| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | = 1987760 | 66 (1.120) | 5 (0.090) | 3/94 | NT | 7.9% | intergenic (‑38/+138) | ansB/yggN | periplasmic L‑asparaginase II/hypothetical protein |
| ? | minE | = 1987772 | 56 (1.030) | intergenic (‑50/+126) | ansB/yggN | periplasmic L‑asparaginase II/hypothetical protein | |||||
TGCGGCAAGTGCCGTCTTTTTGAAAAACTCCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTT > minE/1987690‑1987830 | tGCGGCAAGTGCCGTCTTTTTGAAAAACTCCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCC > 1:3649971‑M1/1‑71 (MQ=255) cGGCAAGTGCCGTCTTTTTGAAAAACTCCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCt > 1:1705616/1‑70 (MQ=255) aaGTGCCGTCTTTTTGAAAAACTCCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGct < 1:2484936/71‑1 (MQ=255) ccGTCTTTTTGAAAAACTCCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTa < 1:3694424/71‑1 (MQ=255) ccGTCTTTTTGAAAAACTCCATTTCATTACTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTa > 1:1152614/1‑71 (MQ=255) tCTTTTTGAAAAACTCCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATgg > 1:1926553‑M2/1‑69 (MQ=255) tttGAAAAACTCCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCatacagagctaagggat < 1:1098604‑M1/70‑18 (MQ=255) tttGAAAAACTCCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCatacagagctaagggat < 1:3252442‑M1/70‑18 (MQ=255) tttGAAAAACTCCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATggga > 1:2632181‑M2/1‑65 (MQ=255) tttGAAAAACTCCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGaa < 1:1134478/70‑1 (MQ=255) ttGAATAACTCCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGaaa < 1:2487910/70‑1 (MQ=255) ttGAAAAACTCCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGaaa < 1:1043589/70‑1 (MQ=255) ttGAAAAACTCCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGaaa < 1:2746081/70‑1 (MQ=255) ttGAAAAACTCCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGaaa < 1:1549720/70‑1 (MQ=255) ttGAAAAACTCCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAAt > 1:3684520/1‑71 (MQ=255) tGAAAAACTCCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCatacagagctaagggataa < 1:2294760‑M1/70‑20 (MQ=255) tGAAAAACTCCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAAtt > 1:601249/1‑71 (MQ=255) aaaaaCTCCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAAttt < 1:151136/70‑1 (MQ=255) aaaaaCTCCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAAttt < 1:1965838/70‑1 (MQ=255) aaaaaCTCCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTg < 1:1354149/71‑1 (MQ=255) aaaaCTCCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACTCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTg < 1:2545958/70‑1 (MQ=255) aaaaCTCCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGa < 1:2077224/71‑1 (MQ=255) ccATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCatacagagctaagggataa < 1:2227168‑M1/61‑20 (MQ=255) cATTTCATTCCTCCAGTTACGTGACCGCTACGCATTATCCCatacagagctaagggataatgcgtagcg < 1:3515640‑M1/69‑29 (MQ=255) cATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTa < 1:2853949/69‑1 (MQ=255) cATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTa < 1:1613044/69‑1 (MQ=255) aTTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAAc < 1:3195304/71‑1 (MQ=255) tCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACaa < 1:3403503/70‑1 (MQ=255) cATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAAtt > 1:2016352/1‑71 (MQ=255) aTTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAAttt < 1:59850/56‑1 (MQ=255) aTTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGa > 1:3584407/1‑58 (MQ=255) aTTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGa > 1:2046039/1‑58 (MQ=255) aTTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGa > 1:2533905/1‑58 (MQ=255) aTTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGa > 1:828556/1‑58 (MQ=255) cctccAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTAc < 1:1782146/70‑1 (MQ=255) cAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTATCTCTg > 1:2476818/1‑37 (MQ=255) cAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTg > 1:3563421/1‑37 (MQ=255) cAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTg > 1:1063457/1‑37 (MQ=255) cAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTg > 1:3239471/1‑37 (MQ=255) cAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTg > 1:2278541/1‑37 (MQ=255) cAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTg > 1:613213/1‑37 (MQ=255) cAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACg < 1:3022682/70‑1 (MQ=255) cAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGt > 1:1263374/1‑71 (MQ=255) gTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAAttt < 1:1538269/47‑1 (MQ=255) gTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAAttt < 1:2616947/47‑1 (MQ=255) gTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAAttt < 1:1529628/47‑1 (MQ=255) gTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAAttt < 1:3006450/47‑1 (MQ=255) gTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAAttt < 1:1369182/47‑1 (MQ=255) gTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTg > 1:1265654/1‑70 (MQ=255) tACGTGAACGCTACGAATTATCCCTTAGCTCTGTATggg < 1:44864‑M2/39‑4 (MQ=255) gTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGAc < 1:1394193/45‑1 (MQ=255) gAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAAtt > 1:1189352/1‑39 (MQ=255) gAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGa < 1:2401158/42‑1 (MQ=255) gAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGt > 1:1903663/1‑45 (MQ=255) gAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGt > 1:1925877/1‑45 (MQ=255) gAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATAtt > 1:2964284/1‑71 (MQ=255) gAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATAtt > 1:2476695/1‑71 (MQ=255) gAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATAtt > 1:2667643/1‑71 (MQ=255) aaCGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATAtt < 1:988687/70‑1 (MQ=255) aCGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATAtttt > 1:37548/1‑71 (MQ=255) aCGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATAtttt > 1:2695429/1‑71 (MQ=255) cGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATgggataatgcgtagcggtcacgtaactggaggaatgaaatg < 1:3515640‑M2/69‑42 (MQ=255) cGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAAt > 1:1417399/1‑50 (MQ=255) cGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAAt > 1:57565/1‑50 (MQ=255) cGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAAt > 1:1728285/1‑50 (MQ=255) gCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTgg < 1:202505/71‑1 (MQ=255) cTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGga < 1:1582257/71‑1 (MQ=255) aCGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGtt < 1:817855/39‑1 (MQ=255) gCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTaa > 1:1043236/1‑39 (MQ=255) gCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTa > 1:1691298/1‑38 (MQ=255) gCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATc < 1:2416283/71‑1 (MQ=255) gCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATc < 1:1120542/71‑1 (MQ=255) ttATCCCTTAGCTCTGTATgggataatgcgtagcgttcacgtaactggaggaatgaaatggagtttttca < 1:2294760‑M2/70‑52 (MQ=255) ttATCCCTTAGCTCTGTATgggataatgcgtagcgttcacgtaactggaggaatgaaatgg < 1:2227168‑M2/61‑43 (MQ=255) ttATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTa < 1:1997360/44‑1 (MQ=255) ttATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACaa < 1:509708/47‑1 (MQ=255) ttATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACaa < 1:1392312/47‑1 (MQ=255) ttATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTa > 1:664649/1‑70 (MQ=255) tATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTAc > 1:1938421/1‑70 (MQ=255) aTCCCTTAGCTCTGTATgggataatgcgtagcgttcacgtaactggaggaatgaaatggagtttttcaaa < 1:1098604‑M2/70‑54 (MQ=255) aTCCCTTAGCTCTGTATgggataatgcgtagcgttcacgtaactggaggaatgaaatggagtttttcaaa < 1:3252442‑M2/70‑54 (MQ=255) aTCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACa > 1:2613057/1‑44 (MQ=255) aTCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACa > 1:1568245/1‑44 (MQ=255) aTCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACa < 1:2156482/70‑1 (MQ=255) tCCCatacagagctaagggataatgcgtagcgttcacgtaactggaggaatgaaatggagtttttcaaa > 1:2632181‑M1/1‑4 (MQ=255) tCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGAt > 1:3272417/1‑64 (MQ=255) cccatacagagctaagggataattcgtagcgttcacgta < 1:44864‑M1/39‑37 (MQ=255) ccatacagagctaagggataatgcgtagcgttcacgtaactggaggaatgaaatggagtttttcaaaaaga > 1:1926553‑M1/1‑2 (MQ=255) ccTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGt > 1:75074/1‑71 (MQ=255) ccTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGt > 1:3470730/1‑71 (MQ=255) ccTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGt > 1:273242/1‑71 (MQ=255) cTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGtt < 1:3587401/71‑1 (MQ=255) | TGCGGCAAGTGCCGTCTTTTTGAAAAACTCCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTT > minE/1987690‑1987830 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |