGCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGt < 1:983073/71‑1 (MQ=255) aGGTATTGCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGt < 1:2336020/71‑1 (MQ=255) aTTGCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACt > 1:156644/1‑71 (MQ=255) ttGCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGt < 1:868876/66‑1 (MQ=255) gCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGtt > 1:270070/1‑39 (MQ=255) gCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACtgat > 1:3553576/1‑71 (MQ=255) gCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACtgat > 1:3563528/1‑71 (MQ=255) cAGCCATTCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACtgatg < 1:182449/71‑1 (MQ=255) gCCATTCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTGTGTGCCGCACTAAAATAAGTAACtgatga > 1:1059885/1‑70 (MQ=255) ccATTCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGAt < 1:1069053/38‑1 (MQ=255) ccATTCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGt > 1:2669043/1‑60 (MQ=255) ccATTCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGt > 1:3181510/1‑60 (MQ=255) ccATTCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACtgatg > 1:253354/1‑68 (MQ=255) ccATTCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACtgatg > 1:1484519/1‑68 (MQ=255) cATTCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAg > 1:3134411/1‑71 (MQ=255) aTTCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATa < 1:595882/55‑1 (MQ=255) aTTCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATa < 1:400138/55‑1 (MQ=255) ttCGCAAGATTCTAATTGCACAACCTCTAGTCGATTAt < 1:326223/38‑1 (MQ=255) ttCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTaa < 1:1306314/50‑1 (MQ=255) ttCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTaa < 1:1990166/50‑1 (MQ=255) ttCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATa < 1:3332911/54‑1 (MQ=255) cGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCcta > 1:3273421/1‑71 (MQ=255) cGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCcta > 1:635271/1‑71 (MQ=255) cGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCct < 1:407891/70‑1 (MQ=255) cGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCct < 1:1430575/70‑1 (MQ=255) gCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCct < 1:1192090/69‑1 (MQ=255) aaGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCctatct < 1:1191864/71‑1 (MQ=255) aaGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCctatct < 1:1532483/71‑1 (MQ=255) aaGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCctatct < 1:49147/71‑1 (MQ=255) aGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCctatcta > 1:2132888/1‑71 (MQ=255) aGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCctatcta > 1:1552706/1‑71 (MQ=255) aGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCctatct > 1:1436870/1‑70 (MQ=255) gATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCctatctat < 1:464261/71‑1 (MQ=255) aTTCTAATTGCACAATCTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTaaa < 1:433628/43‑1 (MQ=255) aTTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTaaa < 1:3454069/43‑1 (MQ=255) aTTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTaaa < 1:674791/43‑1 (MQ=255) aTTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTaaa < 1:1750497/43‑1 (MQ=255) aTTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTaaa < 1:1260031/43‑1 (MQ=255) aTTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTaa < 1:1032180/51‑1 (MQ=255) aaTTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTaa > 1:3092463/1‑46 (MQ=255) aaTTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTaa > 1:743256/1‑46 (MQ=255) aTTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATaa > 1:1342265/1‑41 (MQ=255) ttGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCTATATCAatat < 1:154970/71‑1 (MQ=255) ttGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCTATATCAatat > 1:3366186/1‑71 (MQ=255) GCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTa < 1:3235020‑M1/41‑1 (MQ=255) GCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTa < 1:3508829‑M1/41‑1 (MQ=255) GCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTa < 1:2290537‑M1/41‑1 (MQ=255) | CCTGCAACAATATCAGTTAATTGATTATGGCTGAGATTCAGGTATTGCAGCCATTCGCAAGATTCTAATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCTATATCAATAT > minE/930183‑930321 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |