| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 204107 = | NA (NA) | 26 (0.490) | 6/92 | NT | 100% | noncoding (1512/1542 nt) | rrsH | 16S ribosomal RNA |
| ? | minE | 204119 = | 0 (0.000) | noncoding (1524/1542 nt) | rrsH | 16S ribosomal RNA | |||||
AGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGA > minE/204051‑204189 | aatctgtgtgagcactgcaaagtacgcttctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCgg < 1:372922‑M2/3‑1 (MQ=255)aatctgtgtgagcactgcaaagtacgcttctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCgg > 1:1712199‑M2/69‑71 (MQ=255) atctgtgtgagcactgcaaagtacgcttctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCGGt < 1:2270621‑M2/4‑1 (MQ=255) atctgtgtgagcactgcaaagtacgcttctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttccactaCGGt < 1:1055271‑M2/4‑1 (MQ=255) tctgtgtgagcactgcaaagtacgcttctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCGGt > 1:2346932‑M2/67‑70 (MQ=255) tctgtgtgagcactgcaaagtacgcttctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCGGt > 1:1787985‑M2/67‑70 (MQ=255) ctgtgtgagcactgcaaagtacgcttctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCGGtt > 1:377437‑M2/66‑70 (MQ=255) ctgtgtgagcactgcaaagtacgcttctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCGGtt > 1:3528190‑M2/66‑70 (MQ=255) ctgtgtgagcactgcaaagtacgcttctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCGGt > 1:2122459‑M2/66‑69 (MQ=255) ctgtgtgagcactgcaaagtacgcttcttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCGGtt > 1:1808109‑M2/65‑69 (MQ=255) cactgcaaagtacgcttctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCGGtt > 1:853489‑M2/57‑61 (MQ=255) cactgcaaagtacgcttctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCGGtt > 1:2213985‑M2/57‑61 (MQ=255) cactgcaaagtacgcttctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCGGtt > 1:1942791‑M2/57‑61 (MQ=255) acgcttctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCg > 1:3675114‑M2/46‑47 (MQ=255) acgcttctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCg > 1:3597656‑M2/46‑47 (MQ=255) cgcttctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCgg > 1:433283‑M2/45‑47 (MQ=255) cgcttctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCgg > 1:320163‑M2/45‑47 (MQ=255) tctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCGGtt < 1:1249807‑M2/5‑1 (MQ=255) tctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCGGtt < 1:2457300‑M2/5‑1 (MQ=255) tctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCGGtt < 1:1624427‑M2/5‑1 (MQ=255) tttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCGGtt < 1:3460946‑M2/5‑1 (MQ=255) tttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCGGt > 1:2852529‑M2/39‑42 (MQ=255) aggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCGGtt < 1:3108369‑M2/5‑1 (MQ=255) aggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCGGtt < 1:741473‑M2/5‑1 (MQ=255) aggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCGGtt < 1:3534639‑M2/5‑1 (MQ=255) gtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCGGt > 1:545049‑M2/33‑36 (MQ=255) gtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCGGt > 1:1781847‑M2/33‑36 (MQ=255) taaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCGGtt > 1:3228347‑M2/32‑36 (MQ=255) aaccgcaggttcccctaCGGTTGGTTCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAg < 1:1745378‑M2/42‑1 (MQ=255) aaccgcaggttcccctaCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAaagaag < 1:2069272‑M2/30‑1 (MQ=255) aaccgcaggttcccctaCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAaagaag < 1:3587261‑M2/30‑1 (MQ=255) aaccgcaggttcccctaCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAaaga < 1:785251‑M2/28‑1 (MQ=255) aaccgcaggttcccctaCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAaaga < 1:1517395‑M2/28‑1 (MQ=255) aaccgcaggttcccctaCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGCAGTGCt > 1:3652323‑M2/18‑63 (MQ=255) aaccgcaggttcccctaCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGCAGTGCt > 1:809986‑M2/18‑63 (MQ=255) aaccgcaggttcccctaCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAg < 1:2463932‑M2/42‑1 (MQ=255) aaccgcaggttcccctaCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAg < 1:3462445‑M2/42‑1 (MQ=255) aaccgcaggttcccctaCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTcaca > 1:1891736‑M2/18‑67 (MQ=255) aaccgcaggttcccctaCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTcaca > 1:3355982‑M2/18‑67 (MQ=255) aaccgcaggttcccctaCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTcaca > 1:611668‑M2/18‑67 (MQ=255) aaccgcaggttcccctaCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGAGTTCTTTGCAGTGCt > 1:548888‑M2/18‑63 (MQ=255) ccgcaggttcccctaCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAaagaag > 1:2362934‑M2/16‑45 (MQ=255) ccgcaggttcccctaCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAaagaag > 1:2266022‑M2/16‑45 (MQ=255) ccgcaggttcccctaCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAaagaag > 1:1938548‑M2/16‑45 (MQ=255) ccgcaggttcccctaCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAaagaag > 1:423493‑M2/16‑45 (MQ=255) ccgcaggttcccctaCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTca > 1:761257‑M2/16‑63 (MQ=255) ccgcaggttcccctaCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGTAGTGCTCACACAGAtt < 1:1588809‑M2/56‑1 (MQ=255) ccgcaggttcccctaCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTg > 1:2235415‑M2/16‑59 (MQ=255) ccgcaggttcccctaCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTg > 1:1805792‑M2/16‑59 (MQ=255) tcccctaCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACt > 1:1008601‑M2/8‑43 (MQ=255) tcccctaCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACt > 1:1340745‑M2/8‑43 (MQ=255) tcccctaCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACt > 1:3317970‑M2/8‑43 (MQ=255) tcccctaCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACt > 1:2812047‑M2/8‑43 (MQ=255) tcccctaCGGTTGGATCAACTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACt > 1:2970760‑M2/8‑43 (MQ=255) CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACAGAGATTGTCTGATGAAAAt < 1:2056622‑M2/69‑1 (MQ=255) CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAAt < 1:3617426‑M2/69‑1 (MQ=255) CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAAt < 1:3206472‑M2/69‑1 (MQ=255) CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATg < 1:68562‑M2/70‑1 (MQ=255) CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGa < 1:2521168‑M2/71‑1 (MQ=255) CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGa < 1:1782753‑M2/71‑1 (MQ=255) | AGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGA > minE/204051‑204189 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |