| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 2463558 = | 45 (0.760) | 5 (0.090) | 4/92 | NT | 10.8% | intergenic (+221/‑396) | gidB/atpI | methyltransferase, glucose‑inhibited cell‑division protein/ATP synthase, membrane‑bound accesory subunit |
| ? | minE | 2463597 = | 42 (0.790) | intergenic (+260/‑357) | gidB/atpI | methyltransferase, glucose‑inhibited cell‑division protein/ATP synthase, membrane‑bound accesory subunit | |||||
TTAGTGAAAATATCAGTCTGCTAAAAATCGGCGCTAAGAACCATCATTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTAAATGTCATTTATTAAAACAGTATCTGTTTTTAGACTGAAA > minE/2463490‑2463626 | atttacttggcaaatgatgcctttgcaagtttatgatatttcagtctaaaaacagatactgttttaata > 1:2935127‑M1/69‑69 (MQ=255) aGTGAAAATATCAGTCTGCTAAAAATCGGCGCTAAGAACCATCATTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAATg > 1:1384108/1‑71 (MQ=255) tGAAAATATCAGTCTGCTAAAAATCGGCGCTAAGAACCATCATTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAATg > 1:507328/1‑69 (MQ=255) gAAAATATCAGTCTGCTAAAAATCGGCGCTAAGAACCATCATTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAATGTc > 1:193412/1‑70 (MQ=255) aaaaTATCAGTCTGCTAAAAATCGGCGCTAAGAACCATCATTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAATGTCaa > 1:1079281/1‑71 (MQ=255) aaaaTATCAGTCTGCTAAAAATCGGCGCTAAGAACCATCATTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAATGTCaa < 1:1585890/71‑1 (MQ=255) aaaaTATCAGTCTGCTAAAAATCGGCGCTAAGAACCATCATTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAATGTCa < 1:1380819/70‑1 (MQ=255) aaaTATCAGTCTGCTAAAAATCGGCGCTAAGAACCATCATTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAATGTCaa < 1:3366486/70‑1 (MQ=255) atatCAGTCTGCTAAAAATCGGCGCTAAGAACCATCATTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAATGTCAATgg > 1:2368475/1‑71 (MQ=255) tCAGTCTGCTAAAAATCGGCGCTAAGAACCATCATTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAATGTCAATGggtg > 1:1928800/1‑71 (MQ=255) tCAGTCTGCTAAAAATCGGAGCTAAGAACCATCATTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAATGTCAATGggtg > 1:1695305/1‑71 (MQ=255) tCTGCTAAAAATCGGCGCTAAGAACCATCATTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAATGTCaa < 1:3419821/61‑1 (MQ=255) tCTGCTAAAAATCGGCGCTAAGAACCATCATTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAATGTCAATGGGTGGttt < 1:1006731/71‑1 (MQ=255) aaaaaTCGGCGCTAAGAACCATCATTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAATGTCAATGGGTGGTTTttg < 1:2468646/68‑1 (MQ=255) aaaaTCGGCGCTAAGAACCATCATTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAATGTCaa > 1:899720/1‑54 (MQ=255) aaaaTCGGCGCTAAGAACCATCATTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAATGTCaa > 1:208649/1‑54 (MQ=255) aTCGGCGCTAAGAACCATCATTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTa < 1:3566583/71‑1 (MQ=255) gtttatgatatttcagtctaaaaacagatactgttttaatAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTaaa < 1:1936799‑M1/31‑1 (MQ=255) ggCGCTAAGAACCATCATTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTAAAt < 1:1859495/71‑1 (MQ=255) gcTAAGAACCATCATTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAATGTc < 1:1657984/43‑1 (MQ=255) gcTAAGAACCATCATTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTAAATGt > 1:3541355/1‑70 (MQ=255) gcTAAGAACCATCATTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTAAATGt > 1:2743462/1‑70 (MQ=255) gcTAAGAACCATCATTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTAAATGt > 1:1009321/1‑70 (MQ=255) gcTAAGAACCATCATTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTAAATGt > 1:1267270/1‑70 (MQ=255) cTAAGAACCATCATTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAAt > 1:2052434/1‑39 (MQ=255) cTAAGAACCATCATTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAAt > 1:3469948/1‑39 (MQ=255) cTAAGAACCATCATTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAAt > 1:1354674/1‑39 (MQ=255) cTAAGAACCATCATTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTAAATGTCa < 1:2665170/71‑1 (MQ=255) tatttcagtctaaaaacagatactgttttaatAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTAAATGTCAtt > 1:2450703‑M1/33‑70 (MQ=255) aGAACCATCATTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTAAATGTCAtt > 1:1411826/1‑70 (MQ=255) gAACCATCATTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTaa < 1:1962778/61‑1 (MQ=255) gAACCATCATTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTaa < 1:1661321/61‑1 (MQ=255) gAACCATCATTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTaa < 1:2604762/61‑1 (MQ=255) gAACCATCATTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTAAATGTCa > 1:1533241/1‑67 (MQ=255) tttcagtctaaaaacagatactgttttaatAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTAAATGTCATtta > 1:2342566‑M1/31‑70 (MQ=255) catcatTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTAAATGTCAttt > 1:245323/1‑66 (MQ=255) atTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTAAATGTCATTTATTaaaa > 1:2235436/1‑69 (MQ=255) atTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTAAATGTCATTTATTAAAAc < 1:815732/70‑1 (MQ=255) atTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTAAATGTCATTTATTAAAACa < 1:1815666/71‑1 (MQ=255) ttGGCTGTTAAAACATTATTAAAAATGTCAATGGGTGGTTTttgtt < 1:1598886/46‑1 (MQ=255) taaaaacagatactgttttaatAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTAAATGTCa > 1:2867287‑M1/23‑58 (MQ=255) taaaaacagatactgttttaatAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTAAATGTCa > 1:2237392‑M1/23‑58 (MQ=255) tGGCTGTTAAAACATTATTAAAAATGTCAATGGGTGGttttt < 1:418925/42‑1 (MQ=255) ggCTGTTAAAACATTATTAAAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTAATTGTCATTTATTAAAACAGTa > 1:1349294/1‑71 (MQ=255) gCTGTTAAAACATTATTAAAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTAAATGTCATTTATTAAAACAGTAt < 1:2217911/71‑1 (MQ=255) cTGTTAAAACATTATTAAAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTAAATGTCATttatta < 1:1678389/61‑1 (MQ=255) cTGTTAAAACATTATTAAAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTAAATGTCATTTATTAAAACAGTATc > 1:500163/1‑71 (MQ=255) gTTAAAACATTATTAAAAATGTCGATGGGTGGTTTTTGTTGTGTAAATGTCATTTATTaaa > 1:2080903/1‑61 (MQ=255) aaaaCATTATTAAAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTAAATGTCATTTATTAAAACAGTATCTGttt > 1:2294095/1‑71 (MQ=255) aaaaCATTATTAAAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTAAATGTCATTTATTAAAACAGTATCTGtt < 1:195997/70‑1 (MQ=255) aaaCATTATTAAAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTAAATGTCATTTATTaaaa > 1:3072205/1‑58 (MQ=255) aaaCATTATTAAAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTAAATGTCATTTATTaaaa > 1:2253498/1‑58 (MQ=255) aaaCATTATTAAAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTAAATGTCATTTATTaaaa > 1:1805337/1‑58 (MQ=255) tattaAAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTAAATGTCATTTATTAAAACAGTATCTGTTTTTAGACt > 1:2828360/1‑71 (MQ=255) tattaAAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTAAATGTCATTTATTAAAACAGTATCTGTTTTTAGACt > 1:2538595/1‑71 (MQ=255) tattaAAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTAAATGTCATTTATTAAAACAGTATCTGTTTTTAGACt > 1:3178049/1‑71 (MQ=255) ttaAAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTAAATGTCATTTATTAAAACAGTATCTGTTTTTAGACTg > 1:959262/1‑70 (MQ=255) ttaAAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTAAATGTCATTTATTAAAACAGTATCTGTTTTTAGACTg > 1:2426967/1‑70 (MQ=255) aaaaTGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTAAATGTCATTTATTAAAACAGTATCTGTTTTTAGACTGaaa > 1:696612/1‑70 (MQ=255) AAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTAAATGTCATTTATTaa < 1:2035693‑M1/44‑1 (MQ=255) | TTAGTGAAAATATCAGTCTGCTAAAAATCGGCGCTAAGAACCATCATTGGCTGTTAAAACATTATTAAAAATGTCAATGGGTGGTTTTTGTTGTGTAAATGTCATTTATTAAAACAGTATCTGTTTTTAGACTGAAA > minE/2463490‑2463626 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |