New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | minE | 1999373 = | 38 (0.640) | 7 (0.170) | 3/72 | NT | 24.2% | intergenic (‑242/+50) | pitB/gss | phosphate transporter/fused glutathionylspermidine amidase and glutathionylspermidine synthetase |
? | minE | 1999408 = | 17 (0.410) | intergenic (‑277/+15) | pitB/gss | phosphate transporter/fused glutathionylspermidine amidase and glutathionylspermidine synthetase |
ACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGTTGCTACAACATGTATTACTTTTTCACCACAATTA > minE/1999303‑1999442 | actggtcatcaaaaaagagagtgatattgaaccgttaattgtggtgaaaaagtaatacatgttgtagcaac > 1:3291511‑M1/71‑71 (MQ=255) tAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTa > 1:1823864/1‑71 (MQ=255) catcaaaaaagagagtgatattgaaccgttaattgtggtgaaaaagtaatacatgttgtagcaacccc < 1:2406908‑M1/4‑1 (MQ=255) catcaaaaaagagagtgatattgaaccgttaattgtggtgaaaaagtaatacatgttgtagcaaCCCCGTa < 1:381137‑M1/7‑1 (MQ=255) atcaaaaaagagagtgatattgaaccgttaattgtggtgaaaaagtaatacatgttgtagcaaCCCCg > 1:3857‑M1/64‑68 (MQ=255) atatatTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACt < 1:265285/71‑1 (MQ=255) aaaaaagagagtgatattgaaccgttaattgtggtgaaaaagtaatacatgttgtagcaacc < 1:3552847‑M1/2‑1 (MQ=255) aaaaaagagagtgatattgaaccgttaattgtggtgaaaaagtaatacatgttgtagcaacc < 1:2189024‑M1/2‑1 (MQ=255) atTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATcc > 1:3272151/1‑60 (MQ=255) aaaagagagtgatattgaaccgttaattgtggtgaaaaagtaatacatgttgtagcaaCCCCGTACTGat < 1:1703071‑M1/12‑1 (MQ=255) aaagagagtgatattgaaccgttaattgtggtgaaaaagtaatacatgttgtagcaaCCCCGTGCTGatt < 1:3717176‑M1/13‑1 (MQ=255) aagagagtgatattgaaccgttaattgtggtgaaaaagtaatacatgttgtagcaaCCCCGTACTGattat > 1:2845060‑M1/57‑71 (MQ=255) gaaatgaaTAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTa > 1:2059926/1‑55 (MQ=255) atgaaTAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAAt > 1:599512/1‑70 (MQ=255) atgaaTAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATCTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATc < 1:1952916/71‑1 (MQ=255) tgaaTAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAAt > 1:2167751/1‑69 (MQ=255) taaataTTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTAc < 1:2639970/71‑1 (MQ=255) taaataTTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTAc < 1:2337636/71‑1 (MQ=255) taaataTTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTAc < 1:3361359/71‑1 (MQ=255) ccgttaattgtggtgaaaaagtaatacatgttgtagcaaccc < 1:3728813‑M1/3‑1 (MQ=255) tatTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACgggg > 1:1069888/1‑71 (MQ=255) tatTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACgggg < 1:2583421/71‑1 (MQ=255) ttGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGtt > 1:3507239/1‑71 (MQ=255) ttGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGtt > 1:550537/1‑71 (MQ=255) ggAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAAt > 1:85654/1‑57 (MQ=255) gAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGTTGc < 1:1872661/70‑1 (MQ=255) gAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGTTGCt < 1:3478794/71‑1 (MQ=255) atatatAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGTTGCTa > 1:2872891/1‑70 (MQ=255) tatataAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGTTGCTac < 1:384247/70‑1 (MQ=255) ataAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTAc < 1:3332872/56‑1 (MQ=255) ataAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTAc < 1:3642601/56‑1 (MQ=255) taAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAAt < 1:576426/49‑1 (MQ=255) taAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAAt < 1:1404733/49‑1 (MQ=255) aaaTATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGattat > 1:1953733/1‑38 (MQ=255) aaaTATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACgg > 1:953383/1‑56 (MQ=255) aaaTATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACgg > 1:2706332/1‑56 (MQ=255) aaaTATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGTTGCTaca < 1:94092/66‑1 (MQ=255) aaaTATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGTTGCTACAACATg > 1:1040699/1‑71 (MQ=255) aaagtaatacatgttgtagcaaCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATc > 1:1130000‑M1/23‑48 (MQ=255) aaTATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGTTGCTACAACATg < 1:1790262/70‑1 (MQ=255) ttGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACgggg < 1:2913955/53‑1 (MQ=255) ttGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACgggg < 1:820991/53‑1 (MQ=255) ttGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACgggg < 1:2354893/53‑1 (MQ=255) ttGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGTTGCTACAACATGTATTa < 1:3396439/71‑1 (MQ=255) gAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGTTGCTACAACATGTATTACt > 1:2968012/1‑71 (MQ=255) atacatgttgtagcaaCCCCGTACTGATTATTCTTCATa > 1:2940957‑M1/17‑39 (MQ=255) atacatgttgtagcaaCCCCGTACTGATTATTCTTCATa > 1:2480159‑M1/17‑39 (MQ=255) atacatgttgtagcaaCCCCGTACTGATTATTCTTCATa > 1:1432659‑M1/17‑39 (MQ=255) aaTATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAAt < 1:2349033/40‑1 (MQ=255) aaTATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAAt < 1:1469756/40‑1 (MQ=255) acatgttgtagcaaCCCCGTACTGATTATTCTTCATaa < 1:3069590‑M1/24‑1 (MQ=255) acatgttgtagcaaCCCCGTACTGATTATTCTTCATAAt < 1:2748362‑M1/25‑1 (MQ=255) acatgttgtagcaaCCCCGTACTGATTATTCTTCATAAt < 1:1937170‑M1/25‑1 (MQ=255) tatTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGTTGCTACAACATGTATTACtttt > 1:488484/1‑71 (MQ=255) tatTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGTTGCTACAACATGTATTACttt > 1:2427485/1‑70 (MQ=255) ttttGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGTTGCTACAACATGTATTACttttt < 1:2195700/70‑1 (MQ=255) tAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGTTGCTACAACATGTATTACTTTTTCACCACaa > 1:2597069/1‑71 (MQ=255) tAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGTTGCTACAACATGTATTACTTTTTCACCACaa > 1:472416/1‑71 (MQ=255) aaTCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGTTGCTACAACATGTATTACTTTTTCACCACaa < 1:1722259/70‑1 (MQ=255) aaTCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGTTGCTACAACATGTATTACTTTTTCACCACaa < 1:871092/70‑1 (MQ=255) aTCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGTTGCTACAACATGTATTACTTTTTCACCACAAt > 1:2063295/1‑70 (MQ=255) tCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGTTGCTACAACATGTATTACTTTTTCACCACAAtt > 1:1737761/1‑70 (MQ=255) tCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGTTGCTACAACATGTATTACTTTTTCACCACAATTa < 1:2451943/71‑1 (MQ=255) CCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGTTGCTACAACAt < 1:2309114‑M1/47‑1 (MQ=255) | ACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGTTGCTACAACATGTATTACTTTTTCACCACAATTA > minE/1999303‑1999442 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |