| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 2395757 = | 88 (1.490) | 4 (0.080) | 3/90 | NT | 5.6% | coding (338/381 nt) | yigG | predicted inner membrane protein |
| ? | minE | 2395785 = | 56 (1.080) | coding (366/381 nt) | yigG | predicted inner membrane protein | |||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
ATGATAGCCGAAGATTTTGCCTGTTCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACTGATTCATCAAAACAATAGTTATGGAGTATTTATGAGTAAGGAATA > minE/2395687‑2395827 | ttttcacttaatgaaccatcgttcatatattccttactcataaatactccataactattgttttgatgaat < 1:3247424‑M1/1‑1 (MQ=255) tGATAGCCGAAGATTTTGCCTGTTCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACttt > 1:2406285/1‑70 (MQ=255) gATAGCCGAAGATTTTGCCTGTTCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACttt > 1:2594333/1‑69 (MQ=255) tcacttaatgaaccatcgttcatatattccttactcataaatactccataactattgttttgatgaat > 1:1122945‑M1/68‑68 (MQ=255) tcacttaatgaaccatcgttcatatattccttactcataaatactccataactattgttttgatgaat > 1:3158022‑M1/68‑68 (MQ=255) tcacttaatgaaccatcgttcatatattccttactcataaatactccataactattgttttgatgaat > 1:689148‑M1/68‑68 (MQ=255) tcacttaatgaaccatcgttcatatattccttactcataaatactccataactattgttttgatgaaTCa > 1:2832145‑M1/68‑70 (MQ=255) tcacttaatgaaccatcgttcatatattccttactcataaatactccataactattgttttgatgaaTCa > 1:2365083‑M1/68‑70 (MQ=255) aTAGCCGAAGATTTTGCCTGTTCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAg < 1:725578/71‑1 (MQ=255) aTAGCCGAAGATTTTGCCTGTTCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAg < 1:3467592/71‑1 (MQ=255) tAGCCGAAGATTTTGCCTGTTCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGt < 1:2408423/71‑1 (MQ=255) cacttaatgaaccatcgttcatatattccttactcataaatactccataactattgttttgatgaaTCAg < 1:2041621‑M1/4‑1 (MQ=255) acttaatgaaccatcgttcatatattccttactcataaatactccataactattgttttgatgaaTCAGTa > 1:1710126‑M1/66‑71 (MQ=255) acttaatgaaccatcgttcatatattccttactcataaatactccataactattgttttgatgaaTCAGTa > 1:2445260‑M1/66‑71 (MQ=255) aGCCGAAGATTTTGCCTGTTCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTa > 1:1526340/1‑71 (MQ=255) aGCCGAAGATTTTGCCTGTTCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTa > 1:2195597/1‑71 (MQ=255) aGCCGAAGATTTTGCCTGTTCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTa > 1:920187/1‑71 (MQ=255) gCCGAAGATTTTGCCTGTTCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTAt < 1:584445/71‑1 (MQ=255) gAAGATTTTGCCTGTTCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCt < 1:1299359/71‑1 (MQ=255) gAAGATTTTGCCTGTTCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCt < 1:750264/71‑1 (MQ=255) gAAGATTTTGCCTGTTCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCt < 1:2812107/71‑1 (MQ=255) aGATTTTGCCTGTTCTGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTaa > 1:1808818/1‑71 (MQ=255) aGATTTTGCCTGTTCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTaa > 1:2903172/1‑71 (MQ=255) aGATTTTGCCTGTTCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTaa > 1:2843211/1‑71 (MQ=255) tttGCCTGTTCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTa > 1:2489784/1‑61 (MQ=255) tttGCCTGTTCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTa > 1:460778/1‑61 (MQ=255) tttGCCTGTTCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTa > 1:522504/1‑61 (MQ=255) ttGCCTGTTCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCtt > 1:3076311/1‑71 (MQ=255) tGCCTGTTCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCtt < 1:1602227/70‑1 (MQ=255) tGCCTGTTCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCtt < 1:2066960/70‑1 (MQ=255) gCCTGTTCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTg > 1:300014/1‑70 (MQ=255) gCCTGTTCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTg > 1:248033/1‑70 (MQ=255) ccTGTTCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGc < 1:3421161/70‑1 (MQ=255) ccTGTTCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCa > 1:2797323/1‑71 (MQ=255) cTGTTCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCt < 1:2544686/66‑1 (MQ=255) cTGTTCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCt < 1:2239048/66‑1 (MQ=255) cTGTTCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCt < 1:1553041/66‑1 (MQ=255) gTTCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGt < 1:2861223/53‑1 (MQ=255) gTTCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGt < 1:1563962/53‑1 (MQ=255) gTTCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGt < 1:2533135/53‑1 (MQ=255) gTTCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCAcc > 1:2360134/1‑70 (MQ=255) gTTCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCAcc > 1:3241006/1‑70 (MQ=255) gTTCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCAcc > 1:3722481/1‑70 (MQ=255) gTTCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGATaa > 1:2155860/1‑60 (MQ=255) ttCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCAcc < 1:1951319/69‑1 (MQ=255) ttCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCAcc < 1:3249476/69‑1 (MQ=255) ttCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTa > 1:1291602/1‑71 (MQ=255) catatattccttactcataaatactccataactattgttttgatgaaTCAGTATGCTAATGCTTGCACCt > 1:951757‑M1/48‑70 (MQ=255) catatattccttactcataaatactccataactattgttttgatgaaTCAGTATGCTAATGCTTGCACCt > 1:1592284‑M1/48‑70 (MQ=255) tCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGc < 1:1383599/65‑1 (MQ=255) tCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCAcc < 1:2316937/68‑1 (MQ=255) tCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTAc > 1:2247628/1‑71 (MQ=255) aGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACt < 1:1423542/70‑1 (MQ=255) ggCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACtaa < 1:2115102/71‑3 (MQ=255) aaTGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACttt > 1:3707173/1‑41 (MQ=255) aaTGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACttt > 1:712548/1‑41 (MQ=255) aaTGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGt > 1:3729964/1‑45 (MQ=255) aaTGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACTGAtt > 1:29109/1‑70 (MQ=255) aTGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACTGATtca < 1:1798231/71‑1 (MQ=255) aTGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACTGATtca < 1:1946476/71‑1 (MQ=255) ggTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTa > 1:1336983/1‑61 (MQ=255) ggTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTa > 1:3314068/1‑61 (MQ=255) ttCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACTGATTCATCaa < 1:386345/71‑1 (MQ=255) ttCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACTGATTCATCaa < 1:1117697/71‑1 (MQ=255) tCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGc < 1:2687382/53‑1 (MQ=255) tCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGc < 1:3132160/53‑1 (MQ=255) cGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACTg < 1:3024061/60‑1 (MQ=255) atgatTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTaa < 1:3379036/43‑1 (MQ=255) atgatTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACTGATTCATCAAAACa < 1:3140500/71‑1 (MQ=255) atgatTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACTGATTCATCAAAACa < 1:1186934/71‑1 (MQ=255) atgatTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACTGATTCATCAAAACa < 1:1995068/71‑1 (MQ=255) tgatTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACTGATTCATCAAAACaa < 1:1419554/71‑1 (MQ=255) tttttttGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACt > 1:1871004/1‑53 (MQ=255) tttttttGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACt > 1:3006851/1‑53 (MQ=255) tttttttGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACt > 1:642710/1‑53 (MQ=255) tttttttGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACt > 1:2818954/1‑53 (MQ=255) tttttttGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACt > 1:1421749/1‑53 (MQ=255) tttttGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACTGATTCATCAAAACAATa > 1:3646916/1‑68 (MQ=255) tttGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACTGATTCATCAAAACAATAGTTa < 1:2446081/70‑1 (MQ=255) tGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACTGATTCATCAAAACAATAGTTATg < 1:2263825/70‑1 (MQ=255) tGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACTGATTCATCAAAACAATAGTTATg > 1:3421403/1‑70 (MQ=255) gATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACTGATTCATCAAAACAATAGTTATgg < 1:355468/70‑1 (MQ=255) tttGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACTGATTCATCAAAACAATAg < 1:1635614/62‑1 (MQ=255) tttGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACTGATTCATCAAAACAATAGTTATGGAGt < 1:2334693/71‑1 (MQ=255) tGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACTGATTCATCAAAACAATAGTTATGGAg < 1:1372008/68‑1 (MQ=255) ttATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACTGATTCATCAAAACAATAGTTATGGAGTAtt < 1:2903430/70‑1 (MQ=255) tATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACTGATTCATCAAAACAATAGTTa > 1:3607974/1‑60 (MQ=255) tATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACTGATTCATCAAAACAATAGTTATGGAGTATTTa > 1:3367886/1‑71 (MQ=255) tATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACTGATTCATCAAAACAATAGTTATGGAGTATTTa > 1:2404283/1‑71 (MQ=255) tATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACTGATTCATCAAAACAATAGTTATGGAGTATTTa > 1:3363586/1‑71 (MQ=255) tttttCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACTGATTCATCAAAACAATAGTTATGGAGTATTTAt > 1:624058/1‑70 (MQ=255) tCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACTGATTCATCAAAACAATAGTTATGGAGTATTTATGAGt < 1:154274/70‑1 (MQ=255) tCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACTGATTCATCAAAACAATAGTTATGGAGTATTTATGAGt < 1:3365091/70‑1 (MQ=255) tCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACTGATTCATCAAAACAATAGTTATGGAGTATTTATGAGt < 1:2642934/70‑1 (MQ=255) ccACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACTGATTCATCAAAACAATAGTTATGGAGTATTTATGAGTa < 1:3607206/70‑1 (MQ=255) aCTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACTGATTCATCAAAACAATAGTTATGGAGTATTTATGAGTAAgg < 1:815924/71‑1 (MQ=255) tttCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACTGATTCATCAAAACAATAGTTAttg > 1:1206894/1‑50 (MQ=255) tttCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACTGATTCATCAAAACAATAGTTATGGAGTATTTATGAGTAAGGaa > 1:3566474/1‑71 (MQ=255) ttCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACTGATTCATCAAAACAAt > 1:391612/1‑43 (MQ=255) TCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACTGATTCATCAAAACAATAGTTATGGAGTATTTATGAGTAAGGAata < 1:2528327‑M1/71‑1 (MQ=255) | ATGATAGCCGAAGATTTTGCCTGTTCAGGCAATGGTTCGATGATTTTTTTGATTTGTTATTTTTCCACTTTCAGTATGCTAATGCTTGCACCTACTGATTCATCAAAACAATAGTTATGGAGTATTTATGAGTAAGGAATA > minE/2395687‑2395827 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |