| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 1939651 = | 73 (1.240) | 5 (0.100) | 3/88 | NT | 7.5% | intergenic (+7/+33) | fldB/ygfX | flavodoxin 2/hypothetical protein |
| ? | minE | 1939681 = | 60 (1.180) | intergenic (+37/+3) | fldB/ygfX | flavodoxin 2/hypothetical protein | |||||
AATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATCCCGCCATTCAGCTTCGTCCATGCTGT > minE/1939611‑1939751 | aaTCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCat < 1:1840818/71‑1 (MQ=255) cggcggattttgttgcaacaagagacgcaaagataaagaTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCat > 1:433058‑M1/40‑70 (MQ=255) aTCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCatc > 1:505108/1‑71 (MQ=255) tCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCatct > 1:2944728/1‑71 (MQ=255) ccTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCatctt > 1:3642528/1‑71 (MQ=255) ccTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCatctt > 1:1493413/1‑71 (MQ=255) cAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCatcttta > 1:2558024/1‑70 (MQ=255) aaCGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCatctttatc > 1:3200987/1‑71 (MQ=255) aCGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCatctttatct < 1:3540128/71‑1 (MQ=255) aCGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCatctttatct < 1:863236/71‑1 (MQ=255) cGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCatctttatctt > 1:1152030/1‑71 (MQ=255) cGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCatctttatctt > 1:1522962/1‑71 (MQ=255) gAAATGGCAGAGCATTACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCatctttatcttt < 1:1245106/71‑1 (MQ=255) aTGGCAGAGCATTACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCatctttatcttt > 1:867789/1‑68 (MQ=255) gagCATTACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCtt > 1:1571358/1‑71 (MQ=255) agCATTACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCttg < 1:3338181/71‑1 (MQ=255) agCATTACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCttg < 1:2263532/71‑1 (MQ=255) agCATTACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCttg > 1:1813363/1‑71 (MQ=255) agCATTACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCttg < 1:1119301/71‑1 (MQ=255) agCATTACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCttg < 1:2634665/71‑1 (MQ=255) gCATTACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCttgt < 1:18587/71‑1 (MQ=255) gCATTACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCttgt < 1:204565/71‑1 (MQ=255) gCATTACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCttg < 1:493837/70‑1 (MQ=255) cATTACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCttgtt < 1:2630245/71‑1 (MQ=255) ttACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCttg < 1:3139870/67‑1 (MQ=255) ttACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGc < 1:3390896/71‑1 (MQ=255) ttACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGc < 1:3152900/71‑1 (MQ=255) ttACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGc < 1:1566091/71‑1 (MQ=255) ttACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGc < 1:1584363/71‑1 (MQ=255) aCGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCat > 1:2519637/1‑45 (MQ=255) aCGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGcaa > 1:3420912/1‑71 (MQ=255) cGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCttgttg < 1:212583/67‑1 (MQ=255) cGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCttgttg < 1:1088852/67‑1 (MQ=255) gCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGcaaca < 1:1921291/71‑1 (MQ=255) ccTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGcaacaa < 1:312527/71‑1 (MQ=255) cTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGcaacaa > 1:2645975/1‑70 (MQ=255) cTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGcaacaa > 1:3529553/1‑70 (MQ=255) cTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGcaacaa > 1:1061324/1‑70 (MQ=255) tGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACaaaa > 1:977283/1‑71 (MQ=255) tGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACaaaa > 1:1410420/1‑71 (MQ=255) ctcACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGtctc > 1:3316467/1‑53 (MQ=255) ctcACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGtctc > 1:658997/1‑53 (MQ=255) tcACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGcaac < 1:2364207/62‑1 (MQ=255) tcACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGcaac < 1:1516519/62‑1 (MQ=255) tcACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAAt < 1:1869276/67‑1 (MQ=255) aCTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATccgcc < 1:2591870/70‑1 (MQ=255) cTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGt < 1:1983597/71‑1 (MQ=255) atgacggcaaagcatatgcgctaagccgtcaTCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATccgccg > 1:433058‑M2/32‑70 (MQ=255) TGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGt < 1:1533183‑M1/70‑1 (MQ=255) TGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGt < 1:244165‑M1/70‑1 (MQ=255) TGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGt < 1:1179402‑M1/70‑1 (MQ=255) ggcaaagcatatgcgctaagccgtcaTCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGca < 1:1384167‑M2/26‑1 (MQ=255) ggcaaagcatatgcgctaagccgtcaTCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGca < 1:3689708‑M2/26‑1 (MQ=255) ggcaaagcatatgcgctaagccgtcaTCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGca < 1:1057749‑M2/26‑1 (MQ=255) caaagcatatgcgctaagccgtcaTCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGcaac > 1:3098971‑M2/25‑52 (MQ=255) gcgcATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATCCCGcc < 1:2416266/70‑1 (MQ=255) gcATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATCCCGCCAtt > 1:2430131/1‑71 (MQ=255) atatGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACaaaa < 1:1901975/48‑1 (MQ=255) atatGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATCCCGCCAtt > 1:197840/1‑69 (MQ=255) atatGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATCCCGCCATTCa < 1:289269/71‑1 (MQ=255) atatGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATCCCGCCATTCa < 1:3484014/71‑1 (MQ=255) tatGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCttg < 1:1365741/36‑1 (MQ=255) tatGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCttg < 1:1283353/36‑1 (MQ=255) tatGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCttg < 1:1640222/36‑1 (MQ=255) tatGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCttg < 1:934529/36‑1 (MQ=255) tatGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGcaacaa < 1:844749/45‑1 (MQ=255) tatGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATCCCGCCAt < 1:1888833/67‑1 (MQ=255) tatGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATCCCGCCATTCAg > 1:1164451/1‑71 (MQ=255) tGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTTCGTCTCTTGTTGCAACaaaa > 1:33395/1‑45 (MQ=255) tGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACaaaa > 1:1615539/1‑45 (MQ=255) tGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATCCCGCCATTCAGCt < 1:1825484/71‑1 (MQ=255) tGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATCCCGCCATTCAGCt < 1:1656890/71‑1 (MQ=255) tGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATCCCGCCATTCAGCt < 1:3393223/71‑1 (MQ=255) tGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATCCCGCCATTCAGCt < 1:2611338/71‑1 (MQ=255) tGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATCCCGCCATTCAGCt < 1:2642365/71‑1 (MQ=255) cTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATCCCGCCATTCAGCTTc < 1:1168432/71‑1 (MQ=255) tGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATccc < 1:1267801/55‑1 (MQ=255) tGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATCCCGCCATTCAGCTTCg < 1:228775/69‑1 (MQ=255) gccgtcaTCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATCCCg > 1:1026282‑M2/8‑55 (MQ=255) ccgtcaTCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATCCCGCCATTCAGCTTCGTCCa < 1:1840102‑M2/65‑1 (MQ=255) cgtcaTCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATccg < 1:1031911‑M2/36‑1 (MQ=255) cgtcaTCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATccc > 1:3636285‑M2/6‑52 (MQ=255) cgtcaTCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATCCCGCCATTCAg < 1:651573‑M2/56‑1 (MQ=255) cgtcaTCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATCCCGCCATTCAg < 1:838473‑M2/56‑1 (MQ=255) gtcaTCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATccg < 1:1617986‑M2/36‑1 (MQ=255) gtcaTCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAAt > 1:3585440‑M2/5‑48 (MQ=255) gtcaTCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAAt > 1:350978‑M2/5‑48 (MQ=255) gtcaTCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAAt > 1:2167290‑M2/5‑48 (MQ=255) gtcaTCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAAt > 1:2696761‑M2/5‑48 (MQ=255) tcaTCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATCCCGCCa < 1:342027‑M2/51‑1 (MQ=255) tcaTCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATCCCGCCATTCAGCt > 1:450101‑M2/4‑61 (MQ=255) tcaTCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATCCCGCCATTCAGCt > 1:715865‑M2/4‑61 (MQ=255) caTCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTa > 1:1408290‑M2/3‑43 (MQ=255) aTCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATCCCGCCATTCAGCTTCGTCCATGCTg < 1:123389‑M2/70‑1 (MQ=255) tctttatctttGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATCCCGCCATTCAGCTTCGTCCATGCt > 1:555904/1‑69 (MQ=255) tctttatctttGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATCCCGCCATTCAGCTTCGTCCATGCTGt > 1:1642919/1‑71 (MQ=255) | AATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGTCATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATCCCGCCATTCAGCTTCGTCCATGCTGT > minE/1939611‑1939751 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |