| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 1352904 = | 103 (1.750) | 10 (0.190) | 3/92 | NT | 9.3% | coding (609/789 nt) | thiM | hydoxyethylthiazole kinase |
| ? | minE | 1352939 = | 102 (1.920) | coding (574/789 nt) | thiM | hydoxyethylthiazole kinase | |||||
Only 100 of 162 total aligned reads displayed.
CCTGGTAACGCACAGCAGGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGTAACATAATCCATCTCGCCAGTGACCAC > minE/1352869‑1353008 | cTGGTAACGCACAGCAGGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAAc < 1:3275657/71‑1 (MQ=255) cTGGTAACGCACAGCAGGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAAc < 1:2185433/71‑1 (MQ=255) cTGGTAACGCACAGCAGGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAAc < 1:1239212/71‑1 (MQ=255) tGGTAACGCACAGCAGGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACg > 1:214325/1‑71 (MQ=255) gTAACGCACAGCAGGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCCGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACg < 1:3291608/69‑1 (MQ=255) gTAACGCACAGCAGGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACg < 1:774791/69‑1 (MQ=255) tAACGCACAGCAGGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACg < 1:880155/68‑1 (MQ=255) tAACGCACAGCAGGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGAt < 1:1338717/71‑1 (MQ=255) cGCACAGCAGGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATcac > 1:1221277/1‑71 (MQ=255) gCACAGCAGGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTATCGGATcac > 1:2069442/1‑70 (MQ=255) acaGCAGGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATcacca < 1:67365/70‑1 (MQ=255) cagcagGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGAt > 1:441303/1‑64 (MQ=255) cagcagGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGAt > 1:2714794/1‑64 (MQ=255) agcagGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCg < 1:3353530/71‑1 (MQ=255) caggcagCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATca > 1:1452636/1‑63 (MQ=255) caggcagCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGt > 1:158712/1‑70 (MQ=255) agCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATAc > 1:2448582/1‑71 (MQ=255) gACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCaa > 1:3016959/1‑71 (MQ=255) gACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCaa > 1:2015242/1‑71 (MQ=255) gACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCaa > 1:2438338/1‑71 (MQ=255) gACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCaa > 1:1343903/1‑71 (MQ=255) gACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCaa > 1:3605980/1‑71 (MQ=255) gACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGAT‑ACCACCGTGAATACCAAt > 1:1528168/1‑71 (MQ=255) aCAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGAt > 1:1806363/1‑52 (MQ=255) aCAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCg > 1:1817836/1‑60 (MQ=255) aCAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCg > 1:1532238/1‑60 (MQ=255) aCAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGaa > 1:270239/1‑64 (MQ=255) aCAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAAt > 1:3402891/1‑71 (MQ=255) aCAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAAt > 1:3448106/1‑71 (MQ=255) cAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAAt > 1:3661552/1‑70 (MQ=255) cAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATg < 1:1150037/71‑1 (MQ=255) ccgccgATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGt > 1:3270692/1‑57 (MQ=255) cgccgATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATAc < 1:2938096/71‑1 (MQ=255) cgccgATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATAc < 1:54056/71‑1 (MQ=255) ccgATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGa < 1:2819095/71‑1 (MQ=255) ccgATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGa < 1:285537/71‑1 (MQ=255) cgATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGAt < 1:3373783/71‑1 (MQ=255) cgATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGAt > 1:2765063/1‑71 (MQ=255) aTAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGt < 1:405678/71‑1 (MQ=255) aTAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGt < 1:90051/71‑1 (MQ=255) TAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTc < 1:110118‑M1/71‑1 (MQ=255) TAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTc < 1:1919137‑M1/71‑1 (MQ=255) aatgaccaaagtggtaggaactggctgtgcattaACGGATCACCACCGTGAATACCAATGa < 1:2196113‑M2/27‑1 (MQ=255) aatgaccaaagtggtaggaactggctgtgcattaACGGATCACCACCGTGAATACCAATGa < 1:2555288‑M2/27‑1 (MQ=255) aatgaccaaagtggtaggaactggctgtgcattaACGGATCACCACCGTGAATACCAATGa < 1:1298596‑M2/27‑1 (MQ=255) AATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATcaccac < 1:1712323‑M1/46‑1 (MQ=255) AATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTc < 1:2618404‑M1/70‑1 (MQ=255) AATGCACAGACAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTc < 1:552224‑M1/70‑1 (MQ=255) ATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCa > 1:422617‑M1/1‑56 (MQ=255) ATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCa > 1:1000234‑M1/1‑71 (MQ=255) TGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCAGTAACgg > 1:488‑M1/1‑36 (MQ=255) accaaagtggtaggaactggctgtgcattaACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCg < 1:1629688‑M2/41‑1 (MQ=255) accaaagtggtaggaactggctgtgcattaACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCg < 1:584669‑M2/41‑1 (MQ=255) acaGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATAcc < 1:824312/51‑1 (MQ=255) acaGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCgg < 1:420919/71‑1 (MQ=255) acaGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCgg < 1:3728433/71‑1 (MQ=255) acaGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCg < 1:2381512/70‑1 (MQ=255) caGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCgg > 1:294129/1‑70 (MQ=255) caGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGt < 1:2957835/71‑1 (MQ=255) caGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGt < 1:1112152/71‑1 (MQ=255) caGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGt < 1:3189892/71‑1 (MQ=255) gCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCa < 1:1779818/49‑1 (MQ=255) aGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATTATACGATGTCCATCGGTAACAt < 1:172613/71‑1 (MQ=255) aGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCTTCGGTa < 1:1738/67‑1 (MQ=255) aGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGTa < 1:2328728/67‑1 (MQ=255) aGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGTAACa > 1:2825197/1‑70 (MQ=255) aGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGTAACa > 1:3603142/1‑70 (MQ=255) gTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGTAACATa < 1:1402488/71‑1 (MQ=255) ttCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGTAAc > 1:532146/1‑67 (MQ=255) ttCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGTAAc > 1:2178971/1‑67 (MQ=255) ttCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGTAAc > 1:1940084/1‑67 (MQ=255) ccTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGTAACATAATc > 1:3701889/1‑71 (MQ=255) ccTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGTAACATAATc > 1:801274/1‑71 (MQ=255) cTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGTAACATa < 1:321024/67‑1 (MQ=255) cTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGTAACATa < 1:2227142/67‑1 (MQ=255) tACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGt < 1:3166103/60‑1 (MQ=255) tACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGt < 1:1197165/60‑1 (MQ=255) tACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGTa > 1:3510699/1‑61 (MQ=255) ccACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGTAACATAATCCAtc > 1:1039636/1‑71 (MQ=255) ccACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGTAACATAATCCAtc > 1:1473794/1‑71 (MQ=255) ccACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGTAACATAATCCAtc > 1:3079125/1‑71 (MQ=255) ccACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGTAACATAATCCAtc < 1:2905348/71‑1 (MQ=255) ccACTTTGGTCATTAACAGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGTAACATAATCCAtc > 1:2071619/1‑71 (MQ=255) tttGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGTAACATaa < 1:285762/61‑1 (MQ=255) ttGGTCATTAACGGATCACCACCATGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGTAACATAATCCATCTCGc > 1:3136147/1‑70 (MQ=255) gTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGTAACATAATCCATCTCGCCAGt > 1:3526365/1‑71 (MQ=255) tCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGTAACATAATCCAtc < 1:700254/62‑1 (MQ=255) cattaACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGTAACATAATCCAtc < 1:936749‑M2/56‑1 (MQ=255) cattaACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGTAACATAATCCAtc < 1:321407‑M2/56‑1 (MQ=255) cattaACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGTAACATAATCCAtc < 1:1572708‑M2/56‑1 (MQ=255) cattaACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGTAACATAATCCAtc < 1:1891075‑M2/56‑1 (MQ=255) cattaACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGTAACATAATCCAtc < 1:2286358‑M2/56‑1 (MQ=255) cattaACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGTAACATAATCCATCTCGCCAGTGa > 1:2403667‑M2/6‑71 (MQ=255) cattaACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGTAACATAACCCAtc < 1:2667943‑M2/56‑1 (MQ=255) attaACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATc > 1:3229219‑M2/5‑44 (MQ=255) attaACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATc > 1:1175134‑M2/5‑44 (MQ=255) attaACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGTAACATAATCCATCTCGCCAGTGAc > 1:1770151‑M2/5‑71 (MQ=255) attaACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGTAACATAATCCATCTCGCCAGTGAc > 1:3392552‑M2/5‑71 (MQ=255) aCGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGTAACATAATCCATCTCGCCAGTg < 1:3192826/65‑1 (MQ=255) aCGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGTAACATAATCCATCTCGCCAGTGACCac > 1:2957616/1‑70 (MQ=255) | CCTGGTAACGCACAGCAGGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACGGATCACCACCGTGAATACCAATGATACGATGTCCATCGGTAACATAATCCATCTCGCCAGTGACCAC > minE/1352869‑1353008 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |