| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | = 2659436 | 63 (1.070) | 6 (0.120) | 3/84 | NT | 9.8% | coding (165/327 nt) | glpE | thiosulfate:cyanide sulfurtransferase |
| ? | minE | = 2659464 | 59 (1.210) | coding (193/327 nt) | glpE | thiosulfate:cyanide sulfurtransferase | |||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
CCATTTAACCAACGACACGCTGGGCGCTTTTATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCAGTATCTGCTGCAACAGGGCTACGATGTGGTCTAT > minE/2659394‑2659532 | ccATTTAACCAACGACACGCTGGGCGCTTTTATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGAtgt > 1:428565/1‑71 (MQ=255)ccATTTAACCAACGACACGCTGGGCGCTTTTATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGAtgt > 1:3656460/1‑71 (MQ=255) cATTTAACCAACGACACGCTGGGCGCTTTTATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGAtgt < 1:3390962/70‑1 (MQ=255) cATTTAACCAACGACACGCTGGGCGCTTTTATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTg < 1:750844‑M2/71‑2 (MQ=255) ttAACCAACGACACGCTGGGCGCTTTTATTCGTGATAACGACTTTGAAACTAAGGTGATGGTGATGTgtt < 1:2840684‑M2/70‑4 (MQ=255) tAACCAACGACACGCTGGGCGCTTTTATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTgttat < 1:2232827‑M2/71‑6 (MQ=255) tAACCAACGACACGCTGGGCGCTTTTATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTgttat < 1:3700336‑M2/71‑6 (MQ=255) aCCAACGACACGCTGGGCGCTTTTATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTgttatca > 1:1427623‑M2/1‑64 (MQ=255) aCCAACGACACGCTGGGCGCTTTTATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTgttatc > 1:5204‑M2/1‑64 (MQ=255) ccAACGACACGCTGGGCGCTTTTATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTgttatcac < 1:1178516‑M2/71‑9 (MQ=255) ccAACGACACGCTGGGCGCTTTTATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTgttatcac < 1:1895254‑M2/71‑9 (MQ=255) ccAACGACACGCTGGGCGCTTTTATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTgttatcac < 1:3160704‑M2/71‑9 (MQ=255) ccAACGACACGCTGGGCGCTTTTATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTgttatcac > 1:3181002‑M2/1‑63 (MQ=255) ccAACGACACGCTGGGCGCTTTTATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTgttatcac < 1:1844244‑M2/71‑9 (MQ=255) ccAACGACACGCTGGGCGCTTTTATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTgttatcac < 1:3707805‑M2/71‑9 (MQ=255) ccAACGACACGCTGGGCGCTTTTATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTgttatcac > 1:1005713‑M2/1‑63 (MQ=255) cAACGACACGCTGGGCGCTTTTATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTgttat < 1:3231785‑M2/67‑6 (MQ=255) cAACGACACGCTGGGCGCTTTTATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTgttat < 1:429650‑M2/67‑6 (MQ=255) aCGACACGCTGGGCGCTTTTATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACgg > 1:3632941/1‑70 (MQ=255) gACACGCTGGGCGCTTTTATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCa < 1:3160409/70‑1 (MQ=255) cacGCTGGGCGCTTTTATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAAt < 1:40171/70‑1 (MQ=255) acGCTGGGCGCTTTTATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATag > 1:3557159/1‑71 (MQ=255) gCTGGGCGCTTTTATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATag > 1:1810274/1‑69 (MQ=255) gCTGGGCGCTTTTATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATag > 1:2284559/1‑69 (MQ=255) gggCGCTTTTATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTgttatca < 1:1734169‑M2/57‑8 (MQ=255) gggCGCTTTTATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTgttatca < 1:687117‑M2/57‑8 (MQ=255) gcgcTTTTATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATag < 1:120893/64‑1 (MQ=255) gcTTTTATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTgtt > 1:3730074‑M2/1‑46 (MQ=255) gcTTTTATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAgg > 1:6073/1‑71 (MQ=255) gcTTTTATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAgg < 1:1339913/71‑1 (MQ=255) cTTTTATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATagcagc < 1:1023688/65‑1 (MQ=255) ttttATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTgttat > 1:1489815‑M2/1‑44 (MQ=255) ttttATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTgttat > 1:682661‑M2/1‑44 (MQ=255) ttttATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTgttat > 1:2837496‑M2/1‑44 (MQ=255) ttttATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAgg < 1:182587/69‑1 (MQ=255) tttATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTgt > 1:1641073‑M2/1‑43 (MQ=255) ttATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAggcgcg > 1:2038447/1‑71 (MQ=255) ttATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAggcgcg > 1:823625/1‑71 (MQ=255) ttATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAggcgcg > 1:837910/1‑71 (MQ=255) ttATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAggcg < 1:3200460/69‑1 (MQ=255) tATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAggcgcg < 1:89679/70‑1 (MQ=255) gCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTgtt > 1:2134091‑M2/1‑38 (MQ=255) gCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTgtt > 1:228534‑M2/1‑38 (MQ=255) gCGTGATAACGACTTTGACACACCGGTGATGGTGATGTgtt > 1:3185258‑M2/1‑38 (MQ=255) cGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTgttatca < 1:1586256‑M2/44‑8 (MQ=255) cGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTgttatca < 1:3595468‑M2/44‑8 (MQ=255) cGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTgttatca < 1:2583667‑M2/44‑8 (MQ=255) cGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTgttatca < 1:3476246‑M2/44‑8 (MQ=255) gTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTgttatcacgcataaaagcgcccagcgtgtcgttgg < 1:3486195‑M2/71‑36 (MQ=255) gTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTgttatcacgcataaaag < 1:2214010‑M2/53‑18 (MQ=255) gTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATAgcagca < 1:2877923/57‑1 (MQ=255) gTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATAgcagca < 1:1260665/57‑1 (MQ=255) gATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTgttatcacgcataaaagcgcccagcgtgtcgttggt < 1:653152‑M2/70‑37 (MQ=255) gATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCAGTa > 1:1645383/1‑71 (MQ=255) gATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCAGTa > 1:877009/1‑71 (MQ=255) cGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACgg > 1:631353/1‑39 (MQ=255) cGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACgg > 1:2711473/1‑39 (MQ=255) cGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATAGCAGCaaa > 1:569298/1‑52 (MQ=255) cGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCAGTATctgc < 1:1559105/71‑1 (MQ=255) aCTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCAGTATctgct > 1:2846484/1‑70 (MQ=255) tGACACTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATagcag > 1:2739164/1‑42 (MQ=255) tGACACTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCa > 1:505176/1‑57 (MQ=255) tGACACTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCa > 1:2636629/1‑57 (MQ=255) tGACACTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCAGTATCTGCTGCaa > 1:1100410/1‑70 (MQ=255) tGACACTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCAGTATCTGCTGCaa > 1:890801/1‑70 (MQ=255) tGACACTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCAGTATCTGCTGCaa < 1:2165876/70‑1 (MQ=255) tGACACTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCAGTATCTGCTGCaa > 1:2449971/1‑70 (MQ=255) tGACACTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCAGTATCTGCTGCaa > 1:1095913/1‑70 (MQ=255) gACACTCCGGTGATGGTGATGTgttatcacgcataaaagcgcccagcgtgtcgttggttaaatggaaagc > 1:1518945‑M2/1‑22 (MQ=255) gACACTCCGGTGATGGTGATGTgttatcacgcataaaagcgcccagcgtgtcgttggttaaatggaaagc > 1:2673149‑M2/1‑22 (MQ=255) gACACTCCGGTGATGGTGATGTgttatcacgcataaaagcgcccagcgtgtcgttggttaaatggaaagc > 1:285061‑M2/1‑22 (MQ=255) gACACTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAggc < 1:1947938/48‑1 (MQ=255) acacTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCAGTAt < 1:3260307/59‑1 (MQ=255) cTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATAGCAGCaa < 1:572730/40‑1 (MQ=255) cTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCAGTATCTGCTGCAACAGGGc > 1:844748/1‑71 (MQ=255) tCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCAGTATCTGCTGCAACAGGGc > 1:678893/1‑70 (MQ=255) ccGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCAGTATctg > 1:1456151/1‑57 (MQ=255) cGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCAGTATctg > 1:2828910/1‑56 (MQ=255) cGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCAGTATCTGCTGCAACAGGGCTAc > 1:3670078/1‑71 (MQ=255) cGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCAGTATCTGCTGCAACAGGGCTAc > 1:1147318/1‑71 (MQ=255) ggtgatggtgatGTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCAGTATCTGCTGCAACAGGGCTAc > 1:665543/1‑70 (MQ=255) gatggtgatgTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCAGTATctgc > 1:2290034/1‑53 (MQ=255) gatggtgatgTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCAGTATctg > 1:1920321/1‑52 (MQ=255) gatggtgatgTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCAGTATctg > 1:701704/1‑52 (MQ=255) gatggtgatgTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCAGTATCTGCTGCAACa > 1:3421772/1‑60 (MQ=255) atggtgatgTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCAGTATCTGCTGCAACAGGGCTACGAtg < 1:150886/70‑1 (MQ=255) atggtgatgTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCAGTATCTGCTGCAACAGGGCTACGAtg < 1:736466/70‑1 (MQ=255) tggtgatgTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAggcgcg < 1:2445263/38‑1 (MQ=255) tggtgatgTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAggcgcg < 1:1729585/38‑1 (MQ=255) gtgatgTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCAGTATCTGCTGCAACAGGGCTACGATGTgg < 1:3208402/70‑1 (MQ=255) gtgatgTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCAGTATCTGCTGCAACAGGGCTACGATGTgg < 1:1348993/70‑1 (MQ=255) tgatgTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCAGTATCTGCTGCAACAGGGCTACGATGTgg < 1:324581/69‑1 (MQ=255) tgatgTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCAGTATCTGCTGCAACAGGGCTACGATGTGGTc < 1:2902549/71‑1 (MQ=255) tgatgTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCAGTATCTGCTGCAACAGGGCTACGATGTGGTc > 1:449166/1‑71 (MQ=255) tgatgTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCAGTATCTGCTGCAACAGGGCTACGATGTGGTc > 1:1882024/1‑71 (MQ=255) gatgTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCAGTATCTGCTGCAACAGGGCTACGATGTGGTc > 1:692546/1‑70 (MQ=255) gatgTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCAGTATCTGCTGCAACAGGGCTACGATGTGGTc > 1:2134286/1‑70 (MQ=255) tgtgTTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCAGTATCTGCTGCAACAGGGCTACGATGTGGTCtat < 1:3679780/71‑1 (MQ=255) tgtTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCAGTATCTGCTGCAACAGGGc < 1:1369305/54‑1 (MQ=255) tgtTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCAGTATCTGCTGCAACAGGGc < 1:599172/54‑1 (MQ=255) | CCATTTAACCAACGACACGCTGGGCGCTTTTATGCGTGATAACGACTTTGACACTCCGGTGATGGTGATGTGTTATCACGGCAATAGCAGCAAAGGCGCGGCGCAGTATCTGCTGCAACAGGGCTACGATGTGGTCTAT > minE/2659394‑2659532 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |