| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 152453 = | 111 (1.880) | 6 (0.120) | 4/90 | NT | 6.5% | coding (1255/1281 nt) | hemL | glutamate‑1‑semialdehyde aminotransferase |
| ? | minE | 152488 = | 76 (1.460) | coding (1220/1281 nt) | hemL | glutamate‑1‑semialdehyde aminotransferase | |||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
CATGCTGGATCACAACTTCGCAAACACCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTAAACACCTTCGTCCAGCATCATATG > minE/152418‑152558 | tcagcgtttgaagcgggctttatgtccgtggcgcaCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCtgt > 1:3351454‑M1/36‑71 (MQ=255)cATGCTGGATCACAACTTCGCAAACACCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCtgt < 1:946937/71‑1 (MQ=255) tGCAGGATCACAACTTCGCAAACACCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTgc > 1:300701/1‑71 (MQ=255) gCTGGATCACAACTTCGCAAACACCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTgcg > 1:2549294/1‑71 (MQ=255) cTGGATCACAACTTCGCAAACACCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTgcgc > 1:2122605/1‑71 (MQ=255) ggATCACAACTTCGCAAACACCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCa > 1:3318946/1‑71 (MQ=255) gATCACAACTTCGCAAACACCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCa > 1:2927616/1‑70 (MQ=255) gATCACAACTTCGCAAACACCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCAc > 1:2092816/1‑71 (MQ=255) aTCACAACTTCGCAAACACCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACg > 1:3720305/1‑71 (MQ=255) tCACAACTTCGCAAACACCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACgg < 1:2936253/71‑1 (MQ=255) tCACAACTTCGCAAACACCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACgg < 1:3425331/71‑1 (MQ=255) tCACAACTTCGCAAACACCCGACGAGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACgg < 1:1762473/71‑1 (MQ=255) cacaACTTCGCAAACACCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGa > 1:2361545/1‑71 (MQ=255) cacaACTTCGCAAACACCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGa > 1:1169811/1‑71 (MQ=255) cacaACTTCGCAAACACCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGa > 1:2311367/1‑71 (MQ=255) acaACTTCGCAAACACCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGAc < 1:3354643/71‑1 (MQ=255) acaACTTCGCAAACACCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGAc < 1:1968338/71‑1 (MQ=255) caACTTCGCAAACACCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACTGACa < 1:2372358/71‑1 (MQ=255) caACTTCGCAAACACCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACa < 1:2621436/71‑1 (MQ=255) caACTTCGCAAACACCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACa < 1:209540/71‑1 (MQ=255) aaCTTCGCAAACACCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACa < 1:1591919/70‑1 (MQ=255) aaCTTCGCAAACACCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACa < 1:137586/70‑1 (MQ=255) aCTTCGCAAACACCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACAt > 1:1041740/1‑70 (MQ=255) cTTCGCAAACACCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATaa < 1:444974/71‑1 (MQ=255) gCAAACACCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGcc < 1:110360/71‑1 (MQ=255) gCAAACACACGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGcc > 1:2587232/1‑71 (MQ=255) aaaCACCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCg < 1:2484205/71‑1 (MQ=255) aaCACCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGc > 1:1198397/1‑71 (MQ=255) acacCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCt > 1:289839/1‑71 (MQ=255) acacCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCt > 1:2279012/1‑71 (MQ=255) cacCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGa > 1:3517303/1‑57 (MQ=255) cacCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGa > 1:540274/1‑57 (MQ=255) cacCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGa > 1:2912501/1‑57 (MQ=255) cacCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGa > 1:3340561/1‑57 (MQ=255) cacCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGa > 1:2527630/1‑57 (MQ=255) cacCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCtt > 1:584169/1‑71 (MQ=255) acCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCtt > 1:1566920/1‑70 (MQ=255) acCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCtt > 1:2311701/1‑70 (MQ=255) cccGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCa < 1:1216458/71‑1 (MQ=255) cccGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCa < 1:341315/71‑1 (MQ=255) cccGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCa < 1:3394906/71‑1 (MQ=255) ccGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTc > 1:3297393/1‑69 (MQ=255) ccGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTc > 1:3552135/1‑69 (MQ=255) ccGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTc > 1:3433138/1‑69 (MQ=255) ccGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTc > 1:1567202/1‑69 (MQ=255) ccGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCaa < 1:1677403/71‑1 (MQ=255) ccGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCa < 1:3411408/70‑1 (MQ=255) gACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATa > 1:2390900/1‑56 (MQ=255) gACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATa > 1:1715572/1‑56 (MQ=255) gACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAAc < 1:442999/71‑1 (MQ=255) gACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAAc < 1:2052894/71‑1 (MQ=255) gACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAAc < 1:2289018/71‑1 (MQ=255) gACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCATCCATGCTGTGCGCCACGGACATa > 1:586006/1‑56 (MQ=255) aCGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACg < 1:847928/71‑1 (MQ=255) aCGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACg > 1:3087863/1‑71 (MQ=255) aCGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACg < 1:1238775/71‑1 (MQ=255) aCGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACg > 1:1533656/1‑71 (MQ=255) cagcatggaagatatcaataacaccatcgatgctgTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGAc > 1:2779381‑M2/36‑71 (MQ=255) CAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATa > 1:2957293‑M1/1‑50 (MQ=255) atggaagatatcaataacaccatcgatgctgTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCtt > 1:3659732‑M2/32‑56 (MQ=255) atggaagatatcaataacaccatcgatgctgTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCtt > 1:2051800‑M2/32‑56 (MQ=255) ATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGccc < 1:723809‑M1/52‑1 (MQ=255) gtgtTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGt < 1:3473670/70‑1 (MQ=255) tgtTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTa > 1:406840/1‑70 (MQ=255) cttATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCAAGGTaa < 1:3060/69‑1 (MQ=255) aTTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTAAacac > 1:617973/1‑71 (MQ=255) ttGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAg < 1:3160771/36‑1 (MQ=255) ttGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTaa < 1:837444/66‑1 (MQ=255) ttGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTAAACAcc > 1:1962206/1‑71 (MQ=255) gATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGcc > 1:3376571/1‑36 (MQ=255) atatCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCaaa > 1:3602391/1‑44 (MQ=255) tatCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACgg > 1:2013395/1‑52 (MQ=255) tatCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACgg > 1:1099265/1‑52 (MQ=255) atCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTAAACACCTTCGt > 1:3168750/1‑71 (MQ=255) atCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTAAACACCTTCGt > 1:868008/1‑71 (MQ=255) tCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACg > 1:3557873/1‑43 (MQ=255) tCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACg > 1:2870761/1‑43 (MQ=255) tCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGAc > 1:736245/1‑48 (MQ=255) tCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTaaa > 1:826989/1‑61 (MQ=255) tCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTaaa > 1:1183401/1‑61 (MQ=255) tCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTaaa > 1:2530712/1‑61 (MQ=255) ccATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTaa > 1:2925587/1‑56 (MQ=255) ccATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTAAACACCTTCGTcc < 1:1871063/68‑1 (MQ=255) ccATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTAAACACCTTCGTCCAg > 1:1583193/1‑70 (MQ=255) tgctgTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTg < 1:1499803‑M2/40‑1 (MQ=255) tgctgTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTg < 1:936896‑M2/40‑1 (MQ=255) tgctgTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTg < 1:589129‑M2/40‑1 (MQ=255) tgctgTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTg < 1:2104737‑M2/40‑1 (MQ=255) tgctgTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTAAACACCTTCGt > 1:1745279‑M2/6‑63 (MQ=255) tgctgTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTAAACACCTTCGt > 1:305411‑M2/6‑63 (MQ=255) tgctgTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTAAACACCTTCGt > 1:2402075‑M2/6‑63 (MQ=255) gctgTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTAAACACCTTCGTCCAGcatc > 1:3287055‑M2/5‑70 (MQ=255) ctgTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTAAACACCTTCGTCCAGcatca > 1:3465499‑M2/4‑70 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |