New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | minE | = 2844980 | 62 (1.050) | 4 (0.070) | 3/96 | NT | 6.3% | coding (676/978 nt) | poxA | predicted lysyl‑tRNA synthetase |
? | minE | = 2845032 | 61 (1.100) | coding (728/978 nt) | poxA | predicted lysyl‑tRNA synthetase |
TCACTGGCGCAAATCAGTACCGAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGAATTGACGGATGCCCGTGAGCAGCAACAACGCTTTGAACAAGATAA > minE/2844965‑2845101 | tCACTGGCGCAAATCAGTACCGAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATtg > 1:3588383‑M2/1‑68 (MQ=255) cACTGGCGCAAATCAGTACCGAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAg > 1:40148/1‑71 (MQ=255) gcgcAAATCAGTACCGAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTg < 1:599333/69‑1 (MQ=255) gcgcAAATCAGTACCGAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTg < 1:1182952/69‑1 (MQ=255) cgcAAATCAGTACCGAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCg < 1:2425502/71‑1 (MQ=255) cgcAAATCAGTACCGAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCg < 1:1110731/71‑1 (MQ=255) aaaTCAGTACCGAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAAt > 1:1182228/1‑71 (MQ=255) aaTCAGTACCGAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATg > 1:987678/1‑71 (MQ=255) aaTCAGTACCGAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATg < 1:3260072/71‑1 (MQ=255) cAGTACCGAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGtt > 1:2375773/1‑71 (MQ=255) cAGTACCGAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGtt > 1:1415781/1‑71 (MQ=255) ccGAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATtgatttgcgccagtgatgcc > 1:891189‑M2/1‑49 (MQ=255) ccGAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATtgatttgcgccagtgatgcc > 1:1434462‑M2/1‑49 (MQ=255) cGAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATg < 1:2232437/71‑1 (MQ=255) cGAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATg < 1:3288165/71‑1 (MQ=255) cGAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATg < 1:3620157/71‑1 (MQ=255) gAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATtgatttgcgccagtgatgcctg < 1:1618580‑M2/69‑23 (MQ=255) aaGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGaa > 1:3034821/1‑71 (MQ=255) aaGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGaa > 1:3036188/1‑71 (MQ=255) aGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGAAt < 1:3469325/71‑1 (MQ=255) gATCATTGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGc < 1:147769/53‑1 (MQ=255) catcGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGCGCTGGCGAATGGTTTCCATGAATTGa > 1:934691/1‑70 (MQ=255) catcGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTcc > 1:2520230/1‑61 (MQ=255) catcGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCAt > 1:2629849/1‑63 (MQ=255) catcGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCAt > 1:2515986/1‑63 (MQ=255) catcGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGaa > 1:112453/1‑66 (MQ=255) catcGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGAATTGAc > 1:1356791/1‑71 (MQ=255) atcGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGAATTGACg < 1:2738660/71‑1 (MQ=255) tcGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGAATTGACgg < 1:3234799/71‑1 (MQ=255) cGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGAATTGACgg < 1:218436/70‑1 (MQ=255) gTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTcc < 1:2290397/55‑1 (MQ=255) cTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATtgatttgcgccagtgatgcctggctggctggaaagtggta > 1:60989‑M2/1‑31 (MQ=255) cTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTg < 1:68578/38‑1 (MQ=255) cTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTg < 1:2699917/38‑1 (MQ=255) cTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGAATTGACGGATGCCCg < 1:70890/70‑1 (MQ=255) cTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGAATTGACGGATGCCCg < 1:2498917/70‑1 (MQ=255) cTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGAATTGACGGATGCCCGt < 1:3327355/71‑1 (MQ=255) gAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGAATTGACGGATGCCCGt > 1:2646206/1‑69 (MQ=255) aaCGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGc > 1:1174225/1‑37 (MQ=255) aaCGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGc > 1:1861072/1‑37 (MQ=255) aaCGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGc > 1:2953428/1‑37 (MQ=255) aaCGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGc > 1:2043224/1‑37 (MQ=255) aaCGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCAt < 1:1063438/50‑1 (MQ=255) aaCGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCAt < 1:2683263/50‑1 (MQ=255) aaCGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCAt < 1:960984/50‑1 (MQ=255) aaCGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCAt < 1:1004295/50‑1 (MQ=255) aaCGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCAt < 1:2991133/50‑1 (MQ=255) aaCGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGAATTGACGGATGCCCGt < 1:128856/68‑1 (MQ=255) aaCGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGATGGCGAATGGTTTCCATGAATTGACGGATGCCCGt > 1:755929/1‑68 (MQ=255) aCGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGAATTGACGGATGCCCGTGagc < 1:3113100/71‑1 (MQ=255) tGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGaa > 1:1604633/1‑46 (MQ=255) tGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGAATTGACGGATGCCCGTGAGCAGcaa > 1:2733502/1‑70 (MQ=255) tGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGAATTGACGGATGCCCGTGAGCAGcaa > 1:2291798/1‑70 (MQ=255) tGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGAATTGACGGATGCCCGTGAGCAGcaa > 1:2999022/1‑70 (MQ=255) tGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTCCCATGaa > 1:2892087/1‑46 (MQ=255) aGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGAATTGAc > 1:2873922/1‑49 (MQ=255) gTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGAATTGACGGATGCCCGTGAGCAGCAACAACg < 1:3236502/71‑1 (MQ=255) tttATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCAt < 1:2113454/38‑1 (MQ=255) tttATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGAATTGACg < 1:3105905/47‑1 (MQ=255) tttATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGAATTGACg < 1:1441951/47‑1 (MQ=255) ttattaTAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGAATTGACGGATGCCCGTGAGCAGCAACAACGCt > 1:848936/1‑71 (MQ=255) tattatAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGAATTGACGGATGCCCGTGAGCAGCAACAACGCt < 1:126528/70‑1 (MQ=255) attatAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGAATTGACGGATGCCCGTGAGCAGCAACAACGCtt < 1:1066767/70‑1 (MQ=255) attatAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGAATTGACGGATGCCCGTGAGCAGCAACAACGCtt < 1:1120206/70‑1 (MQ=255) attatAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGAATTGACGGATGCCCGTGAGCAGCAACAACGCtt < 1:3120801/70‑1 (MQ=255) taAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGAATTGACGGATGCCCGTGAGCAGCAACAACGCTTTGAAc < 1:43472/71‑1 (MQ=255) aaGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGAATTGACGGATGCCCGTGAGCAGCAACAACGCTTTGAAc > 1:1474234/1‑69 (MQ=255) aaGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGAATTGACGGATGCCCGTGAGCAGCAACAACGCTTTGAAc > 1:1628921/1‑69 (MQ=255) aGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGAATTGACGGATGCCCGTGAGCAGcaacaa > 1:880538/1‑58 (MQ=255) aGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGAATTGACGGATGCCCGTGAGCAGcaacaa > 1:1173002/1‑58 (MQ=255) aGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGAATTGACGGATGCCCGTGAGCAGCAACAACGCTTTGAAc > 1:2483140/1‑68 (MQ=255) ttGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGAATTGACGGATGCCCGTGAGCAGCAACAACGCTTTGAACAAGATaa < 1:2512235/70‑1 (MQ=255) | TCACTGGCGCAAATCAGTACCGAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGAATTGACGGATGCCCGTGAGCAGCAACAACGCTTTGAACAAGATAA > minE/2844965‑2845101 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |