| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 2478469 = | 63 (1.070) | 3 (0.060) | 3/86 | NT | 6.1% | coding (442/774 nt) | pstB | phosphate transporter subunit |
| ? | minE | 2478497 = | 40 (0.800) | coding (470/774 nt) | pstB | phosphate transporter subunit | |||||
TTGACCAAAGCCGCATTGTGGAACGAAACCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTGGTATCGCCATTCGCCCGGAAGTGCTGCTGCTCGACGAACCG > minE/2478427‑2478567 | ttGACCAAAGCCGCATTGTGGAGCGAAACCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCtggtgg > 1:1743989/1‑71 (MQ=255)ttGACCAAAGCCGCATTGTGGAACGAAACCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCtggtgg > 1:1066092/1‑71 (MQ=255)ttGACCAAAGCCGCATTGTGGAACGAAACCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCtggtgg < 1:2074354/71‑1 (MQ=255) tGACCAAAGCCGCATTGTGGAACGAAACCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCtggtgg > 1:1928767/1‑70 (MQ=255) gACCAAAGCCGCATTGTTGAACGAAACCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTggtggt > 1:3521126/1‑70 (MQ=255) ccAAAGCCGCATTGTGGAACGAAACCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAg > 1:89919/1‑71 (MQ=255) ccAAAGCCGCATTGTGGAACGAAACCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAg > 1:2801410/1‑71 (MQ=255) cAAAGCCGCATTGTGGAACGAAACCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAg > 1:2831310/1‑70 (MQ=255) cAAAGCCGCATTGTGGAACGAAACCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGc < 1:507782/71‑1 (MQ=255) cAAAGCCGCATTGTGGAACGAAACCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGc < 1:1410378/71‑1 (MQ=255) cAAAGCCGCATTGTGGAACGAAACCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGc < 1:750266/71‑1 (MQ=255) aaGCCGCATTGTGGAACGAAACCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCaa > 1:1084342/1‑71 (MQ=255) aaGCCGCATTGTGGAACGAAACCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCaa > 1:2695463/1‑71 (MQ=255) cGCATTGTGGAACGAAACCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGTAACAGc < 1:478911/71‑1 (MQ=255) cGCATTGTGGAACGAAACCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGc < 1:2974321/71‑1 (MQ=255) gCATTGTGGAACGAAACCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCg < 1:1629781/71‑1 (MQ=255) cATTGTGGAACGAAACCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCa > 1:3109270/1‑61 (MQ=255) cATTGTGGAACGAAACCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCa > 1:2661539/1‑61 (MQ=255) ttGTGGAACGAAACCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCt < 1:369709/71‑1 (MQ=255) ttGTGGAACGAAACCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCt < 1:888326/71‑1 (MQ=255) tgtgGAACGAAACCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCt < 1:994661/70‑1 (MQ=255) tgGAACGAAACCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCtgtg < 1:2915514/71‑1 (MQ=255) aCGAAACCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTAt > 1:3050752/1‑70 (MQ=255) aaaCCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTa > 1:1004084/1‑66 (MQ=255) aaCCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCtgtg > 1:1540633/1‑63 (MQ=255) aaCCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTgcgc > 1:869330/1‑71 (MQ=255) aaCCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTgcgc < 1:3409534/71‑1 (MQ=255) aCCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTgcgc > 1:1228783/1‑70 (MQ=255) aCCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGcgcg > 1:2392238/1‑71 (MQ=255) ccAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTggtggt < 1:3353824/44‑1 (MQ=255) cAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTg > 1:345784/1‑71 (MQ=255) cAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTg > 1:3042720/1‑71 (MQ=255) aaaGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAg > 1:3117982/1‑45 (MQ=255) aaaGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAg > 1:1477198/1‑45 (MQ=255) aaaGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTgg > 1:378001/1‑71 (MQ=255) aaaGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTgg > 1:2137673/1‑71 (MQ=255) aaaGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTgg > 1:2613429/1‑71 (MQ=255) aaGATAAATTGCACCAGATCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTGGt < 1:3181863/71‑1 (MQ=255) aaGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTGGt < 1:1677868/71‑1 (MQ=255) aGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCa > 1:1094240/1‑42 (MQ=255) aGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTgcgc < 1:152704/65‑1 (MQ=255) aTAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTGGTATc < 1:3635550/71‑1 (MQ=255) tAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTGGTATCg < 1:3533766/71‑1 (MQ=255) tAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTGGTATCg < 1:466206/71‑1 (MQ=255) ttGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCtgtg < 1:1473279/50‑1 (MQ=255) ccagagagagagtaaccgctctggtgGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTGGTATCGCCATTCGcc > 1:3666610‑M2/27‑71 (MQ=255) CAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTGGTAt > 1:170915‑M1/1‑59 (MQ=255) CAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTGGTAt > 1:2319802‑M1/1‑59 (MQ=255) CAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTGGTATCGCCATTCGccc < 1:3409009‑M1/71‑1 (MQ=255) agagagagagtaaccgctctggtgGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTGGTATCGCCATTCGCCCg > 1:1472066‑M2/25‑71 (MQ=255) AGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTGGTATCGCCATTCGCCCg < 1:2207363‑M1/71‑1 (MQ=255) gagagagagtaaccgctctggtgGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTGGTATCGCCATTCGCCCgg < 1:1076686‑M2/48‑1 (MQ=255) GCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTGGTATCGCCATTCGCCCgg < 1:3463230‑M1/69‑1 (MQ=255) gTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGcgcg < 1:3358794/46‑1 (MQ=255) gTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGcgcg < 1:1059043/46‑1 (MQ=255) gTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTGGTATCGCCATTCGCCCGGAAGtg < 1:1440769/71‑1 (MQ=255) gTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTGGTATCGCCATTCGCCCGGAAGtg < 1:3378411/71‑1 (MQ=255) ttACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTGGTATCGCCATTCGccc < 1:3516635/63‑1 (MQ=255) ttACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTGGTATCGCCATTCGccc < 1:547488/63‑1 (MQ=255) aCTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTgcgc < 1:2515521/42‑1 (MQ=255) aCTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTGGTATCGCCATTCGCCCgg > 1:1004447/1‑63 (MQ=255) ctctctctctGGTGGTCAGCAACACCGTCTGTGTATTGCGCGTGGTATCGCCATTCGCCCGGAAGtgctgc > 1:3366961/1‑71 (MQ=255) tctctctTGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTGGTATCGCCATTCGCCCGGAAGtgctgctgc > 1:3586153/1‑71 (MQ=255) tctctctGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTg > 1:1101361/1‑41 (MQ=255) tctctctGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTGGTATCGCCATTCGCCCGGAAGtgctgctgc > 1:3428976/1‑71 (MQ=255) tctctctGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTGGTATCGCCATTCGCCCGGAAGtgctgctgc > 1:1369323/1‑71 (MQ=255) tctctctGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTGGTATCGCCATTCGCCCGGAAGtgctgctgc > 1:3238124/1‑71 (MQ=255) tctctctGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTGGTATCGCCATTCGCCCGGAAGtgctgctgc > 1:1509124/1‑71 (MQ=255) ctctctGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTGGTATCGCCATTCGCCCGGAAGTgctgctgct > 1:2029408/1‑71 (MQ=255) tctctGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTGGTATCGCCAtt > 1:2779609/1‑50 (MQ=255) tctctGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTGGTATCGCCATTCGCCCGGAAGtgctgctgc < 1:1265974/69‑1 (MQ=255) tctctGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTGGTATCGCCATTCGCCCGGAAGtgctgctg < 1:2556875/68‑1 (MQ=255) tctctGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTGGTATCGCCATTCGCCCGGAAGtgctgctg < 1:3732926/68‑1 (MQ=255) tggtgGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTGGTATCGCCATTCGCCCGGAAGTGCTGCTGCTcgac > 1:2131037‑M2/6‑70 (MQ=255) gtCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTGGTATCGCCATTCGCCCTGAAGTGCTGCTGCTCGACGAACCg < 1:857422/71‑1 (MQ=255) | TTGACCAAAGCCGCATTGTGGAACGAAACCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTGGTATCGCCATTCGCCCGGAAGTGCTGCTGCTCGACGAACCG > minE/2478427‑2478567 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |