| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | = 2782586 | 55 (0.930) | 6 (0.110) | 3/92 | NT | 9.7% | coding (3561/3684 nt) | metH | homocysteine‑N5‑methyltetrahydrofolate transmethylase, B12‑dependent |
| ? | minE | = 2782595 | 62 (1.170) | coding (3570/3684 nt) | metH | homocysteine‑N5‑methyltetrahydrofolate transmethylase, B12‑dependent | |||||
TCGCCATGTGGCCCGGTGCATCGGTTTCGGGTTGGTACTTCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGATTATGCCCGCCGTAAAGGTATGAGCGTTACCG > minE/2782531‑2782662 | tCGCCATGTGGCCCGGTGCATCGGTTTCGGGTTGGTACTTCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACgctg > 1:2781850‑M2/1‑65 (MQ=255)tCGCCATGTGGCCCGGTGCATCGGTTTCGGGTTGGTACTTCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACgctg > 1:3734225‑M2/1‑65 (MQ=255) gCCCGGTGCATCGGTTTCGGGTTGGTACTTCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAAtt < 1:3120522/70‑1 (MQ=255) gCCCGGTGCATCGGTTTCGGGTTGGTACTTCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAAtt < 1:3398124/70‑1 (MQ=255) gCCCGGTGCATCGGTTTCGGGTTGGTACTTCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAAtt < 1:1502647/70‑1 (MQ=255) gCCCGGTGCATCGGTTTCGGGTTGGTACTTCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTc < 1:2546788/71‑1 (MQ=255) cccGGTGCATCGGTTTCGGGTTGGTACTTCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAAtt > 1:2588080/1‑69 (MQ=255) cccGGTGCATCGGTTTCGGGTTGGTACTTCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAAtt > 1:2095411/1‑69 (MQ=255) cGGTGCATCGGTTTCGGGTTGGTACTTCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAgc > 1:882847/1‑71 (MQ=255) tGCATCGGTTTCGGGTTGGTACTTCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGcgcg < 1:607264/71‑1 (MQ=255) gCATCGGTTTCGGGTTGGTACTTCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGa > 1:2798002/1‑71 (MQ=255) cATCGGTTTCGGGTTTGTACTTCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGa < 1:3179359/70‑1 (MQ=255) cATCGGTTTCGGGTTGGTACTTCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGa < 1:903924/70‑1 (MQ=255) aTCGGTTTCGGGTTGGTACTTCCGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACaa > 1:3634016/1‑58 (MQ=255) tCGGTTTCGGGTTGGTACTTCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCa < 1:3171633/71‑1 (MQ=255) ggTTTCGGGTTGGTACTTCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAgg > 1:822359/1‑71 (MQ=255) ggTTTCGGGTTGGTACTTCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAg < 1:2770049/70‑1 (MQ=255) gTTTCGGGTTGGTACTTCAGCCACCAGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAgc > 1:3648017/1‑61 (MQ=255) ttCGGGTTGGTACTTCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGtt > 1:138130/1‑70 (MQ=255) ggTTGGTACTTCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTg > 1:3319939/1‑67 (MQ=255) gTTGGTACTTCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGa < 1:974022/70‑1 (MQ=255) gTTGGTACTTCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGa < 1:564893/70‑1 (MQ=255) gTTGGTACTTCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGa < 1:3319711/70‑1 (MQ=255) gTTGGTACTTCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGa < 1:560461/70‑1 (MQ=255) ttGGTACTTCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGAtt < 1:2527488/71‑1 (MQ=255) tGGTACTTCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAAt > 1:1934894/1‑47 (MQ=255) tGGTACTTCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGATTa > 1:2963541/1‑71 (MQ=255) tGGTACTTCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGATTa > 1:1417979/1‑71 (MQ=255) tACTTCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGATTATGc < 1:2760892/71‑1 (MQ=255) tACTTCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGATTATGc < 1:2866458/71‑1 (MQ=255) aCTTCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAAtt < 1:1174513/44‑1 (MQ=255) aCTTCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAAtt < 1:187548/44‑1 (MQ=255) aCTTCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAAtt < 1:1738332/44‑1 (MQ=255) aCTTCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAAtt < 1:1621486/44‑1 (MQ=255) aCTTCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGATTATGcc > 1:3127773/1‑71 (MQ=255) cTTCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGATTATGccc < 1:826073/71‑1 (MQ=255) ttCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGATGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGATTATGCccg > 1:833714/1‑71 (MQ=255) tCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGcac < 1:2318504/36‑1 (MQ=255) tCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGcac < 1:3120855/36‑1 (MQ=255) tCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAgc > 1:826352/1‑45 (MQ=255) tCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAgc > 1:3007925/1‑45 (MQ=255) tCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAgc > 1:3433870/1‑45 (MQ=255) tCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGAtt > 1:944522/1‑63 (MQ=255) tCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGATTATGCccgc > 1:774577/1‑71 (MQ=255) tCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGATTATGCccgc > 1:1094746/1‑71 (MQ=255) cAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAAtt < 1:1799513/40‑1 (MQ=255) aGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGATTATGCccgccg < 1:3400545/71‑1 (MQ=255) ccACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAgcgc < 1:1578952/43‑1 (MQ=255) ccACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAgcgc < 1:2750490/43‑1 (MQ=255) cACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGATTATGCCCGCCGTaa < 1:537606/71‑1 (MQ=255) cccGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGATTATGcc < 1:1386061/61‑1 (MQ=255) cccGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGATTATGCCCGCCGTAAAg < 1:2300896/71‑1 (MQ=255) ccGGACAGCAAGTACTACgctgtccgggtggctgaagtaccaacccgaaaccgatgcaccggg > 1:3733821‑M2/1‑18 (MQ=255) ccGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGATTATGCCCGCCGTAAAgg < 1:3682987/71‑1 (MQ=255) cGGACAGCAAGTACTACgctgtccgggtggctgaagtaccaacccga > 1:3167699‑M2/1‑17 (MQ=255) cGGACAGCAAGTACTACgctgtccgggtggctgaagtaccaacccga > 1:2897120‑M2/1‑17 (MQ=255) ggACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGATTATGCCCGCCGTAAAGGTa > 1:2876394/1‑71 (MQ=255) gACAGCAAGTACTACgctgtccgggtggctgaagtaccaacccgaaa < 1:3482547‑M2/47‑33 (MQ=255) gACAGCAAGTACTACgctgtccgggtggctgaagtaccaacccgaaa < 1:2342572‑M2/47‑33 (MQ=255) gACAGCAAGTACTACgctgtccgggtggctgaagtaccaacccgaaa < 1:3274344‑M2/47‑33 (MQ=255) cAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGa < 1:2288253/42‑1 (MQ=255) aaGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGATTATGCCCGCCGTAAAg > 1:1374581/1‑61 (MQ=255) aaGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGATTATGCCCGCCGTAAAGGTATGAGCGt > 1:1215736/1‑71 (MQ=255) aaGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGATTATGCCCGCCGTAAAGGTATGAGCGt > 1:3636268/1‑71 (MQ=255) aGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAg > 1:1969861/1‑35 (MQ=255) aGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGAt > 1:3137969/1‑44 (MQ=255) aGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGATTATGCCCGCCGTAAAGGTATGAGc > 1:36611/1‑68 (MQ=255) aGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGATTATGCCCGCCGTAAAGGTATGAGCGtt < 1:3272094/71‑1 (MQ=255) aGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGATTATGCCCGCCGTAAAGGTATGAGCGt > 1:2719385/1‑70 (MQ=255) gTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGATTATGCCCGCCGTAAAGGTATGAGCGTTa < 1:2559582/71‑1 (MQ=255) gTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGATTATGCCCGCCGTAAAGGTATGAGCGTTa < 1:678319/71‑1 (MQ=255) gTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGATTATGCCCGCCGTAAAGGTATGAGCGTTa < 1:318476/71‑1 (MQ=255) actacGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGATTATGCCCGCCGTAAAg > 1:1345054/1‑57 (MQ=255) ctacGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGATTATGCCCGCCGTAAAGGTATGAGCGTTACCg < 1:1603569/71‑1 (MQ=255) ctacGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGATTATGCCCGCCGTAAAGGTATGAGCGTTACCg < 1:1607826/71‑1 (MQ=255) acGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGAtt < 1:3104828/39‑1 (MQ=255) cGCTGTTGAACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGAt > 1:479134/1‑37 (MQ=37) cGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGAtt > 1:3473878/1‑38 (MQ=255) cGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGAtt > 1:3275679/1‑38 (MQ=255) | TCGCCATGTGGCCCGGTGCATCGGTTTCGGGTTGGTACTTCAGCCACCCGGACAGCAAGTACTACGCTGTAGCACAAATTCAGCGCGATCAGGTTGAAGATTATGCCCGCCGTAAAGGTATGAGCGTTACCG > minE/2782531‑2782662 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |