| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | = 2809357 | 70 (1.190) | 8 (0.150) | 3/90 | NT | 9.9% | coding (246/417 nt) | yjbQ | conserved hypothetical protein |
| ? | minE | = 2809376 | 84 (1.610) | coding (265/417 nt) | yjbQ | conserved hypothetical protein | |||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
TTTCCTCCGCACCGTTCCCGACAACGGAAATTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTGTATTGCCGGTGCATAAAGGGCGTATTCA > minE/2809309‑2809440 | tttCCTCCGCACCGTTCCCGACAACGGAAATTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTct < 1:2106499‑M2/70‑3 (MQ=255) ttCCTCCGCACCGTTCCCGACAACGGAAATTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTctca < 1:2198089‑M2/71‑5 (MQ=255) tccGCACCGTTCCCGACAACGGAAATTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTctcat > 1:2520487‑M2/1‑63 (MQ=255) ccGCACCGTTCCCGACAACGGAAATTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATc > 1:1527422/1‑70 (MQ=255) ccGCACCGTTCCCGACAACGGAAATTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATc > 1:537937/1‑70 (MQ=255) ccGCACCGTTCCCGACAACGGAAATTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATc > 1:1407094/1‑70 (MQ=255) cGCACCGTTCCCGACAACGGAAATTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCa > 1:44051/1‑70 (MQ=255) cGCACCGTTCCCGACAACGGAAATTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCa > 1:1342896/1‑70 (MQ=255) gCACCGTTCCCTACAACGGAAATTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCaaa < 1:2529264/71‑1 (MQ=255) gCACCGTTCCCGACAACGGAAATTATGAGCATGACTTTGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCaaa < 1:3001547/71‑1 (MQ=255) gCACCGTTCCCGACAACGGAAATTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCaaa > 1:2231720/1‑71 (MQ=255) gCACCGTTCCCGACAACGGAAATTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCaaa < 1:2420456/71‑1 (MQ=255) cACCGTTCCCGACAACGGAAATTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTctcata > 1:2244036‑M2/1‑59 (MQ=255) cACCGTTCCCGACAACGGAAATTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTctcata > 1:2110685‑M2/1‑59 (MQ=255) cACCGTTCCCGACAACGGAAATTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAAt > 1:2830154/1‑71 (MQ=255) aCCGTTCCCGACAACGGAAATTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAAt < 1:455925/70‑1 (MQ=255) aCCGTTCCCGACAACGGAAATTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATc > 1:2462694/1‑71 (MQ=255) aCCGTTCCCGACAACGGAAATTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATc > 1:250223/1‑71 (MQ=255) aCCGTTCCCGACAACGGAAATTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATc > 1:254403/1‑71 (MQ=255) aCCGTTCCCGACAACGGAAATTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATc > 1:3722004/1‑71 (MQ=255) aCCGTTCCCGACAACGGAAATTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATc > 1:3551345/1‑71 (MQ=255) ccGTTCCCGACAACGGAAATTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATc > 1:3110457/1‑65 (MQ=255) ttCCCGACAACGGAAATTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTc > 1:904659/1‑70 (MQ=255) cGACAACGGAAATTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGc < 1:771963/71‑1 (MQ=255) aCAACGGAAATTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACAATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTg > 1:1053417/1‑71 (MQ=255) aCAACGGAAATTATGAGCATAACTATGAGGGAGCAGACGATATGCTTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTg < 1:800504/71‑1 (MQ=255) aCAACGAAAATTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTg > 1:3690025/1‑71 (MQ=255) cAACGGAAATTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTgg > 1:1994203/1‑71 (MQ=255) aaCGGAAATTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTggg < 1:2092093/71‑1 (MQ=255) aaCGGAAATTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTggg < 1:1977177/71‑1 (MQ=255) aaCGGAAATTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTggg < 1:269796/71‑1 (MQ=255) cGGAAATTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCaa > 1:1149683/1‑54 (MQ=255) ggAAATTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTggg > 1:3470085/1‑68 (MQ=255) ggAAATTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGa > 1:885540/1‑69 (MQ=255) ggAAATTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGa > 1:2863308/1‑69 (MQ=255) ggAAATTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGa > 1:3670238/1‑69 (MQ=255) aaTTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTg > 1:891888/1‑63 (MQ=255) aaTTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTg > 1:646156/1‑63 (MQ=255) aaTTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATc > 1:2916299/1‑71 (MQ=255) aaTTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATc > 1:599038/1‑71 (MQ=255) aTTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCg < 1:293810/71‑1 (MQ=255) aTTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCg < 1:725649/71‑1 (MQ=255) aTTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCg < 1:2992163/71‑1 (MQ=255) ttATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGc < 1:987909/71‑1 (MQ=255) tGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCtt < 1:3251425/70‑1 (MQ=255) tGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCtt < 1:1126716/70‑1 (MQ=255) aTGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTGTATTg > 1:1862494/1‑71 (MQ=255) aTGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTGTATTg > 1:3293621/1‑71 (MQ=255) tGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTGTATTGc < 1:2886988/71‑1 (MQ=255) gACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAAt > 1:3402249/1‑40 (MQ=255) gACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTGTATTGcc > 1:631483/1‑71 (MQ=255) aCTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCaaa < 1:1019672/38‑1 (MQ=255) aCTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCaaa < 1:2750326/38‑1 (MQ=255) cTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTGTATTGCCgg < 1:2869697/71‑1 (MQ=255) tGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTGTATTGCCGGTg > 1:1787336/1‑70 (MQ=255) tGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTGTATTGCCGGTGc < 1:3366063/71‑1 (MQ=255) gAGGGAGCAGACGATATGCCTTctcatagtcatgctcataatttccgttgtcgggaac > 1:2959207‑M2/1‑22 (MQ=255) aGGGAGCAGACGATATGCCTTctcatagtcatgctcataatttccg < 1:3122283‑M2/46‑26 (MQ=255) aGGGAGCAGACGATATGCCTTctcatagtcatgctcataatttccg < 1:3221249‑M2/46‑26 (MQ=255) aGGGAGCAGACGATATGCCTTctcatagtcatgctcataatttccg < 1:3275377‑M2/46‑26 (MQ=255) gggAGCAGACGATATGCCTTctcatagtcatgctcataatttccgttgtcgggatcgg < 1:2361572‑M2/58‑39 (MQ=255) gggAGCAGACGATATGCCTTctcatagtcatgctcataatttccgttgtcgggaacgg < 1:205980‑M2/58‑39 (MQ=255) gggAGCAGACGATATGCCTTctcatagacatgctcataatttc < 1:3720282‑M2/43‑24 (MQ=255) gggAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTGTATTGCCGGTGCATa < 1:3534039/71‑1 (MQ=255) ggAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTGTATTGCCGGTGCATaa < 1:1115577/71‑1 (MQ=255) gAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCt < 1:850497/40‑1 (MQ=255) gAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTGTATTGCCGGTGCATaaa < 1:878031/71‑1 (MQ=255) gAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTGTATTGCCGGTGCATaaa < 1:580069/71‑1 (MQ=255) aGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTGTATTGCCGGTGCATAAAg < 1:273115/71‑1 (MQ=255) aGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTGTATTGCCGGTGCATAAAg < 1:1963563/71‑1 (MQ=255) aGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTGTATTGCCGGTGCATAAAg < 1:3054162/71‑1 (MQ=255) gCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTGTATTGCCGGTGCATAAAgg < 1:1862476/71‑1 (MQ=255) gCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTGTATTGCCGGTGCATAAAgg < 1:1031315/71‑1 (MQ=255) gCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTGTATTGCCGGTGCATAAAgg < 1:3603935/71‑1 (MQ=255) gCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTGTATTGCCGGTGCATAAAg < 1:1202137/70‑1 (MQ=255) cAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTGTATTGCCGGTGCATAAAgg < 1:2048418/70‑1 (MQ=255) cAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTGTATTGCCGGTGCATAAAgg < 1:107443/70‑1 (MQ=255) cAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTGTATTGCCGGTGCATAAAgg < 1:83967/70‑1 (MQ=255) cAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTGTATTGCCGGTGCATAAAgg < 1:1364729/70‑1 (MQ=255) cAGACAATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTGTATTGCCGGTGCATAAAggg < 1:2456007/71‑1 (MQ=255) aCGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCtt < 1:2762067/47‑1 (MQ=255) cGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTGTATTGCCGGTGCATAAAGGGCGTa < 1:569976/71‑1 (MQ=255) gATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGaa > 1:2487053/1‑37 (MQ=255) gATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGaa > 1:395198/1‑37 (MQ=255) gATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTGTATTGCCGGTGCATAAAGGGCGTAt > 1:3438196/1‑71 (MQ=255) atatGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTGTATTGCCGGTGCAt < 1:2245428/59‑1 (MQ=255) atGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTg < 1:717413/43‑1 (MQ=255) atGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTg < 1:219616/43‑1 (MQ=255) atGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTg < 1:1320943/43‑1 (MQ=255) atGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTg < 1:2174356/43‑1 (MQ=255) atGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTg < 1:1469704/43‑1 (MQ=255) atGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTg < 1:3261639/43‑1 (MQ=255) atGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTGTATTGCCGGTGCATAAAGGGTGTATTc < 1:477558/70‑1 (MQ=255) tGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTGTATTGCCGGTGCATAAAGGGCGTATTCa < 1:966060/70‑1 (MQ=255) gCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTGTa > 1:2357508/1‑43 (MQ=255) ccTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTGTATTGCCGGTGCATAAAGGGCGTAt > 1:975530/1‑65 (MQ=255) ttCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTGTATTGcc < 1:1523551/45‑1 (MQ=255) ttCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTGTATTGcc < 1:1744319/45‑1 (MQ=255) ttCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTGTATTGCCGGTGCATAAAGGGCGt < 1:1952178/61‑1 (MQ=255) ttCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTGTATTGCCGGTGCATAAAGGGCGt < 1:2527789/61‑1 (MQ=255) | TTTCCTCCGCACCGTTCCCGACAACGGAAATTATGAGCATGACTATGAGGGAGCAGACGATATGCCTTCTCATATCAAATCCTCAATGCTGGGAACATCGCTTGTATTGCCGGTGCATAAAGGGCGTATTCA > minE/2809309‑2809440 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |